MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/953

Total Repeats: 2682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021889	A	6	6	364550	364555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1005	NC_021889	A	6	6	365479	365484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021889	AAG	2	6	365492	365497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021889	AAAT	2	8	365535	365542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021889	CCTT	2	8	365557	365564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_021889	ATCT	2	8	365590	365597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1011	NC_021889	AGA	2	6	370480	370485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021889	TAAA	2	8	377369	377376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021889	A	6	6	377440	377445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021889	CT	4	8	377450	377457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_021889	TCA	2	6	377543	377548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021889	T	6	6	379260	379265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1019	NC_021889	ATA	2	6	381378	381383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021889	CTT	2	6	381395	381400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_021889	AGA	2	6	381414	381419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021889	T	7	7	381429	381435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021889	CAT	2	6	381917	381922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021889	A	9	9	383734	383742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021889	TTG	2	6	383772	383777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1033	NC_021889	GATT	2	8	388095	388102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_021889	ATTA	2	8	414238	414245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021889	AAC	2	6	414247	414252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_021889	AAAAT	2	10	414253	414262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021889	A	7	7	414275	414281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021889	A	6	6	414320	414325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021889	T	8	8	419804	419811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021889	TGC	2	6	419815	419820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1111	NC_021889	A	8	8	420659	420666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021889	T	6	6	420669	420674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021889	GTT	2	6	420706	420711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021889	ACTG	2	8	420732	420739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_021889	CTTT	2	8	420751	420758	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1117	NC_021889	AGG	2	6	422758	422763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021889	CGT	2	6	424238	424243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021889	TTCT	2	8	424296	424303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_021889	CTCTT	2	10	424317	424326	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1121	NC_021889	A	6	6	424358	424363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021889	T	7	7	424366	424372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1124	NC_021889	A	6	6	425468	425473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021889	T	6	6	425484	425489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021889	CT	3	6	426481	426486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_021889	AACT	2	8	426528	426535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1130	NC_021889	A	7	7	426813	426819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021889	AG	3	6	426828	426833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021889	TAAAA	2	10	426860	426869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021889	CAAA	2	8	426876	426883	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_021889	A	7	7	426881	426887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021889	GA	3	6	428523	428528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_021889	ACTC	2	8	431567	431574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1138	NC_021889	A	8	8	431620	431627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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