MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 344

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021895	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021895	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021895	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021895	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021895	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021895	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021895	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021895	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021895	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021895	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021895	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021895	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021895	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021895	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021895	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021895	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021895	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021895	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021895	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021895	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021895	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021895	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021895	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021895	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021895	AG	3	6	42646	42651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021895	TC	3	6	43738	43743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021895	AG	3	6	47974	47979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021895	TG	3	6	51325	51330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021895	GA	3	6	55593	55598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021895	CT	3	6	56488	56493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021895	GT	3	6	56538	56543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021895	TG	3	6	57167	57172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021895	AG	4	8	64809	64816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021895	TA	3	6	69128	69133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021895	CT	3	6	71864	71869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021895	TA	3	6	85228	85233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021895	TC	3	6	90449	90454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021895	GA	3	6	90581	90586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021895	CT	3	6	92931	92936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021895	GA	3	6	93459	93464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021895	TA	3	6	94076	94081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021895	TC	3	6	99952	99957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021895	AT	3	6	100003	100008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021895	GC	3	6	102109	102114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021895	TA	3	6	106679	106684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021895	TG	3	6	115933	115938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021895	AG	4	8	118521	118528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021895	GA	3	6	120343	120348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021895	TA	3	6	122651	122656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021895	GT	3	6	123641	123646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021895	CT	3	6	128177	128182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021895	TC	3	6	130499	130504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021895	TG	3	6	133407	133412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021895	TG	3	6	137015	137020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021895	AG	3	6	138260	138265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021895	AT	3	6	142555	142560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021895	AG	3	6	157362	157367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021895	TC	3	6	171835	171840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021895	AG	3	6	171967	171972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021895	CT	3	6	171985	171990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021895	TG	3	6	178476	178481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021895	TA	3	6	180206	180211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021895	AG	3	6	180566	180571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021895	GA	3	6	183716	183721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021895	AG	3	6	183871	183876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021895	CA	3	6	183887	183892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021895	CT	3	6	188809	188814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021895	CT	3	6	189754	189759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021895	CT	3	6	189840	189845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021895	AT	3	6	190608	190613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021895	TA	3	6	192264	192269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021895	TC	3	6	192283	192288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021895	TG	3	6	193161	193166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021895	TC	3	6	195206	195211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021895	AT	3	6	195553	195558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021895	AG	3	6	200329	200334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021895	TC	3	6	203321	203326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021895	AG	3	6	205153	205158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021895	CT	3	6	207079	207084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021895	GA	4	8	210140	210147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021895	CT	4	8	210188	210195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021895	AG	3	6	221460	221465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021895	TA	3	6	223014	223019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021895	CT	3	6	224657	224662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021895	TC	3	6	227658	227663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021895	AG	3	6	227689	227694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021895	TC	3	6	241888	241893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021895	AG	3	6	241914	241919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021895	AC	3	6	246837	246842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021895	GA	3	6	253923	253928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021895	TG	3	6	254033	254038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021895	AG	3	6	254833	254838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021895	GA	3	6	255712	255717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021895	AG	3	6	255837	255842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021895	TA	3	6	257658	257663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021895	AG	3	6	259949	259954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021895	TC	3	6	259975	259980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021895	TA	3	6	267816	267821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021895	AG	3	6	267896	267901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021895	CA	3	6	269623	269628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021895	TC	3	6	271522	271527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021895	TA	3	6	277073	277078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021895	AT	4	8	287633	287640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021895	CT	3	6	288485	288490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021895	TC	4	8	288576	288583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021895	TC	3	6	290267	290272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021895	TC	3	6	290324	290329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021895	CT	3	6	290797	290802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021895	AT	3	6	302811	302816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021895	CA	3	6	305140	305145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021895	AC	3	6	305181	305186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021895	GA	3	6	309871	309876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021895	AG	3	6	319091	319096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021895	AG	3	6	319172	319177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021895	CT	3	6	351062	351067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021895	CT	3	6	354133	354138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021895	TC	3	6	358359	358364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021895	CT	3	6	362275	362280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021895	AC	3	6	365608	365613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021895	GA	3	6	367520	367525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021895	TA	3	6	367800	367805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021895	GC	3	6	369329	369334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021895	TC	3	6	369633	369638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021895	TA	3	6	369703	369708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021895	AC	3	6	370415	370420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021895	CT	4	8	370587	370594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021895	CT	3	6	370820	370825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021895	CA	3	6	370829	370834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021895	CT	4	8	384912	384919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021895	CG	3	6	394752	394757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021895	CA	3	6	395802	395807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021895	TC	3	6	398349	398354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021895	CT	3	6	398839	398844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021895	GA	3	6	399093	399098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021895	CT	3	6	414186	414191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021895	CT	3	6	432921	432926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021895	CT	3	6	433944	433949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021895	AG	3	6	434290	434295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021895	GA	3	6	435985	435990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021895	AC	3	6	439983	439988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021895	CT	3	6	444254	444259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021895	AC	3	6	444292	444297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021895	CA	3	6	446761	446766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021895	CT	3	6	448161	448166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021895	CT	3	6	457443	457448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021895	CT	3	6	459896	459901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021895	AG	3	6	463584	463589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021895	TC	3	6	470122	470127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021895	AT	3	6	470191	470196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021895	GA	4	8	471565	471572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021895	TA	3	6	471608	471613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021895	GA	3	6	471706	471711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021895	AC	3	6	489015	489020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021895	GA	4	8	489060	489067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.