MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum MB001

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022040	GAAATT	2	12	2087	2098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022040	GGTCTT	2	12	24751	24762	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022040	TCGCTT	2	12	50788	50799	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022040	TTGTGG	2	12	81139	81150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022040	TTGAGT	2	12	144625	144636	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022040	AAATAC	2	12	152981	152992	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022040	GGGGTG	2	12	192327	192338	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022040	CACTGG	2	12	223721	223732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022040	CGACGG	2	12	332974	332985	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022040	TTGCGT	2	12	333375	333386	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022040	ACTCCG	2	12	334029	334040	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022040	TTTCTG	2	12	346550	346561	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022040	TTCAAT	2	12	371743	371754	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022040	ATCACC	2	12	392186	392197	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022040	TGGGTT	2	12	511011	511022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022040	ACTTCA	2	12	532724	532735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022040	GAAGCG	2	12	543211	543222	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022040	GTAAAC	2	12	556575	556586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022040	CTGTTT	2	12	582315	582326	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022040	CTGCAG	2	12	613899	613910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022040	ACGACA	2	12	614151	614162	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022040	TTTCAT	2	12	630483	630494	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022040	CTGGTT	2	12	648002	648013	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022040	GAAAAA	2	12	669290	669301	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022040	TGGTCG	2	12	731292	731303	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022040	TATTGA	2	12	751507	751518	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022040	AGTCAA	2	12	787498	787509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022040	ATTTTC	2	12	791521	791532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022040	CTAGAC	2	12	808921	808932	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022040	TCTGAA	2	12	851376	851387	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022040	CTTTTT	2	12	858406	858417	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022040	TTGTGG	2	12	863526	863537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022040	TTTAAG	2	12	884305	884316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022040	TTCACA	2	12	884380	884391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022040	TAACAA	2	12	888334	888345	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022040	TTGCTT	2	12	900246	900257	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022040	CCTTGG	2	12	948650	948661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022040	GTGTGC	2	12	960464	960475	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022040	CCGGGC	2	12	987678	987689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022040	GAAAAC	2	12	1021090	1021101	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022040	AGTTCA	2	12	1090520	1090531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022040	GACAGG	2	12	1092825	1092836	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022040	CAAGGA	2	12	1100101	1100112	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022040	TTTGGG	2	12	1102682	1102693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022040	CACTGC	2	12	1106725	1106736	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022040	GATCAG	2	12	1142179	1142190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022040	AAGGAT	2	12	1212575	1212586	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022040	CCGGAA	2	12	1317186	1317197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022040	GGTCCT	2	12	1345397	1345408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022040	TTTGAA	2	12	1346612	1346623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022040	CGGTTT	2	12	1362691	1362702	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022040	TTATTG	2	12	1370438	1370449	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022040	GGTCTT	2	12	1385513	1385524	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022040	GGGGAT	2	12	1412708	1412719	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022040	TTTTCA	2	12	1412787	1412798	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022040	ATCTCA	2	12	1417386	1417397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022040	TTGGGG	2	12	1439027	1439038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022040	TTGTGG	2	12	1473813	1473824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022040	AACGAA	2	12	1650141	1650152	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022040	ATCTTC	2	12	1657360	1657371	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022040	TCACGG	2	12	1659159	1659170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022040	GTGCTT	2	12	1666061	1666072	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022040	AGTGTT	2	12	1707547	1707558	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022040	GTTATA	2	12	1795754	1795765	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022040	CTTTTG	2	12	1812700	1812711	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022040	TTTTTA	2	12	1853438	1853449	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022040	AAACCA	2	12	1855583	1855594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022040	CGTTTC	2	12	1916639	1916650	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022040	CTTTTT	2	12	2005254	2005265	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022040	GCCGAT	2	12	2028239	2028250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022040	CCGGAT	2	12	2042910	2042921	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022040	GGATAC	2	12	2078009	2078020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022040	TTTCGC	2	12	2112481	2112492	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022040	GACGCT	2	12	2125810	2125821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022040	CCGGCA	2	12	2126127	2126138	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022040	CTAAAG	2	12	2159283	2159294	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022040	AACTTG	2	12	2177319	2177330	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022040	CCGGGC	2	12	2183464	2183475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022040	GCCTAA	2	12	2185418	2185429	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022040	ACAGTG	2	12	2238878	2238889	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022040	CAAAAA	2	12	2272119	2272130	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022040	AAAACG	2	12	2313448	2313459	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022040	GGGAAA	2	12	2326342	2326353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022040	GGCGCC	2	12	2341701	2341712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022040	CGAGGT	2	12	2341817	2341828	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022040	CACAAA	2	12	2471799	2471810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022040	ACCACA	2	12	2472630	2472641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022040	CCAACA	2	12	2475581	2475592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022040	ACCACA	2	12	2481497	2481508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022040	CCAACA	2	12	2484448	2484459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022040	GTCGCG	2	12	2512228	2512239	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022040	GACCCC	2	12	2548641	2548652	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_022040	GCTGCA	2	12	2647620	2647631	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022040	TATTTT	2	12	2715021	2715032	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022040	CCACCT	2	12	2751567	2751578	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_022040	AGTTGC	2	12	2778556	2778567	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022040	GGGTTG	2	12	2799248	2799259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022040	CCCCGT	2	12	2815903	2815914	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_022040	GGTAAT	2	12	2824104	2824115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022040	AACTTA	2	12	2837664	2837675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022040	CCGATC	2	12	2897012	2897023	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022040	CACAAA	2	12	2915697	2915708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022040	ACCACA	2	12	2916524	2916535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022040	CCAACA	2	12	2919474	2919485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022040	ACCCTC	2	12	2925073	2925084	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_022040	CGCCGT	2	12	2940994	2941005	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022040	ATCTGA	2	12	2959131	2959142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.