MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 7412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021487	A	6	6	529848	529853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021487	GTC	2	6	532808	532813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021487	GAT	2	6	532821	532826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021487	CTC	2	6	533592	533597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_021487	ACG	2	6	533631	533636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_021487	TGTA	2	8	533674	533681	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021487	CT	3	6	533699	533704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_021487	CCT	2	6	533709	533714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_021487	TGA	2	6	536385	536390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021487	TCC	2	6	539726	539731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_021487	TATTCT	2	12	539769	539780	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1012	NC_021487	TTCA	2	8	539847	539854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_021487	TAT	2	6	539875	539880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021487	TAGA	2	8	539886	539893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021487	GCA	2	6	539928	539933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021487	GAG	2	6	541751	541756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021487	TCC	2	6	544939	544944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_021487	C	6	6	545629	545634	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1019	NC_021487	AGA	2	6	545704	545709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021487	ATGAA	2	10	545741	545750	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021487	TAA	2	6	545759	545764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021487	GAG	2	6	545814	545819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021487	CGG	2	6	546974	546979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021487	GGA	2	6	547098	547103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021487	GAA	2	6	547159	547164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021487	CAA	2	6	547193	547198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_021487	TCT	2	6	549485	549490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_021487	GGAAT	2	10	549513	549522	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021487	CCT	2	6	550356	550361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_021487	GTT	3	9	550386	550394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021487	GTTC	2	8	550409	550416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_021487	TAG	2	6	551625	551630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021487	T	6	6	551682	551687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021487	CCT	2	6	552855	552860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_021487	TTGAC	2	10	552895	552904	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_021487	GC	3	6	552959	552964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_021487	CATA	2	8	553009	553016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_021487	AGG	2	6	553049	553054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021487	GTT	2	6	553146	553151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021487	CGT	2	6	553209	553214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021487	AGG	2	6	553290	553295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021487	TTA	2	6	553348	553353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021487	CT	3	6	553408	553413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_021487	ACCTCT	2	12	553416	553427	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_021487	CCT	2	6	553436	553441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_021487	CGC	2	6	553449	553454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_021487	GCC	2	6	553459	553464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_021487	GT	3	6	553484	553489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021487	ATGA	2	8	553500	553507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021487	TCC	2	6	553513	553518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_021487	ACG	2	6	553569	553574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_021487	CTAG	2	8	553593	553600	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_021487	AG	3	6	553599	553604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021487	AGG	2	6	555207	555212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021487	A	6	6	555487	555492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021487	ACC	2	6	555504	555509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_021487	GA	3	6	555614	555619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021487	AGC	2	6	556372	556377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_021487	A	6	6	556432	556437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021487	CCCT	2	8	562140	562147	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1061	NC_021487	CT	3	6	564251	564256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_021487	C	6	6	564266	564271	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1063	NC_021487	CCTC	2	8	565095	565102	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1064	NC_021487	AAC	2	6	565189	565194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021487	AGA	2	6	565255	565260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021487	CTTTGC	2	12	565307	565318	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_021487	CCAT	2	8	565390	565397	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_021487	ATT	2	6	565399	565404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021487	GAA	2	6	565437	565442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021487	GCT	2	6	565456	565461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_021487	CAG	2	6	566706	566711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_021487	GCTAGA	2	12	566725	566736	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1073	NC_021487	TTG	2	6	567524	567529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021487	AGC	2	6	567870	567875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_021487	CAT	2	6	567877	567882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_021487	TAA	2	6	569074	569079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021487	AG	3	6	569095	569100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021487	CT	3	6	569113	569118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1080	NC_021487	TGT	2	6	572477	572482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021487	ATG	2	6	572497	572502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021487	CAG	2	6	572508	572513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_021487	ACC	2	6	572529	572534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_021487	TAT	2	6	572544	572549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1086	NC_021487	AGTG	2	8	573778	573785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021487	CT	3	6	573856	573861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_021487	CCG	2	6	573864	573869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_021487	GCT	2	6	573881	573886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021487	TCT	2	6	573902	573907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_021487	GA	3	6	574060	574065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021487	GCA	2	6	574076	574081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021487	TCTGC	2	10	574121	574130	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1094	NC_021487	TTG	2	6	574149	574154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021487	A	6	6	574737	574742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021487	CAA	2	6	574837	574842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_021487	CGT	2	6	577340	577345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_021487	GAA	2	6	577788	577793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021487	TCT	2	6	579044	579049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021487	ACG	2	6	580782	580787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_021487	GAGATA	2	12	580796	580807	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021487	TC	3	6	582543	582548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_021487	AG	3	6	582565	582570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021487	AGG	2	6	582581	582586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021487	AGA	2	6	585046	585051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021487	AGCT	2	8	585960	585967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_021487	TTA	2	6	585994	585999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021487	ACCTC	2	10	586880	586889	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1109	NC_021487	CTCC	2	8	586906	586913	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1110	NC_021487	AT	3	6	586940	586945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021487	CTC	2	6	586986	586991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_021487	CTG	2	6	587015	587020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021487	CTTT	2	8	587021	587028	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_021487	CTA	2	6	587470	587475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_021487	CTCC	2	8	589191	589198	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1116	NC_021487	TTG	2	6	589201	589206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021487	GGGA	2	8	589207	589214	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021487	T	7	7	589216	589222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021487	CCT	2	6	590049	590054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_021487	ACCA	2	8	590102	590109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_021487	GATC	2	8	590166	590173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_021487	TCA	2	6	590214	590219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021487	GCCTTC	2	12	590241	590252	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_021487	CTG	2	6	590258	590263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_021487	CAA	2	6	590265	590270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_021487	TG	3	6	590290	590295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021487	TTC	2	6	590329	590334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021487	AT	3	6	590359	590364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021487	GACA	2	8	590420	590427	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_021487	TC	3	6	590441	590446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_021487	TAT	2	6	590933	590938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021487	ATG	2	6	590981	590986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021487	CTC	2	6	591036	591041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_021487	AGG	2	6	591062	591067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_021487	GGC	2	6	591110	591115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1273	NC_021487	CT	3	6	656027	656032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1406	NC_021487	A	6	6	782921	782926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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