MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Moranella endobia PCVAL

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021057	TATTTA	2	12	12529	12540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021057	GGCAAT	2	12	13172	13183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021057	AATACT	2	12	18770	18781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021057	AGCTTC	2	12	23824	23835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021057	CTAAAA	2	12	23842	23853	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021057	AGTCGC	2	12	55778	55789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021057	AGCTAG	2	12	57803	57814	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021057	AATATC	2	12	59784	59795	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021057	GCATAA	2	12	62829	62840	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021057	TTTATG	2	12	66651	66662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021057	GGCGGA	2	12	67348	67359	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021057	AGTGCA	2	12	70125	70136	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021057	TTTAAT	2	12	94080	94091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021057	TTAGCA	2	12	109143	109154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021057	GTATGC	2	12	109228	109239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021057	TGAAAT	2	12	111362	111373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021057	AGCAAA	2	12	112332	112343	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021057	ATTAGC	2	12	120341	120352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021057	TAACTA	2	12	124640	124651	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021057	TTTAGT	2	12	124802	124813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021057	TGTAGA	2	12	125204	125215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021057	CTAGGA	2	12	128787	128798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021057	TATATG	2	12	130766	130777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021057	CTGCGG	2	12	133020	133031	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021057	CAGTAA	2	12	133139	133150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021057	GCAAAC	2	12	135292	135303	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021057	ATTAAT	2	12	140194	140205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021057	GTACCA	2	12	140988	140999	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021057	AATATT	2	12	144436	144447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021057	AGGTAA	2	12	150858	150869	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021057	TGTTAC	2	12	155871	155882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021057	GTTACT	2	12	156113	156124	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021057	TAATCT	2	12	156361	156372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021057	CAGCTA	2	12	157284	157295	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021057	TTGCTG	2	12	159118	159129	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021057	GAAGCT	2	12	170608	170619	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021057	TTTTAC	2	12	184257	184268	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021057	TACTTC	2	12	192962	192973	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021057	TTATCA	2	12	201383	201394	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021057	GATGGT	2	12	209898	209909	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021057	TAGTGG	2	12	209921	209932	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021057	ATTTTT	2	12	210028	210039	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021057	GTAATA	2	12	210063	210074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021057	ATTAAG	2	12	218987	218998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021057	GATAAT	2	12	223364	223375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021057	CCCTGG	2	12	223468	223479	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021057	TAGCTG	2	12	229378	229389	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021057	AGAACT	2	12	244281	244292	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021057	CATCTA	2	12	246489	246500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021057	TTTGGT	2	12	266404	266415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021057	AGTACC	2	12	279831	279842	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021057	TTCAAT	2	12	281315	281326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021057	GTCAGT	2	12	283347	283358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021057	AGTAAA	2	12	287560	287571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021057	GGATAA	2	12	291064	291075	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021057	ACAGTA	2	12	304087	304098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021057	CTTTTA	2	12	306547	306558	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021057	AATGGT	2	12	332556	332567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021057	CAAGAA	2	12	332610	332621	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021057	ATCGTA	2	12	332930	332941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021057	CTTTTG	2	12	344461	344472	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021057	ATTTCA	2	12	345433	345444	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021057	ATGCTA	2	12	347651	347662	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021057	TATTTA	2	12	358557	358568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021057	AATTTT	2	12	361819	361830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021057	TAAAAT	2	12	363981	363992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021057	TTATAT	2	12	365320	365331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021057	CATACT	2	12	370620	370631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021057	TAACAA	2	12	383011	383022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021057	TTAACC	2	12	402853	402864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021057	TTAACA	2	12	421471	421482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021057	TATAGG	2	12	431625	431636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021057	CATAAA	2	12	443195	443206	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021057	GTAAAA	2	12	444201	444212	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021057	TGTAAT	2	12	461844	461855	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021057	GCCACC	2	12	474116	474127	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_021057	GAAAAC	2	12	486513	486524	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021057	AAAAAT	2	12	495678	495689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021057	CGCACC	2	12	515824	515835	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.