MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium terpenotabidum Y-11

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021663	CGCGAA	2	12	10852	10863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021663	CCCCGG	2	12	10986	10997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021663	GGACGG	2	12	31861	31872	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021663	ATGTGC	2	12	34845	34856	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021663	CGTGTC	2	12	40962	40973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021663	CGCGGG	2	12	52686	52697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021663	CAGGTC	2	12	53636	53647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021663	ATCCCG	2	12	54676	54687	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021663	GTGCAG	2	12	56124	56135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021663	TGGTCC	2	12	66204	66215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021663	AGCGAA	2	12	68938	68949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021663	TTGTGT	2	12	71323	71334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021663	CGTGTG	2	12	71734	71745	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021663	CGGTGA	2	12	83404	83415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021663	GTCCAG	2	12	83487	83498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021663	TGGACG	2	12	86930	86941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021663	TCTCCC	2	12	97780	97791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021663	GTCGCC	2	12	112469	112480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021663	CCCCGC	2	12	155549	155560	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
20	NC_021663	CACCGT	2	12	161061	161072	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021663	TGGTCC	2	12	195833	195844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021663	AGCGAA	2	12	198568	198579	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021663	TTGTGT	2	12	200953	200964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021663	CGTGTG	2	12	201377	201388	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021663	AGAGCA	2	12	227198	227209	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021663	TCTTTG	2	12	228606	228617	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021663	GCCGGT	2	12	245745	245756	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021663	CATGTG	2	12	282656	282667	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021663	GTGAGG	3	18	325307	325324	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021663	GGGGCT	2	12	396092	396103	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021663	GGTGTG	2	12	457937	457948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021663	CGTTTC	2	12	463722	463733	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021663	GGGTGG	2	12	485135	485146	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021663	CCGGTC	2	12	612694	612705	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021663	ACCGGT	2	12	617805	617816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021663	GGTAGA	2	12	620833	620844	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021663	CCCGTG	2	12	623575	623586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021663	TGGTCC	2	12	628559	628570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021663	AGCGAA	2	12	631295	631306	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021663	TTGTGT	2	12	633680	633691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021663	GTGCGT	3	18	635525	635542	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021663	GGCCCG	2	12	635696	635707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021663	CACTTC	2	12	679807	679818	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021663	GCGAGG	2	12	696902	696913	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021663	GGTCGG	2	12	713691	713702	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021663	TCGAAG	2	12	722393	722404	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021663	GCTGTG	2	12	747518	747529	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021663	GGCGGG	2	12	748849	748860	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021663	AGCTGC	2	12	769678	769689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021663	CCCCGG	2	12	772580	772591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021663	CCCGTC	2	12	792771	792782	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021663	CTGCGG	2	12	793907	793918	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021663	CGGCAG	2	12	808042	808053	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021663	TCGACG	2	12	811341	811352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021663	GCCCCG	2	12	861065	861076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021663	TGGTCC	2	12	922240	922251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021663	AGCGAA	2	12	924976	924987	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021663	TTGTGT	2	12	927361	927372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021663	GACCGG	2	12	955560	955571	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021663	GGGGGT	2	12	1005982	1005993	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021663	CGGGGC	2	12	1080751	1080762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021663	CAACCC	2	12	1097846	1097857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021663	CGACGG	2	12	1153321	1153332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021663	TGGTCC	2	12	1196832	1196843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021663	AGCGAA	2	12	1199568	1199579	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021663	TTGTGT	2	12	1201953	1201964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021663	CCCTGG	2	12	1219219	1219230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021663	GACTCG	2	12	1220255	1220266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021663	TGTCTG	2	12	1292898	1292909	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021663	GCGGGC	2	12	1316778	1316789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021663	TGGGTC	2	12	1347146	1347157	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021663	GGGTGG	2	12	1407806	1407817	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021663	ACCGTC	2	12	1421862	1421873	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021663	GCCGAC	2	12	1446847	1446858	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021663	GTCCCC	2	12	1462809	1462820	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021663	ACCGTC	2	12	1504662	1504673	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021663	GCACCG	2	12	1534295	1534306	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021663	GAACCG	2	12	1539048	1539059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021663	TCCCGG	2	12	1611895	1611906	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021663	TCCCCG	2	12	1615367	1615378	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_021663	CCCCGG	2	12	1682301	1682312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021663	CCGGCA	2	12	1684103	1684114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021663	TGTCGT	2	12	1729173	1729184	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021663	ACGGAT	2	12	1730960	1730971	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021663	TTGAAC	2	12	1797710	1797721	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021663	ACGCTT	2	12	1798081	1798092	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021663	TTGAAC	2	12	1804367	1804378	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021663	GGGGCC	2	12	1830101	1830112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021663	GGGGGA	2	12	1846620	1846631	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021663	TCCCCA	2	12	1948545	1948556	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021663	CATAAC	2	12	1957888	1957899	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021663	CCGCCC	2	12	2041625	2041636	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
93	NC_021663	CGCCAC	2	12	2118416	2118427	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021663	CGTCCA	2	12	2154816	2154827	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021663	CCCGCG	2	12	2172440	2172451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_021663	CTTCTC	2	12	2189593	2189604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021663	CTCACT	2	12	2209714	2209725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021663	GCTGCG	2	12	2216242	2216253	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021663	CTGGGG	2	12	2234542	2234553	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_021663	GTCCGG	2	12	2234617	2234628	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021663	CGCGGA	2	12	2274397	2274408	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021663	CCCTGT	2	12	2289039	2289050	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021663	CCACGG	2	12	2317539	2317550	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021663	CCCCGC	2	12	2336733	2336744	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
105	NC_021663	GATGGC	2	12	2350356	2350367	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021663	CTGCCC	2	12	2356752	2356763	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_021663	CCGGGT	2	12	2356938	2356949	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021663	CCGGTG	2	12	2393042	2393053	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021663	CCGCGC	2	12	2404175	2404186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_021663	GACGCG	2	12	2422175	2422186	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021663	TGGCGG	2	12	2492940	2492951	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021663	CGCACC	2	12	2517102	2517113	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021663	TCCGCA	2	12	2567744	2567755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021663	GACACC	2	12	2578744	2578755	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021663	GACGCC	2	12	2584373	2584384	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021663	CGCGGT	2	12	2584458	2584469	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021663	CGTGGG	2	12	2628514	2628525	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021663	GCCGAC	3	18	2672376	2672393	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021663	GAAACG	2	12	2680547	2680558	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021663	CAGCCA	2	12	2681755	2681766	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021663	CACCGG	2	12	2707700	2707711	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021663	GACCCG	2	12	2728363	2728374	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021663	GGGGAC	2	12	2741249	2741260	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.