MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 2820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021895	TG	3	6	178476	178481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021895	TTA	2	6	179994	179999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021895	CTG	2	6	180071	180076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_021895	CTG	2	6	180079	180084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021895	AGA	3	9	180113	180121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021895	T	7	7	180146	180152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021895	TCA	2	6	180184	180189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021895	TGTT	2	8	180196	180203	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021895	TA	3	6	180206	180211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021895	CCT	2	6	180294	180299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_021895	CAG	2	6	180345	180350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021895	TAG	2	6	180456	180461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021895	TTG	2	6	180467	180472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021895	CTC	2	6	180490	180495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_021895	AG	3	6	180566	180571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021895	ATT	2	6	180607	180612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021895	AAG	2	6	180619	180624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021895	TGA	2	6	180863	180868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021895	AGAGT	2	10	180871	180880	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021895	AGA	2	6	180928	180933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021895	AGG	2	6	180948	180953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021895	AAG	3	9	180954	180962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021895	TGA	2	6	181075	181080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021895	TTCC	2	8	181205	181212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_021895	ACA	2	6	181232	181237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021895	TGT	2	6	181273	181278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021895	AAAC	2	8	181308	181315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_021895	AGAAA	2	10	182595	182604	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021895	AAGA	2	8	182616	182623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021895	T	8	8	182640	182647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021895	AGAAAA	2	12	182658	182669	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021895	A	7	7	182666	182672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021895	TAG	2	6	183389	183394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021895	GCA	2	6	183444	183449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_021895	TCGC	2	8	183487	183494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
536	NC_021895	AGA	2	6	183498	183503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021895	GCA	2	6	183507	183512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_021895	GAA	2	6	183535	183540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021895	AGG	2	6	183551	183556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021895	AGA	2	6	183574	183579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021895	GA	3	6	183716	183721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021895	GTT	2	6	183727	183732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021895	GAG	2	6	183748	183753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021895	GAA	2	6	183768	183773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021895	TTG	2	6	183779	183784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021895	AGG	2	6	183818	183823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021895	AG	3	6	183871	183876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021895	CA	3	6	183887	183892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_021895	AGA	2	6	184002	184007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021895	GTT	4	12	184127	184138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021895	T	6	6	184144	184149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021895	T	6	6	184152	184157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021895	T	6	6	184163	184168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021895	T	7	7	184213	184219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021895	A	6	6	184235	184240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021895	T	6	6	184257	184262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021895	ATC	2	6	185946	185951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_021895	CGATA	2	10	185974	185983	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
559	NC_021895	T	6	6	185987	185992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021895	TCC	2	6	186007	186012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_021895	ACA	3	9	186013	186021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021895	AGT	2	6	186031	186036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021895	AAAC	2	8	186056	186063	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_021895	TGC	2	6	186122	186127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_021895	AGT	2	6	186190	186195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021895	AGT	2	6	186213	186218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021895	TTG	2	6	186221	186226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021895	TAT	2	6	186301	186306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021895	T	6	6	186320	186325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021895	GCA	2	6	186373	186378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021895	CTT	2	6	186388	186393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021895	GGAC	2	8	186415	186422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
573	NC_021895	AAG	2	6	186525	186530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021895	TTG	2	6	186547	186552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021895	CAT	2	6	186557	186562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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577	NC_021895	TAA	2	6	186674	186679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021895	TTG	2	6	186704	186709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021895	CTC	2	6	186778	186783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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581	NC_021895	ACA	2	6	186860	186865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_021895	TAC	2	6	186905	186910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021895	CAT	2	6	186921	186926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_021895	CCT	2	6	187134	187139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_021895	CTC	2	6	187159	187164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_021895	TTA	2	6	187183	187188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_021895	G	9	9	187225	187233	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021895	TCC	2	6	187259	187264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_021895	CAG	2	6	187267	187272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_021895	A	6	6	187286	187291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021895	AGA	2	6	187301	187306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021895	GAA	2	6	187307	187312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021895	GGA	2	6	187313	187318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021895	CTT	2	6	187321	187326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021895	AGA	2	6	187382	187387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021895	TAAA	2	8	187435	187442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021895	CAA	2	6	187515	187520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_021895	AGA	2	6	187543	187548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021895	CAT	2	6	187558	187563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_021895	GAA	2	6	187608	187613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021895	GAC	2	6	187622	187627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021895	ATC	2	6	187695	187700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021895	ATC	2	6	188797	188802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021895	CT	3	6	188809	188814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_021895	A	6	6	188863	188868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021895	TTC	2	6	188909	188914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_021895	AAAGT	2	10	188938	188947	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021895	CAA	2	6	188985	188990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021895	GTAA	2	8	189024	189031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021895	AAAG	2	8	189038	189045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021895	AGA	2	6	189049	189054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021895	A	6	6	189063	189068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021895	GAA	2	6	189119	189124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021895	AAGC	2	8	189144	189151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
616	NC_021895	GAT	2	6	189156	189161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021895	A	6	6	189217	189222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021895	TTG	2	6	189277	189282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021895	T	6	6	189301	189306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021895	TAG	2	6	189343	189348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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622	NC_021895	T	6	6	189377	189382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021895	TGC	2	6	189392	189397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021895	AGCA	2	8	189442	189449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_021895	TCT	2	6	189455	189460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_021895	GAA	2	6	189474	189479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021895	CTC	2	6	189523	189528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_021895	CTT	2	6	189604	189609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021895	GGA	2	6	189615	189620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021895	TTC	2	6	189621	189626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021895	GCA	2	6	189677	189682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_021895	CT	3	6	189754	189759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_021895	GCT	2	6	189774	189779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_021895	CTTT	2	8	189813	189820	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
635	NC_021895	A	7	7	189832	189838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021895	CT	3	6	189840	189845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_021895	ACTC	2	8	189881	189888	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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639	NC_021895	T	6	6	190018	190023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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