MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 2677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021899	GCTG	2	8	178529	178536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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503	NC_021899	TCA	2	6	178552	178557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_021899	TTG	2	6	178569	178574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021899	CT	3	6	178612	178617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_021899	AGA	2	6	178645	178650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021899	CAA	2	6	178783	178788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021899	TTTC	2	8	178816	178823	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_021899	AGT	2	6	178855	178860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021899	GAT	2	6	178890	178895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021899	CTC	2	6	178910	178915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_021899	AAG	2	6	178939	178944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021899	AAG	2	6	178957	178962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021899	TGC	2	6	179025	179030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_021899	AGC	2	6	179065	179070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021899	GA	3	6	179166	179171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021899	ACT	2	6	179200	179205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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519	NC_021899	TTC	2	6	179245	179250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_021899	GAC	2	6	179267	179272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021899	TCA	2	6	179370	179375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_021899	GAT	2	6	179376	179381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021899	ATT	3	9	179450	179458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021899	CTG	3	9	179459	179467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021899	GGAAT	2	10	179474	179483	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021899	CT	3	6	179492	179497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_021899	TTGA	2	8	179548	179555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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529	NC_021899	TGA	3	9	179576	179584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021899	TGA	2	6	179610	179615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021899	GAG	2	6	179751	179756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021899	AGT	2	6	179762	179767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021899	GAT	2	6	179855	179860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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535	NC_021899	GCG	2	6	179890	179895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021899	TGA	2	6	179944	179949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021899	ATA	2	6	179963	179968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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539	NC_021899	TGA	2	6	181065	181070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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541	NC_021899	ACA	2	6	181222	181227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_021899	TCTA	2	8	181263	181270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_021899	GAA	2	6	181342	181347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021899	ATT	2	6	181378	181383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021899	AATT	2	8	181397	181404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_021899	T	8	8	182778	182785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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551	NC_021899	A	6	6	182804	182809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021899	ACT	2	6	183492	183497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021899	TAG	2	6	183526	183531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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557	NC_021899	GCA	2	6	183636	183641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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561	NC_021899	GA	3	6	183887	183892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021899	GTT	2	6	183898	183903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021899	GAG	2	6	183919	183924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021899	GAA	2	6	183939	183944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021899	TTG	2	6	183950	183955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_021899	ATA	2	6	184404	184409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_021899	GA	3	6	184558	184563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021899	AGA	2	6	184568	184573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_021899	T	6	6	186275	186280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_021899	AGT	2	6	188215	188220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021899	TTG	2	6	188223	188228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_021899	AAG	2	6	188527	188532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021899	AG	3	6	188612	188617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021899	ATTTGC	2	12	188708	188719	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
602	NC_021899	TTA	2	6	188720	188725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021899	AAG	2	6	188762	188767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021899	TC	3	6	188772	188777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_021899	GAG	2	6	188854	188859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021899	TCT	2	6	188869	188874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_021899	TATGC	2	10	188927	188936	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
608	NC_021899	GAA	2	6	189029	189034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021899	AAGAA	2	10	189092	189101	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021899	AT	3	6	189113	189118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021899	TGT	2	6	189127	189132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021899	AAG	2	6	189675	189680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021899	T	6	6	189725	189730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021899	ATT	2	6	189738	189743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021899	T	6	6	189754	189759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021899	TATGAA	3	18	191730	191747	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_021899	ATA	2	6	191819	191824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_021899	AGA	2	6	192783	192788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021899	A	7	7	192840	192846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021899	A	7	7	192870	192876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021899	AG	3	6	192892	192897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021899	AAT	2	6	192902	192907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021899	T	9	9	192922	192930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021899	T	6	6	192969	192974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021899	TAC	2	6	193013	193018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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632	NC_021899	A	8	8	195866	195873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021899	TC	3	6	195884	195889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_021899	CTT	2	6	195893	195898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_021899	A	6	6	197662	197667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021899	AG	3	6	197716	197721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021899	CT	3	6	197728	197733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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