MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021899	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021899	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021899	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021899	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021899	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021899	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021899	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021899	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021899	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021899	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021899	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021899	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021899	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021899	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021899	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021899	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021899	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021899	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021899	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021899	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021899	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021899	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021899	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021899	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021899	AG	3	6	42646	42651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021899	TC	3	6	43738	43743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021899	AG	3	6	47974	47979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021899	TG	3	6	51325	51330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021899	GA	3	6	55593	55598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021899	CT	3	6	56488	56493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021899	GT	3	6	56538	56543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021899	TG	3	6	57167	57172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021899	AG	4	8	64809	64816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021899	TA	3	6	69128	69133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021899	CT	3	6	71864	71869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021899	TA	3	6	85228	85233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021899	TC	3	6	90449	90454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021899	GA	3	6	90581	90586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021899	CT	3	6	92931	92936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021899	GA	3	6	93459	93464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021899	TA	3	6	94076	94081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021899	TC	3	6	99952	99957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021899	AT	3	6	100003	100008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021899	GC	3	6	102109	102114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021899	TA	3	6	106679	106684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021899	TG	3	6	115933	115938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021899	AG	4	8	118521	118528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021899	GA	3	6	120343	120348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021899	TA	3	6	122651	122656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021899	GT	3	6	123641	123646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021899	CT	3	6	128177	128182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021899	TC	3	6	130499	130504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021899	TG	3	6	133407	133412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021899	TG	3	6	137015	137020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021899	AG	3	6	138260	138265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021899	AT	3	6	142555	142560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021899	AG	3	6	157362	157367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021899	TC	3	6	171834	171839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021899	AG	3	6	171966	171971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021899	CT	3	6	171984	171989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021899	TG	3	6	178473	178478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021899	CT	3	6	178612	178617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021899	GA	3	6	179166	179171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021899	CT	3	6	179492	179497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021899	TA	3	6	183671	183676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021899	GA	3	6	183887	183892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021899	GA	3	6	184526	184531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021899	GA	3	6	184558	184563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021899	AG	3	6	188612	188617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021899	TC	3	6	188772	188777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021899	AT	3	6	189113	189118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021899	AG	3	6	192892	192897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021899	TC	3	6	195884	195889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021899	AG	3	6	197716	197721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021899	CT	3	6	197728	197733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021899	CT	3	6	199642	199647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021899	GA	4	8	202701	202708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021899	CT	4	8	202749	202756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021899	TA	3	6	204330	204335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021899	AG	3	6	214021	214026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021899	TA	3	6	215575	215580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021899	CT	3	6	217218	217223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021899	TC	3	6	220219	220224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021899	AG	3	6	220250	220255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021899	TC	3	6	234449	234454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021899	AG	3	6	234475	234480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021899	AC	3	6	239398	239403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021899	GA	3	6	246484	246489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021899	TG	3	6	246594	246599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021899	AG	3	6	247394	247399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021899	AG	3	6	248397	248402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021899	TA	3	6	250220	250225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021899	AG	3	6	252501	252506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021899	TC	3	6	252527	252532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021899	AG	3	6	254005	254010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021899	TA	3	6	260368	260373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021899	CA	3	6	262175	262180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021899	CT	3	6	264006	264011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021899	TC	3	6	264075	264080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021899	TA	3	6	269628	269633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021899	AT	4	8	280188	280195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021899	CT	3	6	281040	281045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021899	TC	4	8	281131	281138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021899	TC	3	6	282821	282826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021899	TC	3	6	282878	282883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021899	CT	3	6	283351	283356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021899	AT	3	6	295362	295367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021899	CA	3	6	297691	297696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021899	GA	3	6	302422	302427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021899	AG	3	6	311628	311633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021899	CT	3	6	343586	343591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021899	CT	3	6	346657	346662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021899	TC	3	6	350883	350888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021899	TC	3	6	354713	354718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021899	CT	3	6	354799	354804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021899	AC	3	6	358132	358137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021899	GA	3	6	360042	360047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021899	TC	3	6	360120	360125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021899	TA	3	6	360321	360326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021899	CT	4	8	377460	377467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021899	CG	3	6	387299	387304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021899	CA	3	6	388349	388354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021899	TC	3	6	390896	390901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021899	CT	3	6	391386	391391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021899	GA	3	6	391640	391645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021899	CT	3	6	406733	406738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021899	CT	3	6	425468	425473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021899	CT	3	6	426491	426496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021899	AG	3	6	426837	426842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021899	GA	3	6	428532	428537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021899	AC	3	6	432530	432535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021899	CT	3	6	436801	436806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021899	AC	3	6	436839	436844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021899	CA	3	6	439308	439313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021899	CT	3	6	440712	440717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021899	CT	3	6	449994	449999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021899	AG	3	6	456135	456140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021899	TC	3	6	462673	462678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021899	AT	3	6	462742	462747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021899	GA	4	8	464116	464123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021899	TA	3	6	464159	464164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021899	TC	3	6	475990	475995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021899	AC	3	6	481521	481526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021899	GA	4	8	481566	481573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021899	CA	3	6	481603	481608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021899	TC	3	6	481644	481649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021899	AC	3	6	486079	486084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021899	AG	3	6	486241	486246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021899	CT	3	6	486260	486265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021899	CT	3	6	489539	489544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021899	CT	3	6	490057	490062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021899	TG	3	6	490090	490095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021899	TA	3	6	490203	490208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021899	CT	4	8	495860	495867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.