MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 7412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021487	TA	3	6	2428149	2428154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021487	ATTTC	2	10	2428160	2428169	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5003	NC_021487	AGGGT	2	10	2433154	2433163	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021487	CT	3	6	2433195	2433200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_021487	GTGAA	2	10	2433201	2433210	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021487	GA	3	6	2437051	2437056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021487	CAC	2	6	2438205	2438210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_021487	CTC	2	6	2438213	2438218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_021487	CAA	2	6	2438307	2438312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_021487	GC	3	6	2438349	2438354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_021487	AG	3	6	2438482	2438487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021487	TGC	2	6	2440072	2440077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_021487	GCA	2	6	2440093	2440098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_021487	CAA	2	6	2440118	2440123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_021487	TGA	2	6	2442340	2442345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021487	AG	3	6	2442350	2442355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021487	GTT	2	6	2442370	2442375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021487	TC	3	6	2443677	2443682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_021487	AGC	2	6	2444598	2444603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_021487	AGG	2	6	2444641	2444646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021487	AGG	2	6	2444686	2444691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021487	GAC	2	6	2447977	2447982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_021487	CTGC	2	8	2447990	2447997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_021487	TCC	2	6	2448005	2448010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_021487	AAT	2	6	2448093	2448098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021487	GA	3	6	2448131	2448136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021487	CT	3	6	2448152	2448157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_021487	CTT	2	6	2448966	2448971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_021487	ATCT	2	8	2449024	2449031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_021487	AGG	2	6	2449063	2449068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021487	AAC	2	6	2449131	2449136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_021487	GGA	2	6	2449146	2449151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021487	GAA	2	6	2451613	2451618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021487	CCA	2	6	2453207	2453212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_021487	GAA	2	6	2453801	2453806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021487	T	6	6	2455277	2455282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021487	TGG	2	6	2456972	2456977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021487	TAGA	2	8	2457006	2457013	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021487	AG	3	6	2457034	2457039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021487	CT	3	6	2457056	2457061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_021487	TCT	2	6	2457074	2457079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_021487	T	7	7	2457079	2457085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021487	GAA	2	6	2457105	2457110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021487	CTT	2	6	2457118	2457123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_021487	CT	3	6	2457173	2457178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_021487	GGC	2	6	2458633	2458638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_021487	GAGAG	2	10	2459331	2459340	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021487	AG	4	8	2459337	2459344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021487	T	7	7	2459348	2459354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021487	GCTCT	2	10	2462224	2462233	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5051	NC_021487	AAG	2	6	2462258	2462263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021487	CGGCT	2	10	2462279	2462288	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5053	NC_021487	GCCG	2	8	2462298	2462305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_021487	GGA	2	6	2462334	2462339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021487	AG	4	8	2462349	2462356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021487	AAC	2	6	2462447	2462452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_021487	GC	3	6	2462461	2462466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_021487	TCC	2	6	2462468	2462473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_021487	GC	3	6	2462474	2462479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_021487	GGCG	2	8	2463421	2463428	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_021487	GCG	2	6	2463452	2463457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_021487	GGC	2	6	2463461	2463466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_021487	CGG	2	6	2463490	2463495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_021487	TCTT	2	8	2463640	2463647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_021487	TGT	2	6	2463705	2463710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021487	GGA	2	6	2463723	2463728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021487	TC	3	6	2463787	2463792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_021487	CGG	2	6	2463855	2463860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_021487	CAA	2	6	2463898	2463903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_021487	TGC	2	6	2463924	2463929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_021487	CTG	2	6	2463958	2463963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_021487	CTT	2	6	2463988	2463993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_021487	GC	3	6	2464039	2464044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_021487	AG	3	6	2464154	2464159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021487	TGC	2	6	2464185	2464190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_021487	CAA	2	6	2464344	2464349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_021487	GCA	2	6	2467348	2467353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_021487	TGGA	2	8	2467368	2467375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021487	A	8	8	2467430	2467437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021487	CAA	2	6	2467460	2467465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_021487	AGG	2	6	2467467	2467472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_021487	GAG	2	6	2469680	2469685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021487	AGC	2	6	2469977	2469982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_021487	GAG	2	6	2471674	2471679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021487	TGCC	2	8	2472196	2472203	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_021487	GGCA	2	8	2472217	2472224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_021487	GCT	2	6	2472785	2472790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_021487	GCG	2	6	2472809	2472814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_021487	CGC	2	6	2472875	2472880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_021487	TCC	2	6	2473473	2473478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_021487	CCT	2	6	2475350	2475355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_021487	A	7	7	2475393	2475399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021487	GTTC	2	8	2475459	2475466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_021487	T	6	6	2475511	2475516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021487	TAGA	2	8	2475554	2475561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021487	CTAT	2	8	2475609	2475616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_021487	TGC	2	6	2475659	2475664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_021487	TGG	2	6	2475692	2475697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021487	GA	3	6	2476427	2476432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021487	GA	3	6	2476509	2476514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021487	AGGG	2	8	2476520	2476527	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021487	GTT	2	6	2476728	2476733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021487	GAG	2	6	2476755	2476760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021487	CT	3	6	2479549	2479554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_021487	GGA	2	6	2481227	2481232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021487	A	6	6	2481294	2481299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021487	TAA	2	6	2481326	2481331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_021487	AAGG	2	8	2481347	2481354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021487	AATCC	2	10	2481431	2481440	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5110	NC_021487	CT	3	6	2481541	2481546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_021487	AG	3	6	2481557	2481562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021487	AAG	2	6	2481564	2481569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021487	AC	3	6	2481579	2481584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_021487	AGC	2	6	2481585	2481590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_021487	GGA	2	6	2481607	2481612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021487	ACA	2	6	2481616	2481621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_021487	A	6	6	2482533	2482538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021487	GGA	2	6	2482551	2482556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021487	GTA	2	6	2482854	2482859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021487	GCA	2	6	2485652	2485657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_021487	CA	3	6	2485656	2485661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_021487	GCG	2	6	2486520	2486525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_021487	TATT	2	8	2486541	2486548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021487	AT	3	6	2486553	2486558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021487	TGG	2	6	2486562	2486567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021487	ATT	2	6	2486636	2486641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021487	CCT	2	6	2486677	2486682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_021487	TG	3	6	2486794	2486799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021487	AAAAT	2	10	2486843	2486852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021487	GT	3	6	2486854	2486859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021487	G	6	6	2486908	2486913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021487	TTC	2	6	2486934	2486939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_021487	GGT	2	6	2486955	2486960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_021487	AGT	2	6	2487050	2487055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5266	NC_021487	TCC	2	6	2560091	2560096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5267	NC_021487	GGC	2	6	2560108	2560113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5268	NC_021487	CTC	3	9	2565575	2565583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5269	NC_021487	TC	3	6	2565808	2565813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5270	NC_021487	A	6	6	2565825	2565830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5277	NC_021487	TTCGGC	2	12	2567997	2568008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5285	NC_021487	T	6	6	2574607	2574612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5286	NC_021487	TC	4	8	2575590	2575597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5292	NC_021487	TCC	2	6	2576857	2576862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5390	NC_021487	CCCCT	2	10	2621305	2621314	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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