MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum MB001

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022040	ATCCA	2	10	3523	3532	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_022040	AGTCG	2	10	21774	21783	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022040	AGTTC	2	10	40003	40012	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022040	TCAAA	2	10	53183	53192	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022040	TTAAT	2	10	58978	58987	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022040	CGCCC	2	10	66401	66410	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7	NC_022040	TCGTG	2	10	77668	77677	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022040	CGTCA	2	10	78004	78013	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_022040	GGGAG	2	10	79109	79118	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022040	GCTTT	2	10	80091	80100	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022040	GGAGT	2	10	87486	87495	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022040	AACCA	2	10	98523	98532	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_022040	ATGAA	2	10	107181	107190	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022040	TGCGC	2	10	107250	107259	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_022040	ATTTC	2	10	136666	136675	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022040	GGTGG	2	10	144674	144683	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022040	AAGGA	2	10	148021	148030	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022040	TGGTT	2	10	167476	167485	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022040	TGGTC	2	10	167548	167557	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022040	TTTCT	2	10	178211	178220	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022040	GCGCT	2	10	187775	187784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_022040	AGGGG	2	10	190619	190628	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022040	TGGGG	2	10	239658	239667	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022040	ATTTA	2	10	254035	254044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022040	GATTA	2	10	256327	256336	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022040	TGTGG	2	10	268137	268146	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022040	CGGGG	2	10	273316	273325	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022040	ATGAA	2	10	291648	291657	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022040	CCAGC	2	10	297501	297510	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_022040	TGGTT	2	10	311371	311380	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022040	GGGTG	2	10	352391	352400	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022040	ACTCA	2	10	359641	359650	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_022040	GGTTG	2	10	360528	360537	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022040	CAACA	2	10	377324	377333	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_022040	TAATT	2	10	381671	381680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022040	ACAAA	2	10	404396	404405	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022040	TACCC	2	10	415509	415518	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_022040	AGGTT	2	10	415549	415558	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022040	TGGTT	2	10	427919	427928	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022040	TGGTT	2	10	428273	428282	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022040	GTATC	2	10	438074	438083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022040	AAACC	2	10	447790	447799	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_022040	TGGGT	2	10	468881	468890	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022040	TGAAT	2	10	471018	471027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022040	AGGGG	2	10	471846	471855	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022040	GAAAA	2	10	479285	479294	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022040	CTTAA	2	10	479370	479379	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022040	TGAGC	2	10	482998	483007	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022040	GGGGT	2	10	510985	510994	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022040	CGTTG	2	10	512660	512669	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022040	CGTCA	2	10	522609	522618	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_022040	CAGGT	2	10	532930	532939	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022040	AACCT	2	10	549511	549520	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_022040	GGGAA	2	10	556711	556720	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022040	TTTGA	2	10	559548	559557	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022040	AAGTG	2	10	579435	579444	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022040	AAAGC	2	10	585724	585733	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022040	CTTTT	2	10	590587	590596	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022040	CAAGA	2	10	590629	590638	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022040	TTCTT	2	10	611126	611135	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_022040	CATGA	2	10	626616	626625	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022040	TTTCG	2	10	630451	630460	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022040	CTTTT	2	10	647664	647673	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022040	GTCTA	2	10	669260	669269	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022040	AACCA	2	10	673646	673655	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_022040	GTGTG	2	10	673989	673998	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022040	GGAAT	2	10	687437	687446	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022040	TTAGG	2	10	687860	687869	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022040	TCAGA	2	10	690972	690981	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022040	GACTC	2	10	704906	704915	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_022040	CAGAC	2	10	728691	728700	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_022040	TTCGT	2	10	838890	838899	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022040	GGAAT	2	10	841795	841804	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022040	CCACC	2	10	844344	844353	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
75	NC_022040	GGTGG	2	10	850539	850548	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022040	TGTGC	2	10	853963	853972	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022040	TAACC	2	10	854168	854177	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_022040	TTAGG	2	10	855320	855329	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022040	TCGTG	2	10	860060	860069	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022040	CGTCA	2	10	860396	860405	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_022040	GGGAG	2	10	861503	861512	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022040	GCTTT	2	10	862485	862494	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022040	CCACC	2	10	914093	914102	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
84	NC_022040	TTCGA	2	10	944915	944924	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022040	AAACC	2	10	945202	945211	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_022040	CAGGT	2	10	947810	947819	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022040	CGGCA	2	10	948635	948644	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_022040	CATGC	2	10	965342	965351	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_022040	CTGTG	2	10	965370	965379	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_022040	AGGTC	2	10	965386	965395	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022040	TCAGT	2	10	965664	965673	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022040	CAACC	2	10	985465	985474	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_022040	TTTGA	2	10	985521	985530	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022040	TCACA	2	10	1009830	1009839	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_022040	AAGGA	2	10	1016893	1016902	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022040	GAAAT	2	10	1036052	1036061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022040	CCAAA	2	10	1045859	1045868	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_022040	GGCGA	2	10	1047762	1047771	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022040	CCCAT	2	10	1049471	1049480	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_022040	GCTTT	2	10	1098663	1098672	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_022040	CAAAA	2	10	1137427	1137436	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_022040	TCCTT	2	10	1139737	1139746	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_022040	AAGTG	2	10	1142501	1142510	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022040	TTGTT	2	10	1146827	1146836	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022040	GCCGA	2	10	1184729	1184738	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_022040	CCGGG	2	10	1222642	1222651	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_022040	TTTTG	2	10	1245323	1245332	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022040	TGTTT	2	10	1248556	1248565	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022040	GAACT	2	10	1306068	1306077	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_022040	TGATC	2	10	1317727	1317736	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022040	GTGTT	2	10	1329263	1329272	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022040	GGCTT	2	10	1340970	1340979	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022040	GAGTG	2	10	1385462	1385471	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022040	TTCGC	2	10	1390261	1390270	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_022040	GTTTT	2	10	1400509	1400518	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022040	CAGAC	2	10	1402700	1402709	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_022040	GAATC	2	10	1413039	1413048	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_022040	CCAAA	2	10	1426715	1426724	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_022040	CAAGA	2	10	1438549	1438558	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_022040	CAATT	2	10	1440768	1440777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022040	TGCTG	2	10	1450604	1450613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022040	TCGTG	2	10	1470341	1470350	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_022040	CGTCA	2	10	1470677	1470686	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_022040	GGGAG	2	10	1471784	1471793	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022040	GCTTT	2	10	1472765	1472774	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022040	AACAG	2	10	1474327	1474336	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_022040	GTGTG	2	10	1474393	1474402	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022040	ATTTC	2	10	1474574	1474583	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_022040	TTAGG	2	10	1519359	1519368	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022040	GGGAG	2	10	1537748	1537757	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022040	TAAAC	2	10	1540366	1540375	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022040	TCGGT	2	10	1553924	1553933	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022040	GTCAG	2	10	1592548	1592557	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022040	GCACT	2	10	1610961	1610970	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_022040	GTGTC	2	10	1621557	1621566	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_022040	ATTCC	2	10	1639419	1639428	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_022040	GACCA	2	10	1646928	1646937	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_022040	TGGTT	2	10	1646983	1646992	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022040	CGTTC	2	10	1649839	1649848	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_022040	TTTTC	2	10	1649900	1649909	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022040	TGTTT	2	10	1666938	1666947	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022040	ATTCA	2	10	1694743	1694752	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022040	GACCA	2	10	1700854	1700863	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_022040	ACCGG	2	10	1701004	1701013	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_022040	ATAAA	2	10	1768033	1768042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022040	ACAAA	2	10	1771981	1771990	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_022040	TTTTC	2	10	1816753	1816762	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_022040	CCTTG	2	10	1826104	1826113	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_022040	GCCGT	2	10	1855742	1855751	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_022040	CTGCC	2	10	1874191	1874200	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
151	NC_022040	CACAC	2	10	1882309	1882318	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
152	NC_022040	TAGCT	2	10	1885701	1885710	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_022040	AAACC	2	10	1893631	1893640	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_022040	TGGTT	2	10	1893681	1893690	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022040	GTTTA	2	10	1893863	1893872	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_022040	TTAGG	2	10	1906466	1906475	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_022040	CAGAC	2	10	1942516	1942525	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_022040	CCTTC	2	10	1980039	1980048	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
162	NC_022040	AGCAA	2	10	1988478	1988487	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
163	NC_022040	GTCTG	2	10	1995650	1995659	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
164	NC_022040	CCACC	2	10	1999191	1999200	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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172	NC_022040	TGGTG	2	10	2145119	2145128	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022040	ATGGA	2	10	2146713	2146722	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_022040	CCTTT	2	10	2198255	2198264	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
179	NC_022040	CCCAC	2	10	2216484	2216493	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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182	NC_022040	CCTTA	2	10	2269933	2269942	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
183	NC_022040	CTCAG	2	10	2277107	2277116	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
184	NC_022040	GTACT	2	10	2279381	2279390	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_022040	CATCG	2	10	2341740	2341749	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
192	NC_022040	GTGAG	2	10	2352723	2352732	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_022040	CTCCC	2	10	2374713	2374722	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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198	NC_022040	CGTTA	2	10	2382042	2382051	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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234	NC_022040	TGGTT	2	10	2643526	2643535	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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237	NC_022040	CTTTG	2	10	2720035	2720044	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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242	NC_022040	GAATA	2	10	2768285	2768294	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_022040	TGTGG	2	10	2782755	2782764	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_022040	TTCAG	2	10	2797356	2797365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_022040	CAGAC	2	10	3000632	3000641	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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267	NC_022040	CAAGC	2	10	3019443	3019452	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_022040	GCTGC	2	10	3021518	3021527	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
269	NC_022040	TTTTG	2	10	3023650	3023659	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
270	NC_022040	TTCGC	2	10	3026216	3026225	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
271	NC_022040	CGGGC	2	10	3045177	3045186	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
272	NC_022040	CGAGT	2	10	3062122	3062131	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
273	NC_022040	ACGAT	2	10	3062368	3062377	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
274	NC_022040	AAACC	2	10	3071193	3071202	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.