MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 2813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2504	NC_021892	A	6	6	961471	961476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_021892	A	6	6	961500	961505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_021892	GAT	2	6	961521	961526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_021892	A	6	6	961536	961541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2513	NC_021892	T	6	6	966603	966608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2614	NC_021892	CTAGT	2	10	1006983	1006992	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2632	NC_021892	CAT	2	6	1012528	1012533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2634	NC_021892	T	6	6	1012695	1012700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_021892	CT	4	8	1012717	1012724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2636	NC_021892	T	7	7	1012729	1012735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2637	NC_021892	AAT	2	6	1012778	1012783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2775	NC_021892	A	6	6	1076478	1076483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2776	NC_021892	CT	3	6	1076491	1076496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2777	NC_021892	AG	3	6	1076505	1076510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2778	NC_021892	CAAA	2	8	1076530	1076537	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2780	NC_021892	A	6	6	1076558	1076563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2781	NC_021892	AAG	2	6	1076642	1076647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2785	NC_021892	A	6	6	1076702	1076707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2788	NC_021892	TAC	2	6	1076808	1076813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2802	NC_021892	GGAT	2	8	1080409	1080416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2803	NC_021892	TAA	3	9	1080445	1080453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2810	NC_021892	GTG	2	6	1080732	1080737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2813	NC_021892	TGGC	2	8	1080933	1080940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.