MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 7412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021487	TTAG	2	8	1357023	1357030	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_021487	TCT	2	6	1357802	1357807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_021487	CTTT	2	8	1360390	1360397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2504	NC_021487	CCT	2	6	1360400	1360405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_021487	TCC	2	6	1360412	1360417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_021487	T	6	6	1360468	1360473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_021487	ACC	2	6	1360483	1360488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_021487	TC	3	6	1362946	1362951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_021487	AAT	3	9	1362966	1362974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_021487	TAT	2	6	1362985	1362990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_021487	TAA	2	6	1363108	1363113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_021487	GAAC	2	8	1363116	1363123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2513	NC_021487	GC	3	6	1363125	1363130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_021487	GAC	2	6	1363139	1363144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_021487	GAG	2	6	1363165	1363170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_021487	TC	3	6	1363173	1363178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2517	NC_021487	AAAG	2	8	1364202	1364209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_021487	TC	3	6	1369419	1369424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2519	NC_021487	CCA	2	6	1369449	1369454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2520	NC_021487	TGCT	2	8	1369510	1369517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2521	NC_021487	CTA	2	6	1369526	1369531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_021487	TTC	2	6	1370241	1370246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_021487	CAA	2	6	1370267	1370272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_021487	CTG	2	6	1370283	1370288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_021487	CAC	2	6	1370299	1370304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2526	NC_021487	TCC	2	6	1371627	1371632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2527	NC_021487	TA	3	6	1371651	1371656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_021487	TA	3	6	1371666	1371671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_021487	AAG	2	6	1372029	1372034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_021487	T	6	6	1372038	1372043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_021487	AT	4	8	1372067	1372074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_021487	G	6	6	1377310	1377315	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_021487	CT	3	6	1377399	1377404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2534	NC_021487	GAG	2	6	1377492	1377497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_021487	GCTT	2	8	1380298	1380305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2536	NC_021487	TC	3	6	1380310	1380315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_021487	TTC	2	6	1380356	1380361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_021487	GA	4	8	1380374	1380381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_021487	TC	3	6	1381570	1381575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_021487	TTC	2	6	1381587	1381592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_021487	TTC	2	6	1381631	1381636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_021487	CGT	2	6	1381735	1381740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_021487	A	6	6	1381778	1381783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_021487	AGG	2	6	1381828	1381833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_021487	GCT	2	6	1382879	1382884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_021487	AAAG	2	8	1382900	1382907	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_021487	AGC	2	6	1382980	1382985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_021487	T	6	6	1399290	1399295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_021487	TGA	2	6	1399329	1399334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_021487	AGA	2	6	1399357	1399362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_021487	CCA	2	6	1403520	1403525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_021487	CTT	2	6	1403566	1403571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_021487	ACCGC	2	10	1403580	1403589	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2554	NC_021487	GAGG	2	8	1403819	1403826	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_021487	AGG	2	6	1403869	1403874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_021487	CCT	2	6	1404952	1404957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2557	NC_021487	GAC	2	6	1405835	1405840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_021487	T	7	7	1405848	1405854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_021487	GTT	2	6	1406929	1406934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_021487	AGG	2	6	1409648	1409653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_021487	CTG	2	6	1411511	1411516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_021487	T	6	6	1411565	1411570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_021487	AAT	2	6	1411617	1411622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_021487	AAC	2	6	1411650	1411655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_021487	TA	3	6	1411702	1411707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_021487	T	6	6	1411724	1411729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_021487	GAC	2	6	1411744	1411749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_021487	ATA	2	6	1413284	1413289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_021487	TAAC	2	8	1413295	1413302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2570	NC_021487	CT	3	6	1413304	1413309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2571	NC_021487	CT	3	6	1413420	1413425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2572	NC_021487	ACA	2	6	1413457	1413462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_021487	GGT	2	6	1413463	1413468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_021487	AGG	2	6	1413471	1413476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_021487	TCA	2	6	1413493	1413498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2577	NC_021487	T	6	6	1413971	1413976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_021487	CAA	2	6	1414002	1414007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_021487	GAA	2	6	1414030	1414035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_021487	CCT	2	6	1417821	1417826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_021487	TCC	2	6	1417941	1417946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2582	NC_021487	CACT	2	8	1418085	1418092	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2583	NC_021487	TTC	2	6	1418225	1418230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_021487	CT	3	6	1421725	1421730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2585	NC_021487	CGC	2	6	1424082	1424087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2586	NC_021487	CT	3	6	1424139	1424144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2587	NC_021487	AGG	2	6	1425476	1425481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_021487	CTC	2	6	1426533	1426538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2589	NC_021487	CT	3	6	1427575	1427580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2590	NC_021487	CTT	2	6	1427597	1427602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_021487	CTC	2	6	1428145	1428150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2592	NC_021487	TCCT	2	8	1431289	1431296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2593	NC_021487	GCT	2	6	1431321	1431326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_021487	GGC	2	6	1431387	1431392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_021487	GT	3	6	1431455	1431460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_021487	T	6	6	1431470	1431475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_021487	GCTC	2	8	1431478	1431485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2598	NC_021487	ATG	2	6	1433161	1433166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_021487	ATAC	2	8	1435688	1435695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2600	NC_021487	CTTCT	2	10	1435715	1435724	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2601	NC_021487	ACT	2	6	1438121	1438126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_021487	AGCC	2	8	1438147	1438154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2603	NC_021487	CAT	2	6	1438181	1438186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_021487	T	6	6	1438207	1438212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_021487	CAA	2	6	1438216	1438221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_021487	TAC	2	6	1438226	1438231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_021487	GAG	2	6	1438258	1438263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_021487	CTT	2	6	1440614	1440619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_021487	GTA	2	6	1440628	1440633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_021487	GCTT	2	8	1440659	1440666	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2611	NC_021487	CTT	2	6	1440674	1440679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_021487	GA	3	6	1440698	1440703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_021487	CAT	2	6	1440718	1440723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_021487	TTCA	2	8	1440734	1440741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_021487	AGT	2	6	1441340	1441345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_021487	ATATAA	2	12	1441350	1441361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_021487	GAA	2	6	1441389	1441394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_021487	GCA	2	6	1443341	1443346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_021487	TCC	2	6	1446518	1446523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2620	NC_021487	TCC	2	6	1446544	1446549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2621	NC_021487	TGTA	2	8	1446552	1446559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_021487	C	6	6	1447465	1447470	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2623	NC_021487	TTA	2	6	1447519	1447524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_021487	CGCAA	2	10	1447540	1447549	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2625	NC_021487	TCA	2	6	1447567	1447572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_021487	TGG	2	6	1447573	1447578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_021487	T	6	6	1447586	1447591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_021487	GCA	2	6	1447633	1447638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_021487	T	6	6	1447660	1447665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_021487	TTC	2	6	1447725	1447730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_021487	CTA	2	6	1447767	1447772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2633	NC_021487	GCG	2	6	1448689	1448694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2761	NC_021487	CAAG	2	8	1479082	1479089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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