MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021892	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021892	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021892	TC	3	6	1668	1673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021892	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021892	TA	3	6	11246	11251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021892	TA	3	6	13337	13342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021892	TA	4	8	13560	13567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021892	AG	3	6	17512	17517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021892	GA	3	6	17525	17530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021892	CT	3	6	18447	18452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021892	GA	3	6	20671	20676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021892	AG	3	6	21188	21193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021892	CT	3	6	21257	21262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021892	GA	3	6	26509	26514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021892	CT	3	6	26516	26521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021892	TC	3	6	27884	27889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021892	AG	3	6	27967	27972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021892	GA	3	6	36381	36386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021892	AT	3	6	36482	36487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021892	CT	3	6	38749	38754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021892	CT	3	6	40120	40125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021892	TC	3	6	43803	43808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021892	AG	3	6	48038	48043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021892	TG	4	8	51386	51393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021892	GA	3	6	55612	55617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021892	CT	3	6	56510	56515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021892	GT	3	6	56560	56565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021892	TG	3	6	57267	57272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021892	CT	3	6	58148	58153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021892	AG	4	8	64853	64860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021892	TA	3	6	69184	69189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021892	CT	3	6	71920	71925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021892	TA	3	6	85282	85287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021892	TC	3	6	90503	90508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021892	GA	3	6	90635	90640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021892	CT	3	6	92985	92990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021892	GA	3	6	93471	93476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021892	GA	3	6	93513	93518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021892	TA	3	6	94130	94135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021892	TC	3	6	100011	100016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021892	AT	3	6	100062	100067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021892	TA	3	6	106738	106743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021892	TG	3	6	115980	115985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021892	CA	3	6	117898	117903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021892	AG	4	8	118565	118572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021892	GA	3	6	120387	120392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021892	TA	3	6	122622	122627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021892	GT	3	6	123611	123616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021892	CT	3	6	128145	128150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021892	TC	3	6	130467	130472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021892	AG	3	6	130544	130549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021892	AG	3	6	130569	130574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021892	TG	3	6	133376	133381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021892	GA	3	6	138293	138298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021892	AT	3	6	142525	142530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021892	GA	3	6	151762	151767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021892	AG	3	6	152878	152883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021892	AG	3	6	153305	153310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021892	AG	3	6	157327	157332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021892	TC	3	6	171791	171796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021892	AG	3	6	171923	171928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021892	CT	3	6	171941	171946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021892	TG	3	6	178432	178437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021892	CT	3	6	178571	178576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021892	GA	3	6	179125	179130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021892	GA	3	6	184287	184292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021892	AT	3	6	191623	191628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021892	TA	3	6	191870	191875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021892	AG	4	8	192105	192112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021892	AG	3	6	192248	192253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021892	TC	3	6	192405	192410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021892	AT	3	6	192747	192752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021892	AG	3	6	197212	197217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021892	TC	3	6	200203	200208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021892	AG	3	6	202035	202040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021892	CT	3	6	202047	202052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021892	CT	3	6	203961	203966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021892	GA	4	8	207020	207027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021892	CT	4	8	207068	207075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021892	AG	4	8	218341	218348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021892	TA	3	6	219895	219900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021892	CT	3	6	221536	221541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021892	TC	3	6	224537	224542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021892	AG	3	6	224568	224573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021892	TC	3	6	238768	238773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021892	AG	3	6	238794	238799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021892	CA	3	6	243718	243723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021892	GT	3	6	243935	243940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021892	GA	3	6	250802	250807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021892	TG	3	6	250912	250917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021892	AG	3	6	251714	251719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021892	AG	3	6	252723	252728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021892	TA	3	6	254529	254534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021892	AG	3	6	256810	256815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021892	TC	3	6	256836	256841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021892	AG	3	6	258314	258319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021892	TA	3	6	264677	264682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021892	CA	3	6	266484	266489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021892	CT	3	6	268315	268320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021892	TC	3	6	268384	268389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021892	TA	3	6	273937	273942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021892	AT	4	8	284497	284504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021892	CT	3	6	285349	285354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021892	TC	4	8	285440	285447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021892	TC	3	6	287130	287135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021892	TC	3	6	287187	287192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021892	CT	3	6	287660	287665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021892	AT	3	6	299671	299676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021892	CA	3	6	302000	302005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021892	GA	3	6	306731	306736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021892	AG	3	6	315937	315942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021892	CT	3	6	347895	347900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021892	CT	3	6	350966	350971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021892	TC	3	6	355192	355197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021892	TC	3	6	359022	359027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021892	CT	3	6	359108	359113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021892	AC	3	6	362441	362446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021892	GA	3	6	364351	364356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021892	TC	3	6	364429	364434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021892	TA	3	6	364630	364635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021892	CT	4	8	381769	381776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021892	CG	3	6	391607	391612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021892	CA	3	6	392657	392662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021892	TC	3	6	395204	395209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021892	GA	3	6	395824	395829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021892	GA	3	6	395955	395960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021892	CT	3	6	411047	411052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021892	CT	3	6	429777	429782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021892	CT	3	6	430800	430805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021892	AG	3	6	431147	431152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021892	GA	3	6	432842	432847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021892	AC	3	6	436840	436845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021892	CT	3	6	441111	441116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021892	AC	3	6	441149	441154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021892	CA	3	6	443618	443623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021892	CT	3	6	445022	445027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021892	CT	3	6	454304	454309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021892	AG	3	6	460445	460450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021892	TC	3	6	466983	466988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021892	AT	3	6	467052	467057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021892	GA	4	8	468426	468433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021892	TA	3	6	468469	468474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021892	GA	3	6	468567	468572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021892	TC	3	6	480299	480304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021892	AC	3	6	485830	485835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021892	GA	4	8	485875	485882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021892	CA	3	6	485912	485917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021892	TC	3	6	485953	485958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021892	AC	3	6	490388	490393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021892	AG	3	6	490550	490555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021892	CT	3	6	490569	490574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021892	CT	3	6	493848	493853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021892	CT	3	6	494366	494371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021892	TG	3	6	494399	494404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.