MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021555	CTTT	2	8	12035	12042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021555	TGCC	2	8	14701	14708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021555	GTTT	2	8	24475	24482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021555	AAAT	2	8	30660	30667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021555	TCTT	2	8	31038	31045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021555	TAAT	2	8	35270	35277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021555	TGGT	2	8	35321	35328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021555	AATC	2	8	35744	35751	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021555	AAAG	2	8	35932	35939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021555	TTGG	2	8	35955	35962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021555	AAAG	2	8	36024	36031	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021555	CAGT	2	8	44752	44759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021555	TTTG	2	8	53475	53482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021555	AAAG	2	8	53756	53763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021555	CTTT	2	8	56513	56520	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021555	GGTT	2	8	56735	56742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021555	TCAG	2	8	62902	62909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021555	GTTT	2	8	65040	65047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021555	TTGG	2	8	65122	65129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021555	TAAT	2	8	65349	65356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021555	CAAA	2	8	65409	65416	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021555	TCCC	2	8	70941	70948	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_021555	GGAG	2	8	73521	73528	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021555	TCCC	2	8	74680	74687	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_021555	AGGC	2	8	76886	76893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021555	TGGT	2	8	77985	77992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021555	TTTG	2	8	78711	78718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021555	AGGG	2	8	79347	79354	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021555	TTAA	2	8	79796	79803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021555	CAAA	2	8	91766	91773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021555	AAGG	2	8	103848	103855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021555	TTGT	2	8	106531	106538	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021555	TCCT	2	8	108407	108414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021555	TTTG	2	8	108415	108422	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021555	CAAA	2	8	113016	113023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021555	TCAC	2	8	115143	115150	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021555	TCTT	2	8	116237	116244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021555	ATTG	2	8	121325	121332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021555	TTAC	2	8	121574	121581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021555	CTTT	2	8	121737	121744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021555	GAGC	2	8	129349	129356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021555	CTTT	2	8	148309	148316	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021555	TCCA	2	8	148956	148963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021555	GTCT	2	8	149008	149015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021555	AGTT	2	8	149741	149748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021555	GCAG	2	8	150256	150263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021555	CTTT	2	8	150286	150293	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021555	CCAC	2	8	150336	150343	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_021555	GTCT	2	8	150429	150436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021555	CCCA	2	8	151937	151944	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_021555	AGGT	2	8	152170	152177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021555	CTTT	2	8	152704	152711	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021555	TGGC	2	8	152845	152852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021555	ATTA	2	8	152993	153000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021555	TTTG	2	8	153188	153195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021555	ACTA	2	8	157113	157120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021555	TGAA	2	8	160028	160035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021555	CAAA	2	8	160107	160114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021555	GGTA	2	8	167313	167320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.