MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 2486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022106	AAT	2	6	203629	203634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022106	TAG	2	6	203665	203670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022106	AAT	2	6	203678	203683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022106	AAG	2	6	203776	203781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022106	CTT	2	6	203787	203792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_022106	GA	4	8	206641	206648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022106	T	7	7	206671	206677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022106	CT	4	8	206689	206696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_022106	A	6	6	206698	206703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022106	CCTT	2	8	215863	215870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_022106	TTG	2	6	215889	215894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022106	A	6	6	215901	215906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022106	A	7	7	217893	217899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022106	TAA	2	6	217900	217905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022106	AG	4	8	217925	217932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022106	A	6	6	217950	217955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022106	CA	3	6	217984	217989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_022106	TA	3	6	219479	219484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022106	GTC	2	6	219498	219503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_022106	CTAT	2	8	219553	219560	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_022106	T	6	6	219569	219574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022106	ATT	2	6	219671	219676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022106	TCT	2	6	219697	219702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_022106	GTC	2	6	219725	219730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_022106	TCC	2	6	219749	219754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_022106	ATG	2	6	219772	219777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022106	GCAA	2	8	219797	219804	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_022106	TTTTAC	2	12	220955	220966	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
529	NC_022106	A	8	8	221018	221025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022106	TAA	2	6	221073	221078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022106	ATTTC	2	10	221100	221109	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
532	NC_022106	CT	3	6	221121	221126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_022106	AATT	2	8	221133	221140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022106	CTTG	2	8	221482	221489	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
535	NC_022106	T	6	6	221537	221542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022106	TC	3	6	224122	224127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_022106	AG	3	6	224153	224158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022106	CAATA	2	10	224223	224232	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
539	NC_022106	TAA	2	6	225196	225201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022106	AAAC	2	8	225212	225219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_022106	T	8	8	227687	227694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022106	AGA	2	6	227885	227890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022106	AAC	2	6	234324	234329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_022106	AGA	2	6	234351	234356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022106	GAG	2	6	234368	234373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022106	GCT	2	6	234420	234425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_022106	ACC	2	6	234429	234434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_022106	A	6	6	234460	234465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022106	ACT	2	6	234524	234529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_022106	TGT	2	6	238329	238334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022106	TC	3	6	238349	238354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_022106	AG	3	6	238375	238380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022106	CA	3	6	243299	243304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_022106	AAAT	2	8	243448	243455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022106	AAGA	2	8	243467	243474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022106	GT	3	6	243516	243521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022106	T	6	6	243527	243532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022106	TAAA	2	8	246902	246909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022106	ATA	2	6	246924	246929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022106	TTA	2	6	246945	246950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022106	T	6	6	247901	247906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022106	TACAA	2	10	247930	247939	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
563	NC_022106	ATA	2	6	247962	247967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022106	GA	3	6	250383	250388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022106	ACT	2	6	250443	250448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_022106	TG	3	6	250493	250498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022106	AATA	2	8	250560	250567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022106	T	6	6	250582	250587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022106	T	7	7	250601	250607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022106	A	6	6	250609	250614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022106	TTG	2	6	250786	250791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022106	CTC	2	6	251206	251211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_022106	CAA	2	6	251250	251255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_022106	AG	3	6	251295	251300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_022106	A	8	8	251301	251308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022106	AG	3	6	251320	251325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022106	TCC	2	6	252158	252163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_022106	GAAA	2	8	252179	252186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022106	T	7	7	252200	252206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022106	GCAG	2	8	252228	252235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
581	NC_022106	AGAA	2	8	252261	252268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022106	AG	3	6	252303	252308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022106	TAT	2	6	252326	252331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022106	ACA	2	6	252367	252372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_022106	A	6	6	252416	252421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022106	AAC	2	6	253475	253480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_022106	A	6	6	253489	253494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022106	TAA	2	6	253540	253545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022106	A	8	8	254060	254067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022106	TA	3	6	254109	254114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022106	CCAA	2	8	254144	254151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_022106	A	7	7	254168	254174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022106	A	7	7	254609	254615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022106	ATA	2	6	254622	254627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022106	AACCCT	2	12	254668	254679	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_022106	AAAC	2	8	254751	254758	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
597	NC_022106	ATTTTT	2	12	255472	255483	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022106	GAG	2	6	255600	255605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022106	TAT	2	6	256304	256309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022106	ATA	2	6	256313	256318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022106	AAT	2	6	256337	256342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022106	A	8	8	256417	256424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022106	TC	3	6	256425	256430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_022106	TTG	2	6	257802	257807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022106	TTG	2	6	257863	257868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022106	ACT	2	6	257894	257899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_022106	AG	3	6	257903	257908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022106	GTC	2	6	259842	259847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_022106	CAG	2	6	259851	259856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_022106	TAG	2	6	263307	263312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022106	TTG	2	6	263784	263789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022106	TTTCA	2	10	264046	264055	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
613	NC_022106	A	8	8	264140	264147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022106	TAAA	2	8	264156	264163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022106	CTA	2	6	264246	264251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_022106	TA	3	6	264263	264268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022106	CAA	2	6	264273	264278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_022106	AGA	2	6	264345	264350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022106	A	6	6	264361	264366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022106	CA	3	6	266070	266075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_022106	T	6	6	267073	267078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022106	CAAA	2	8	267091	267098	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
623	NC_022106	A	6	6	267102	267107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_022106	A	7	7	267839	267845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022106	GAG	2	6	267864	267869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022106	AGT	2	6	268051	268056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022106	AGGAGA	2	12	270571	270582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022106	GAG	2	6	271168	271173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_022106	TCTA	2	8	273458	273465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
630	NC_022106	T	9	9	273489	273497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022106	CAG	2	6	273517	273522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_022106	TA	3	6	273523	273528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022106	ATTT	2	8	273604	273611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022106	CTT	2	6	276971	276976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_022106	GTTT	2	8	279446	279453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022106	ATATTA	2	12	279469	279480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_022106	AAAG	2	8	279481	279488	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022106	A	6	6	279536	279541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022106	T	6	6	279560	279565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022106	AGG	2	6	279571	279576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022106	AGG	2	6	279954	279959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_022106	A	6	6	281399	281404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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