MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 2512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021050	CGT	2	6	394149	394154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021050	T	7	7	394154	394160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021050	CTTGC	2	10	394180	394189	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1004	NC_021050	GATA	2	8	394204	394211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021050	AAG	2	6	396942	396947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021050	ACT	2	6	396957	396962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021050	T	6	6	396968	396973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021050	AGT	2	6	396993	396998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021050	TCTA	2	8	398863	398870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_021050	ATCTAG	2	12	398881	398892	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1011	NC_021050	A	6	6	398903	398908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021050	AAAAG	2	10	398930	398939	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021050	CTT	2	6	398962	398967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_021050	ATCAA	2	10	400628	400637	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_021050	A	6	6	400671	400676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021050	GAG	3	9	400722	400730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021050	A	8	8	400885	400892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021050	A	6	6	400902	400907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021050	A	7	7	400910	400916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021050	TTA	2	6	401456	401461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021050	T	7	7	401485	401491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021050	T	6	6	401563	401568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021050	T	6	6	401588	401593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021050	GTTT	2	8	401637	401644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021050	CAT	2	6	401656	401661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021050	TAG	2	6	401674	401679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021050	TTC	2	6	401708	401713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_021050	GTT	2	6	401726	401731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021050	GTT	2	6	401768	401773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021050	ATT	2	6	401777	401782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021050	AGG	2	6	401907	401912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021050	TAG	2	6	401979	401984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021050	GGTT	2	8	401992	401999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021050	T	6	6	407314	407319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021050	GTG	2	6	407325	407330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021050	A	7	7	407334	407340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021050	GTA	2	6	407349	407354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021050	TTTGT	2	10	407367	407376	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021050	AGC	2	6	407421	407426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_021050	TA	3	6	407473	407478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021050	ATT	2	6	410285	410290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021050	GTTT	2	8	410299	410306	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021050	TTTA	2	8	410322	410329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021050	GTTT	2	8	410334	410341	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021050	AATAA	2	10	410366	410375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021050	AAC	2	6	410376	410381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_021050	GTTT	2	8	410385	410392	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021050	AACA	2	8	410398	410405	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_021050	GAAT	2	8	412652	412659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021050	AAGT	2	8	412684	412691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021050	TC	3	6	412694	412699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_021050	A	6	6	412715	412720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021050	ATT	2	6	412791	412796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021050	GAA	2	6	412810	412815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021050	GA	3	6	412826	412831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021050	AAG	3	9	412850	412858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021050	GTT	2	6	415150	415155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021050	CT	3	6	415176	415181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_021050	TGA	2	6	415200	415205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_021050	GA	3	6	415704	415709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021050	TGA	2	6	415726	415731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021050	TAA	2	6	415852	415857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021050	T	6	6	415900	415905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1067	NC_021050	TAA	2	6	416275	416280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021050	TA	3	6	416321	416326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021050	TAA	2	6	416348	416353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021050	CTTTT	2	10	416438	416447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_021050	T	6	6	416460	416465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021050	T	7	7	416468	416474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021050	T	8	8	416496	416503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021050	ATT	3	9	416565	416573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021050	CATT	2	8	416577	416584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1083	NC_021050	A	6	6	419990	419995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021050	A	6	6	420021	420026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021050	A	6	6	420031	420036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021050	GATA	2	8	421849	421856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_021050	GC	3	6	424354	424359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1095	NC_021050	AAGA	2	8	428942	428949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021050	T	8	8	429012	429019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021050	TAA	3	9	429077	429085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021050	CTT	2	6	429121	429126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1101	NC_021050	A	8	8	436229	436236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021050	GCTCT	2	10	436263	436272	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1103	NC_021050	ATT	2	6	436297	436302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021050	ATG	2	6	438026	438031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021050	AGT	2	6	438060	438065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021050	A	6	6	438081	438086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021050	TAA	2	6	438112	438117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021050	A	7	7	438134	438140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021050	TTTTAG	2	12	438162	438173	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021050	TG	3	6	438178	438183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021050	GGTT	2	8	438293	438300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021050	T	7	7	438309	438315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021050	T	6	6	440159	440164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021050	TAA	2	6	440217	440222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021050	AG	4	8	440766	440773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021050	CTT	2	6	440774	440779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_021050	TCT	2	6	442581	442586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_021050	GA	3	6	442588	442593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021050	TAT	2	6	442612	442617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021050	ATA	2	6	442633	442638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021050	CTGG	2	8	442656	442663	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_021050	AAT	2	6	442755	442760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021050	AAC	2	6	442768	442773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021050	TAAAAA	2	12	442834	442845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021050	TTCC	2	8	444853	444860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_021050	TA	3	6	444896	444901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021050	T	6	6	444942	444947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1131	NC_021050	GCA	2	6	447057	447062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_021050	T	7	7	447067	447073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021050	A	8	8	448696	448703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021050	GAA	2	6	448732	448737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021050	CT	3	6	450422	450427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_021050	CTC	2	6	450750	450755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_021050	GAA	2	6	450838	450843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_021050	T	6	6	450862	450867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_021050	T	6	6	452883	452888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1280	NC_021050	GTT	3	9	508486	508494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1281	NC_021050	T	6	6	508500	508505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1282	NC_021050	T	7	7	508508	508514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1283	NC_021050	T	6	6	508520	508525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_021050	TTA	2	6	565290	565295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_021050	T	6	6	566247	566252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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