MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 3011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021888	GA	4	8	489012	489019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021888	CA	3	6	489049	489054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_021888	TC	3	6	489090	489095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_021888	ACT	3	9	489107	489115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_021888	AAC	2	6	489121	489126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_021888	AGAA	2	8	489153	489160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021888	T	6	6	489170	489175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021888	T	6	6	489193	489198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021888	A	6	6	489222	489227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021888	A	6	6	489280	489285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021888	CAA	2	6	489363	489368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_021888	AAT	2	6	489372	489377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021888	GTT	2	6	489383	489388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021888	AACA	2	8	492750	492757	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_021888	A	7	7	492757	492763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021888	TAAA	2	8	492813	492820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021888	TTG	2	6	493457	493462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021888	AGA	2	6	493477	493482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021888	AC	3	6	493525	493530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_021888	AAC	2	6	493543	493548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_021888	ACT	2	6	493556	493561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021888	T	8	8	493587	493594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_021888	ACA	2	6	493616	493621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021888	TCT	2	6	493639	493644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_021888	A	7	7	493676	493682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021888	AG	3	6	493686	493691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021888	CT	3	6	493705	493710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1530	NC_021888	AAG	2	6	494711	494716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021888	A	9	9	494752	494760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1533	NC_021888	CAG	2	6	494795	494800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_021888	TTG	2	6	494852	494857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1536	NC_021888	ACT	2	6	496952	496957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1538	NC_021888	TGT	2	6	496995	497000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021888	TAG	2	6	497018	497023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1542	NC_021888	TG	3	6	497535	497540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021888	A	6	6	497547	497552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021888	TA	3	6	497648	497653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021888	CTT	2	6	499545	499550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_021888	CTA	2	6	499622	499627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_021888	CTG	2	6	499663	499668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1549	NC_021888	ACT	2	6	499719	499724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_021888	CT	4	8	503305	503312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_021888	AATCT	2	10	506293	506302	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1552	NC_021888	TGA	2	6	506305	506310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021888	ATTT	2	8	506340	506347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021888	TAACTA	2	12	506348	506359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1555	NC_021888	AAGAAA	2	12	506361	506372	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021888	TATT	2	8	507256	507263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021888	AAG	2	6	507281	507286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1560	NC_021888	TTTCT	2	10	511892	511901	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1561	NC_021888	CT	3	6	512312	512317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_021888	AGAATA	2	12	512335	512346	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_021888	TTTG	2	8	512349	512356	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021888	A	6	6	512413	512418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1570	NC_021888	A	9	9	512916	512924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021888	T	8	8	512926	512933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_021888	ACTA	2	8	517502	517509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_021888	TGT	2	6	517514	517519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1590	NC_021888	ATCT	2	8	518021	518028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_021888	AACA	2	8	518040	518047	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_021888	ACTA	2	8	518049	518056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_021888	TA	3	6	518055	518060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_021888	ATGAA	2	10	519865	519874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_021888	ATTC	2	8	519959	519966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1600	NC_021888	A	12	12	520020	520031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021888	CTG	2	6	520072	520077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1603	NC_021888	AAT	2	6	520718	520723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021888	AGCG	2	8	520826	520833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_021888	CAA	2	6	520882	520887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_021888	A	6	6	520886	520891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021888	TTA	2	6	520893	520898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021888	AAAT	2	8	520916	520923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021888	T	6	6	520952	520957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021888	GA	3	6	520965	520970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_021888	AG	3	6	521001	521006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_021888	ATA	2	6	521008	521013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021888	TACC	2	8	522822	522829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_021888	AGC	2	6	527199	527204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_021888	GAAG	2	8	527207	527214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_021888	AT	3	6	527233	527238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021888	AAAG	2	8	527246	527253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021888	A	7	7	527524	527530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_021888	TCA	2	6	527907	527912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_021888	A	7	7	527917	527923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021888	CTAA	2	8	527938	527945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_021888	AAT	2	6	527962	527967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021888	ACTT	2	8	527972	527979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_021888	GCT	2	6	528073	528078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1633	NC_021888	A	6	6	534540	534545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_021888	CAAA	2	8	534546	534553	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_021888	A	6	6	534569	534574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_021888	TGT	2	6	534609	534614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_021888	TTTA	2	8	534616	534623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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