MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 7412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021487	TGA	2	6	1118509	1118514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_021487	TCT	2	6	1118558	1118563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_021487	CGC	2	6	1118576	1118581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2004	NC_021487	TGA	2	6	1118650	1118655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_021487	CCT	2	6	1118704	1118709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2006	NC_021487	TCT	2	6	1118785	1118790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_021487	CCT	2	6	1118842	1118847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_021487	T	6	6	1118876	1118881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_021487	GAG	2	6	1118882	1118887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_021487	TCT	2	6	1118898	1118903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_021487	CCT	3	9	1118917	1118925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_021487	TGT	2	6	1118944	1118949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_021487	TCT	2	6	1118974	1118979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_021487	CTC	2	6	1119164	1119169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2015	NC_021487	GTC	2	6	1119257	1119262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_021487	CGC	2	6	1119267	1119272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2017	NC_021487	CGC	3	9	1119326	1119334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2018	NC_021487	TCT	2	6	1119349	1119354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2024	NC_021487	TCC	2	6	1119522	1119527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2062	NC_021487	CTT	2	6	1132638	1132643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2065	NC_021487	A	7	7	1132833	1132839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_021487	TGG	2	6	1132843	1132848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2100	NC_021487	GAA	2	6	1158148	1158153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_021487	CTTCG	2	10	1158235	1158244	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2102	NC_021487	AGCT	2	8	1158254	1158261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2103	NC_021487	GGA	2	6	1158345	1158350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2105	NC_021487	CTCTC	2	10	1161700	1161709	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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2113	NC_021487	TAAG	2	8	1164376	1164383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2114	NC_021487	CA	3	6	1164470	1164475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2115	NC_021487	A	6	6	1164501	1164506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2119	NC_021487	CCGA	2	8	1165958	1165965	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2126	NC_021487	CT	3	6	1170917	1170922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2127	NC_021487	CATCT	2	10	1170977	1170986	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2128	NC_021487	AG	3	6	1170990	1170995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_021487	CAG	2	6	1175270	1175275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2132	NC_021487	TCG	2	6	1175470	1175475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2251	NC_021487	A	7	7	1252466	1252472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_021487	ATAC	2	8	1252484	1252491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2262	NC_021487	AGGG	2	8	1252856	1252863	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2272	NC_021487	T	6	6	1253998	1254003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2390	NC_021487	ATCC	2	8	1305594	1305601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2391	NC_021487	AT	3	6	1305616	1305621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2392	NC_021487	CTT	2	6	1305703	1305708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2393	NC_021487	AC	3	6	1305785	1305790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2394	NC_021487	A	6	6	1305813	1305818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2395	NC_021487	AGA	2	6	1305829	1305834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2396	NC_021487	AGA	2	6	1305836	1305841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2397	NC_021487	TCC	2	6	1305883	1305888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2398	NC_021487	ATCC	2	8	1306000	1306007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2399	NC_021487	CTC	2	6	1306120	1306125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2400	NC_021487	CTA	2	6	1310355	1310360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2401	NC_021487	CCT	2	6	1310390	1310395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2402	NC_021487	GATC	2	8	1310400	1310407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2403	NC_021487	CTG	2	6	1310576	1310581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2405	NC_021487	AGGAC	2	10	1310772	1310781	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2441	NC_021487	GAAAG	2	10	1323294	1323303	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2442	NC_021487	GA	3	6	1323315	1323320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2443	NC_021487	CT	3	6	1323331	1323336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2455	NC_021487	TTC	2	6	1334084	1334089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2490	NC_021487	ATAGA	2	10	1353614	1353623	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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