MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2/55

Total Repeats: 2663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021893	ACA	2	6	364499	364504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021893	TGA	2	6	364524	364529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021893	TCA	2	6	364578	364583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_021893	TAA	2	6	364584	364589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021893	A	6	6	364592	364597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021893	AAAAC	2	10	364643	364652	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1007	NC_021893	TAAA	2	8	364658	364665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021893	CTT	2	6	364727	364732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_021893	A	6	6	365522	365527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021893	AAG	2	6	365535	365540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021893	AAAT	2	8	365578	365585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021893	CCTT	2	8	365600	365607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_021893	ATCT	2	8	365633	365640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_021893	CTT	2	6	370501	370506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_021893	AGA	2	6	370523	370528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021893	TAAA	2	8	377412	377419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021893	A	6	6	377483	377488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021893	CT	4	8	377493	377500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_021893	TCA	2	6	377586	377591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_021893	T	6	6	379303	379308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021893	TTC	2	6	381361	381366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_021893	ATG	2	6	381387	381392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021893	A	7	7	381410	381416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021893	ATA	2	6	381421	381426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021893	CTT	2	6	381438	381443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021893	AGA	2	6	381457	381462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021893	T	8	8	381472	381479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021893	CAT	2	6	381961	381966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021893	A	8	8	383778	383785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021893	TTG	2	6	383815	383820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021893	CTT	2	6	385904	385909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_021893	T	6	6	387112	387117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021893	TAA	2	6	387326	387331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021893	CG	3	6	387332	387337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_021893	TTTA	2	8	387380	387387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021893	CTT	2	6	387417	387422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_021893	GTT	2	6	387467	387472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021893	GATT	2	8	388139	388146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021893	AATT	2	8	388188	388195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021893	A	7	7	388226	388232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021893	ATAA	2	8	388248	388255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021893	TGC	2	6	388280	388285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_021893	TTG	2	6	388331	388336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021893	GTA	2	6	388344	388349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021893	AAG	3	9	388357	388365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021893	CA	3	6	388382	388387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_021893	TC	3	6	390929	390934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_021893	CAA	2	6	390942	390947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_021893	AGG	2	6	390984	390989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021893	CTT	2	6	391397	391402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_021893	CTT	2	6	391410	391415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_021893	CT	3	6	391419	391424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_021893	GCAA	2	8	391627	391634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_021893	GA	3	6	391673	391678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021893	AAC	2	6	392634	392639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021893	CTT	2	6	392647	392652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_021893	CAG	2	6	392665	392670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_021893	CTT	2	6	393640	393645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_021893	AAG	2	6	393653	393658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021893	AAT	2	6	395290	395295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021893	A	8	8	399688	399695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021893	T	8	8	399723	399730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021893	CTA	2	6	399748	399753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_021893	TCC	2	6	400073	400078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_021893	A	6	6	400080	400085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021893	A	7	7	400103	400109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021893	AAGCG	2	10	400159	400168	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_021893	A	6	6	400832	400837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021893	TCT	2	6	400848	400853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_021893	TTC	2	6	400872	400877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_021893	GAA	2	6	400912	400917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021893	TCAT	2	8	400924	400931	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_021893	AGA	2	6	400993	400998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021893	GTT	2	6	402999	403004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021893	CCT	2	6	403005	403010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_021893	CAAA	2	8	403060	403067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_021893	A	6	6	403082	403087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021893	GAG	2	6	403122	403127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021893	A	6	6	403155	403160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021893	T	6	6	403197	403202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021893	T	6	6	403208	403213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021893	A	6	6	405377	405382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021893	A	8	8	405384	405391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021893	TTTTAA	2	12	405404	405415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021893	TAA	2	6	405459	405464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021893	A	6	6	405463	405468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021893	AAC	2	6	405477	405482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_021893	TAA	2	6	405509	405514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021893	TAA	2	6	405544	405549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021893	CT	3	6	406766	406771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_021893	TTA	2	6	408295	408300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021893	TAA	2	6	408317	408322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021893	AGA	2	6	408345	408350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021893	TTA	2	6	408384	408389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021893	TGA	2	6	408395	408400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021893	CCA	2	6	412346	412351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_021893	GCA	2	6	412400	412405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_021893	GTATA	2	10	412406	412415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021893	AGCAA	2	10	412442	412451	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_021893	ATTT	2	8	412477	412484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021893	AGAA	2	8	412487	412494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021893	A	6	6	414250	414255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021893	CAA	2	6	414269	414274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_021893	ATTA	2	8	414276	414283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021893	AAC	2	6	414285	414290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_021893	AAAAT	2	10	414291	414300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021893	A	7	7	414313	414319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021893	A	6	6	414358	414363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021893	T	8	8	419848	419855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021893	TGC	2	6	419859	419864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021893	TTC	2	6	419865	419870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021893	GAA	2	6	420684	420689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021893	A	7	7	420703	420709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021893	T	6	6	420712	420717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021893	TTA	2	6	420740	420745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021893	GTT	2	6	420749	420754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021893	ACTG	2	8	420775	420782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_021893	CTTT	2	8	420794	420801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_021893	ACC	2	6	420806	420811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_021893	CAA	2	6	422190	422195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021893	A	6	6	422194	422199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021893	GAT	2	6	422596	422601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021893	A	7	7	422634	422640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021893	GTAA	2	8	422671	422678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021893	ACATCA	2	12	422708	422719	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_021893	GAAA	2	8	422720	422727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021893	CTG	2	6	422780	422785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021893	AGG	2	6	422801	422806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021893	CGT	2	6	424281	424286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021893	TTCT	2	8	424339	424346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_021893	CTCTT	2	10	424360	424369	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1132	NC_021893	A	6	6	424401	424406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021893	T	7	7	424409	424415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021893	CT	3	6	425501	425506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_021893	A	6	6	425511	425516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021893	GAG	2	6	425519	425524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021893	T	6	6	425527	425532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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