MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium pasteurianum BC1

Total Repeats: 32126

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021182	AC	3	6	170185	170190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_021182	CCT	2	6	170327	170332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_021182	ACT	2	6	170359	170364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021182	GTT	2	6	170373	170378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021182	GA	3	6	170403	170408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021182	AGTAA	2	10	170455	170464	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021182	AAT	2	6	170465	170470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021182	TAAT	2	8	170490	170497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021182	TAA	2	6	170507	170512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021182	GAA	2	6	170621	170626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021182	TA	3	6	170743	170748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021182	GGA	2	6	170785	170790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021182	AGAA	2	8	170793	170800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021182	TAG	2	6	170814	170819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021182	GCGA	2	8	170822	170829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_021182	ACC	2	6	171021	171026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_021182	TG	3	6	171157	171162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021182	ACG	2	6	171163	171168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_021182	GCA	2	6	171204	171209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_021182	GGA	2	6	171336	171341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021182	ACA	2	6	171499	171504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021182	ATC	2	6	171602	171607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021182	TAAGT	2	10	171626	171635	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021182	AGC	2	6	171682	171687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_021182	ACC	2	6	171761	171766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_021182	GAGT	2	8	171848	171855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021182	ACC	2	6	172004	172009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_021182	GA	3	6	172022	172027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021182	AGGT	2	8	172219	172226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021182	GAG	2	6	172227	172232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021182	GAA	2	6	172251	172256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021182	GTT	2	6	172259	172264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021182	CGG	2	6	172475	172480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_021182	CAA	2	6	172569	172574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_021182	TGCT	2	8	172607	172614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_021182	GCG	2	6	172712	172717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_021182	GCT	2	6	172721	172726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_021182	GTC	2	6	172732	172737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_021182	ACC	2	6	172746	172751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_021182	A	6	6	172839	172844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021182	CG	3	6	172887	172892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_021182	ACAA	2	8	172928	172935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_021182	GGT	2	6	172970	172975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021182	TCG	2	6	173085	173090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_021182	CGT	2	6	173165	173170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_021182	GAG	2	6	173214	173219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021182	GGGAT	2	10	173304	173313	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021182	AGATT	2	10	173350	173359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021182	GCA	2	6	173424	173429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_021182	CTGA	2	8	173440	173447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_021182	TAAA	2	8	173478	173485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021182	ATATT	2	10	173511	173520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021182	AT	3	6	173588	173593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021182	T	7	7	173737	173743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021182	T	6	6	173893	173898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021182	TA	3	6	173906	173911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021182	AAAT	2	8	173933	173940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021182	TA	3	6	173945	173950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021182	A	7	7	173978	173984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021182	TAAA	2	8	174021	174028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021182	TTA	2	6	175381	175386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021182	CAA	2	6	175415	175420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021182	A	6	6	175450	175455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021182	TAG	2	6	175476	175481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021182	ATAA	2	8	175574	175581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021182	ATT	2	6	175601	175606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021182	T	6	6	175642	175647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021182	ATTAAA	2	12	175648	175659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021182	TAT	2	6	175668	175673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021182	ATA	2	6	175685	175690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021182	A	6	6	175693	175698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021182	TAA	2	6	175700	175705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021182	AAT	2	6	175734	175739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021182	AT	3	6	175768	175773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_021182	AAT	2	6	175798	175803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_021182	TAA	2	6	175833	175838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_021182	ATT	2	6	175840	175845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_021182	TTG	2	6	175899	175904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_021182	GGT	2	6	175921	175926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021182	A	6	6	177940	177945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021182	ATT	2	6	177984	177989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021182	AAAT	2	8	178001	178008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021182	AATATT	2	12	178014	178025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_021182	TA	3	6	178081	178086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_021182	TTA	2	6	178105	178110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021182	TAAAAT	2	12	178128	178139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021182	A	6	6	178140	178145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021182	TA	3	6	178156	178161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_021182	AATC	2	8	178179	178186	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_021182	AT	3	6	178188	178193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021182	A	6	6	178455	178460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021182	TA	3	6	178484	178489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021182	TTTA	2	8	178514	178521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021182	TAT	2	6	178528	178533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021182	AAAAT	2	10	178549	178558	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021182	TAT	2	6	178582	178587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021182	ACC	2	6	179347	179352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_021182	TA	3	6	179358	179363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021182	ATAATT	2	12	179383	179394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_021182	AAC	2	6	179396	179401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_021182	TA	3	6	179423	179428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021182	TAA	2	6	179448	179453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021182	TAT	2	6	179480	179485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021182	ATC	2	6	179523	179528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_021182	GTT	2	6	179556	179561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021182	ATTAT	2	10	179588	179597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021182	A	6	6	179609	179614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021182	ATT	2	6	179624	179629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021182	ATATA	2	10	179641	179650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021182	TTC	2	6	179758	179763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_021182	GGC	2	6	179840	179845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_021182	CGAG	2	8	179865	179872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_021182	GCG	2	6	179890	179895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_021182	ATA	2	6	179968	179973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021182	CGA	2	6	180070	180075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_021182	GCA	2	6	180144	180149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_021182	GCA	2	6	180184	180189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_021182	CGC	2	6	180191	180196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_021182	GTGA	2	8	180197	180204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_021182	AGG	2	6	180260	180265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021182	CAG	2	6	180287	180292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_021182	GAA	2	6	180479	180484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021182	GGC	2	6	180498	180503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_021182	AGG	2	6	180602	180607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021182	AGC	2	6	180707	180712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_021182	GAA	2	6	180742	180747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021182	GGT	2	6	180815	180820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_021182	GTC	2	6	180829	180834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_021182	TCGTG	2	10	180838	180847	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1630	NC_021182	GGA	2	6	180941	180946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_021182	ATC	2	6	180965	180970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1633	NC_021182	AAC	2	6	181014	181019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_021182	AC	3	6	181160	181165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_021182	CCT	2	6	181302	181307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1636	NC_021182	ACT	2	6	181334	181339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_021182	GA	3	6	181378	181383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1917	NC_021182	GTA	2	6	216335	216340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1918	NC_021182	AATA	2	8	216359	216366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1919	NC_021182	AT	3	6	217414	217419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1920	NC_021182	ACT	2	6	217452	217457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1921	NC_021182	CATG	2	8	217506	217513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1922	NC_021182	TAAA	2	8	217521	217528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_021182	TA	4	8	217529	217536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1924	NC_021182	AT	3	6	217545	217550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1925	NC_021182	T	7	7	217562	217568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1926	NC_021182	AAAT	2	8	218116	218123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1927	NC_021182	ATT	2	6	218151	218156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1928	NC_021182	ACCT	2	8	218171	218178	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1929	NC_021182	TTTTTA	2	12	218179	218190	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1930	NC_021182	TAT	2	6	219471	219476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1931	NC_021182	CTTT	2	8	219504	219511	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1932	NC_021182	TTA	2	6	219512	219517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_021182	TCC	2	6	220222	220227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1934	NC_021182	AAT	2	6	220231	220236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_021182	T	6	6	220236	220241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_021182	A	6	6	220283	220288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1937	NC_021182	T	6	6	221452	221457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1938	NC_021182	A	7	7	221464	221470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1939	NC_021182	GCT	2	6	221492	221497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1941	NC_021182	ATT	2	6	221523	221528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1942	NC_021182	AAAT	2	8	221532	221539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1943	NC_021182	TAA	2	6	221549	221554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1944	NC_021182	TA	3	6	221558	221563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_021182	TCT	2	6	221576	221581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1946	NC_021182	CCG	2	6	221648	221653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1948	NC_021182	TAC	2	6	221744	221749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1950	NC_021182	AACAA	2	10	221780	221789	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1951	NC_021182	CAATTG	2	12	221866	221877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1952	NC_021182	TAA	2	6	221882	221887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_021182	TA	3	6	221894	221899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_021182	TAA	2	6	221924	221929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1955	NC_021182	ATA	2	6	221959	221964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1956	NC_021182	AAAT	2	8	221983	221990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1957	NC_021182	TGTA	2	8	222026	222033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_021182	GGA	2	6	222036	222041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1959	NC_021182	T	6	6	222653	222658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1960	NC_021182	AGGTA	2	10	222659	222668	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1961	NC_021182	AATA	2	8	222685	222692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1962	NC_021182	TAAAA	2	10	222698	222707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1964	NC_021182	TAT	2	6	222714	222719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_021182	AGGTG	2	10	223486	223495	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1966	NC_021182	ATG	2	6	225488	225493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1967	NC_021182	T	8	8	225505	225512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1968	NC_021182	TATAA	2	10	225514	225523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1969	NC_021182	AATA	2	8	225543	225550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1970	NC_021182	ATAA	2	8	225623	225630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1971	NC_021182	AAT	2	6	225635	225640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1972	NC_021182	TA	3	6	225652	225657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1973	NC_021182	A	6	6	225684	225689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1974	NC_021182	ATTT	2	8	225972	225979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1975	NC_021182	AT	3	6	225980	225985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1976	NC_021182	TA	3	6	225996	226001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1977	NC_021182	A	7	7	226004	226010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1978	NC_021182	A	6	6	226049	226054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1979	NC_021182	A	6	6	226080	226085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1980	NC_021182	CAA	2	6	226086	226091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1981	NC_021182	ATATA	2	10	226120	226129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1982	NC_021182	TAA	2	6	226140	226145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1983	NC_021182	A	7	7	226144	226150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1984	NC_021182	AT	3	6	227446	227451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1985	NC_021182	TA	3	6	227452	227457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1986	NC_021182	AAT	2	6	227460	227465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1987	NC_021182	A	8	8	227476	227483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1988	NC_021182	T	7	7	227512	227518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1989	NC_021182	ATA	2	6	227519	227524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1990	NC_021182	TTA	2	6	227530	227535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1997	NC_021182	A	6	6	228301	228306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_021182	ACC	2	6	228498	228503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1999	NC_021182	TATAA	2	10	228531	228540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_021182	A	9	9	228577	228585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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