MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2(s)/46

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021887	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021887	CAAAAA	2	12	6252	6263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021887	GAAAAG	2	12	56366	56377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021887	AGTTGT	2	12	57562	57573	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021887	CTTGTT	2	12	58619	58630	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021887	AAAAAT	2	12	60925	60936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021887	ATCTAG	2	12	76636	76647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021887	TTTTAG	2	12	115917	115928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021887	TAAAAA	2	12	120589	120600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021887	TTGGTA	2	12	120637	120648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021887	AGGATC	2	12	121016	121027	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021887	AGAAAA	2	12	182756	182767	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021887	ATTTGC	2	12	188668	188679	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021887	TATGAA	3	18	191690	191707	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021887	TTTTAC	2	12	217012	217023	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021887	TTTTTA	2	12	251544	251555	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021887	AGGAGA	2	12	266644	266655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021887	ATATTA	2	12	275540	275551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021887	AAAAAG	2	12	319713	319724	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021887	AGAATA	2	12	357205	357216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021887	TTTTAA	2	12	405366	405377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021887	ACATCA	2	12	422670	422681	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021887	TAACTA	2	12	498902	498913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021887	AAGAAA	2	12	498915	498926	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021887	AGAATA	2	12	504890	504901	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021887	AACTAA	2	12	510622	510633	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021887	TCCCTC	2	12	544646	544657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021887	AAAAAT	2	12	562616	562627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021887	TAGGGG	2	12	601784	601795	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021887	TCTTTT	2	12	613779	613790	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021887	TCTGCA	2	12	741429	741440	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021887	TATTTT	2	12	750906	750917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021887	GAGAAA	2	12	798379	798390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021887	TTTTCT	2	12	800837	800848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021887	ATTTTT	2	12	804616	804627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021887	TTTTTA	2	12	831096	831107	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021887	TAAGGA	2	12	852092	852103	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021887	CCGGAG	2	12	853010	853021	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021887	CCTCTA	2	12	866155	866166	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021887	TAAGGA	2	12	874136	874147	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021887	CCGGAG	2	12	875054	875065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021887	GACGGC	2	12	917473	917484	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021887	AAACAA	2	12	919161	919172	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021887	AATTTT	2	12	1038165	1038176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021887	TAAAAT	2	12	1038177	1038188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.