MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 316

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022106	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022106	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022106	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022106	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022106	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022106	TA	3	6	11249	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022106	TA	3	6	13340	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022106	TA	4	8	13564	13571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022106	AG	3	6	17516	17521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022106	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022106	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022106	GA	3	6	20675	20680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022106	AG	3	6	21192	21197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022106	CT	3	6	21261	21266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022106	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022106	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022106	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022106	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022106	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022106	AT	3	6	36488	36493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022106	CT	3	6	38755	38760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022106	CT	3	6	40126	40131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022106	CT	3	6	42318	42323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022106	GA	5	10	42593	42602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022106	AG	3	6	42717	42722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022106	TC	3	6	43809	43814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022106	AG	3	6	48045	48050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022106	TG	4	8	51393	51400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022106	GA	3	6	55717	55722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022106	AG	4	8	64884	64891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022106	TA	3	6	85314	85319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022106	TC	3	6	90535	90540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022106	GA	3	6	90667	90672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022106	CT	3	6	93017	93022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022106	GA	3	6	93545	93550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022106	TA	3	6	94161	94166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022106	TC	3	6	100043	100048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022106	AT	3	6	100094	100099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022106	TA	3	6	106770	106775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022106	TG	3	6	116012	116017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022106	AG	4	8	118598	118605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022106	GA	3	6	120420	120425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022106	TA	3	6	122655	122660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022106	GT	3	6	123644	123649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022106	CT	3	6	128180	128185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022106	TC	3	6	130502	130507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022106	TG	3	6	133411	133416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022106	AG	3	6	138266	138271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022106	AT	3	6	142561	142566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022106	AG	3	6	157366	157371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022106	TC	3	6	171829	171834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022106	AG	3	6	171961	171966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022106	CT	3	6	171979	171984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022106	TG	3	6	178470	178475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022106	GA	3	6	183906	183911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022106	AT	3	6	192363	192368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022106	AG	3	6	196833	196838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022106	CT	3	6	203582	203587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022106	GA	4	8	206641	206648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022106	CT	4	8	206689	206696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022106	AG	4	8	217925	217932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022106	CA	3	6	217984	217989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022106	TA	3	6	219479	219484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022106	CT	3	6	221121	221126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022106	TC	3	6	224122	224127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022106	AG	3	6	224153	224158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022106	TC	3	6	238349	238354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022106	AG	3	6	238375	238380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022106	CA	3	6	243299	243304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022106	GT	3	6	243516	243521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022106	GA	3	6	250383	250388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022106	TG	3	6	250493	250498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022106	AG	3	6	251295	251300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022106	AG	3	6	251320	251325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022106	AG	3	6	252303	252308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022106	TA	3	6	254109	254114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022106	TC	3	6	256425	256430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022106	AG	3	6	257903	257908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022106	TA	3	6	264263	264268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022106	CA	3	6	266070	266075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022106	TA	3	6	273523	273528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022106	AT	4	8	284083	284090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022106	CT	3	6	284935	284940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022106	TC	4	8	285026	285033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022106	TC	3	6	286717	286722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022106	TC	3	6	286774	286779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022106	CT	3	6	287247	287252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022106	CA	3	6	301590	301595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022106	AC	3	6	301631	301636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022106	GA	3	6	306321	306326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022106	AG	3	6	315541	315546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022106	CT	3	6	347519	347524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022106	CT	3	6	350590	350595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022106	TC	3	6	354816	354821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022106	CT	3	6	358732	358737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022106	AC	3	6	362065	362070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022106	TA	3	6	364255	364260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022106	CT	4	8	381373	381380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022106	CG	3	6	391212	391217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022106	CA	3	6	392262	392267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022106	TC	3	6	394809	394814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022106	CT	3	6	395299	395304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022106	GA	3	6	395429	395434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022106	GA	3	6	395560	395565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022106	CT	3	6	410652	410657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022106	CT	3	6	429380	429385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022106	CT	3	6	430403	430408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022106	AG	3	6	430750	430755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022106	GA	3	6	432445	432450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022106	AC	3	6	436443	436448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022106	CT	3	6	440714	440719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022106	AC	3	6	440752	440757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022106	CA	3	6	443221	443226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022106	CT	3	6	444621	444626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022106	CT	3	6	453903	453908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022106	CT	3	6	456356	456361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022106	AG	3	6	460044	460049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022106	TC	3	6	466582	466587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022106	AT	3	6	466651	466656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022106	GA	4	8	468025	468032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022106	TA	3	6	468068	468073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022106	GA	3	6	468166	468171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022106	AC	3	6	485475	485480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022106	GA	4	8	485520	485527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022106	CA	3	6	485557	485562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022106	TC	3	6	485598	485603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022106	AC	3	6	490033	490038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022106	AG	3	6	490194	490199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022106	CT	3	6	490213	490218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022106	CT	3	6	493492	493497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022106	CT	3	6	494010	494015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022106	TG	3	6	494043	494048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022106	TA	3	6	494156	494161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022106	CT	4	8	499813	499820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022106	CT	4	8	502780	502787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022106	CA	3	6	507883	507888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022106	CT	3	6	508821	508826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022106	TA	3	6	514628	514633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022106	AG	3	6	516526	516531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022106	GA	3	6	517538	517543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022106	AG	3	6	517574	517579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022106	AT	3	6	523806	523811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022106	AC	3	6	534911	534916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_022106	CT	3	6	536828	536833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022106	TC	4	8	540352	540359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022106	AT	3	6	540405	540410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022106	TC	3	6	541121	541126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_022106	CT	3	6	557925	557930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022106	TC	3	6	558159	558164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022106	AG	3	6	560219	560224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022106	GA	3	6	561717	561722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022106	CT	3	6	564997	565002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_022106	AG	3	6	575051	575056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022106	CT	3	6	586255	586260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_022106	CA	3	6	596494	596499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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309	NC_022106	AG	3	6	1031873	1031878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
310	NC_022106	TC	3	6	1031958	1031963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
311	NC_022106	TG	3	6	1031970	1031975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
312	NC_022106	CT	3	6	1038224	1038229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
313	NC_022106	AG	3	6	1038238	1038243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
314	NC_022106	TA	3	6	1038834	1038839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_022106	AG	4	8	1039045	1039052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
316	NC_022106	GA	3	6	1042224	1042229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.