MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Coprococcus sp. ART55/1 draft genome

Total Repeats: 734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021018	TGCTC	2	10	3301	3310	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021018	CAGAA	2	10	4162	4171	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021018	TTGCT	2	10	13518	13527	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021018	TCACA	2	10	14718	14727	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_021018	TGGCA	2	10	32883	32892	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021018	GACAC	2	10	36502	36511	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_021018	TACAA	2	10	37726	37735	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021018	GAGCA	2	10	39890	39899	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021018	GTACA	2	10	40549	40558	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021018	AAATG	2	10	41129	41138	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021018	TGGGG	2	10	43403	43412	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021018	CTCAT	2	10	48977	48986	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_021018	CTTGA	2	10	50983	50992	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021018	ACAAA	2	10	60226	60235	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021018	CCTTT	2	10	67441	67450	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021018	TTTTG	2	10	78665	78674	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021018	GGTCA	2	10	80750	80759	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021018	TCTGT	2	10	84458	84467	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021018	TCTCT	2	10	105154	105163	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_021018	ATATC	2	10	107343	107352	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021018	CTATA	2	10	117273	117282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021018	AGTGT	2	10	120912	120921	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021018	GGAAT	2	10	125554	125563	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021018	TTCTT	2	10	135989	135998	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021018	TAAAT	2	10	148018	148027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021018	TATTT	2	10	167518	167527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021018	TCAGA	2	10	167627	167636	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021018	GCCAT	2	10	169386	169395	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_021018	TCCTG	2	10	174438	174447	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_021018	CCATA	2	10	186000	186009	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_021018	ATTCC	2	10	186668	186677	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_021018	AGTAA	2	10	191683	191692	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021018	TCTCC	2	10	191757	191766	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_021018	ACCTG	2	10	197570	197579	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021018	TACCT	2	10	201170	201179	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_021018	TATTT	2	10	212156	212165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021018	GTTGT	2	10	215604	215613	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021018	TTATA	2	10	225192	225201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021018	TTTTC	2	10	232044	232053	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021018	AAATG	2	10	232194	232203	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021018	TCCAT	2	10	232326	232335	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_021018	GATCA	2	10	232364	232373	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021018	AGCAA	2	10	232719	232728	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021018	CCATG	2	10	237582	237591	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_021018	AATCA	2	10	237812	237821	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021018	TTATA	2	10	244325	244334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021018	TATCT	2	10	250444	250453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021018	TTGTA	2	10	256573	256582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021018	CCCAG	2	10	258309	258318	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_021018	CCGTT	2	10	258770	258779	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_021018	GCGCT	2	10	260600	260609	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_021018	GATAA	2	10	260982	260991	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021018	AGCGA	2	10	261138	261147	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021018	GTATA	2	10	272496	272505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021018	TCTTG	2	10	274827	274836	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021018	TTTCC	2	10	305214	305223	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_021018	ACTTT	2	10	316075	316084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021018	TTCTT	2	10	316591	316600	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021018	GATAA	2	10	319083	319092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021018	CCTGC	2	10	330386	330395	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_021018	TCCAC	2	10	331249	331258	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_021018	ATTTT	2	10	334924	334933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021018	TGCAG	2	10	336781	336790	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021018	GCTCT	2	10	340095	340104	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021018	ATATT	2	10	347440	347449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021018	AATTT	2	10	351649	351658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021018	TGCTC	2	10	352109	352118	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_021018	GAAGC	2	10	362164	362173	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021018	GGAGA	2	10	362939	362948	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021018	GATTG	2	10	365765	365774	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021018	TAGAA	2	10	368721	368730	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021018	TCTAT	2	10	370434	370443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021018	GACTG	2	10	377091	377100	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021018	AAGTC	2	10	378224	378233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021018	CAGGG	2	10	379156	379165	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021018	GAAGG	2	10	379347	379356	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021018	CATAT	2	10	380495	380504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021018	GACCT	2	10	391545	391554	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_021018	CCGTC	2	10	391958	391967	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_021018	AAGAA	2	10	392176	392185	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021018	ACACC	2	10	398951	398960	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_021018	GGTAC	2	10	402099	402108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021018	CTTTT	2	10	402391	402400	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021018	GCAGG	2	10	407145	407154	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021018	AAAGA	2	10	409018	409027	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021018	GGGCG	2	10	416051	416060	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
87	NC_021018	GTTCT	2	10	416121	416130	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021018	CTTTT	2	10	416268	416277	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021018	TTTTG	2	10	419288	419297	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021018	GCGCA	2	10	419682	419691	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_021018	AACGG	2	10	422986	422995	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021018	TCAGA	2	10	442334	442343	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021018	ATCGT	2	10	442444	442453	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021018	TTGCT	2	10	449397	449406	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021018	CGCAG	2	10	452643	452652	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_021018	AGAAA	2	10	456038	456047	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021018	TGAAT	2	10	458497	458506	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021018	TTATT	2	10	458558	458567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021018	GATTT	2	10	458760	458769	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021018	GAAGA	2	10	458854	458863	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021018	GTGAA	2	10	459809	459818	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021018	AGGAA	2	10	463195	463204	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021018	ATAAA	2	10	468576	468585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021018	GAAAA	2	10	471670	471679	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021018	AAAGG	2	10	472693	472702	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021018	CTATA	2	10	477473	477482	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_021018	TAATT	2	10	479333	479342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021018	AAGAG	2	10	487916	487925	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021018	AATAA	2	10	503252	503261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021018	ATTTT	2	10	507639	507648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021018	CACTT	2	10	514530	514539	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_021018	TATTT	2	10	516570	516579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021018	AACAT	2	10	522661	522670	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021018	ATGTT	2	10	522751	522760	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021018	ATTAT	2	10	523272	523281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021018	TCACA	2	10	527905	527914	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_021018	CGGTC	2	10	528368	528377	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_021018	CCATT	2	10	533098	533107	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_021018	CCATT	2	10	534031	534040	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_021018	TATCT	2	10	534594	534603	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021018	TCTGT	2	10	539296	539305	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021018	ATATA	2	10	544398	544407	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021018	AAAAT	2	10	545648	545657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021018	ATCAT	2	10	545831	545840	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021018	CTTCT	2	10	551574	551583	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_021018	AATTA	2	10	554631	554640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021018	TTATT	2	10	554643	554652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021018	TAATA	2	10	556196	556205	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021018	TATTG	2	10	562192	562201	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021018	ACTTC	2	10	565999	566008	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_021018	TTTAC	2	10	566571	566580	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021018	TTATC	2	10	566746	566755	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021018	CTCAC	2	10	587802	587811	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_021018	TTTAT	2	10	588322	588331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021018	TCTTA	2	10	590971	590980	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021018	TTTAA	2	10	601371	601380	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021018	ATTTC	2	10	601947	601956	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021018	CGGCT	2	10	603202	603211	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_021018	CCGCA	2	10	607279	607288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_021018	TCTCC	2	10	608428	608437	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_021018	ATTTC	2	10	608467	608476	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021018	TATAA	2	10	617176	617185	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021018	GCCAT	2	10	619266	619275	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_021018	CATCC	2	10	620153	620162	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
145	NC_021018	AGCTC	2	10	620371	620380	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_021018	TTATG	2	10	620846	620855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021018	TAACA	2	10	629233	629242	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_021018	ATATC	2	10	634364	634373	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_021018	TATTT	2	10	645835	645844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021018	ATGTT	2	10	648372	648381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021018	TCAGG	2	10	649122	649131	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_021018	TCAGC	2	10	649461	649470	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
153	NC_021018	CAAAA	2	10	650374	650383	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_021018	GGAAT	2	10	656145	656154	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021018	ATGTG	2	10	656279	656288	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_021018	GGATT	2	10	688615	688624	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021018	CTGCA	2	10	691455	691464	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_021018	TGTAG	2	10	701440	701449	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021018	ACTGC	2	10	704250	704259	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_021018	TATAA	2	10	710101	710110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021018	GAAAA	2	10	715823	715832	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021018	CCAAA	2	10	717001	717010	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
168	NC_021018	ATATT	2	10	718116	718125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021018	ATATA	2	10	750549	750558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021018	TTAAA	2	10	755251	755260	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021018	TAGGG	2	10	770532	770541	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_021018	ATATA	2	10	788544	788553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021018	AGTGA	2	10	802816	802825	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021018	TTCTT	2	10	803720	803729	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_021018	CTATT	2	10	829250	829259	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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256	NC_021018	CATAC	2	10	1082524	1082533	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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283	NC_021018	TCCAT	2	10	1219299	1219308	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
284	NC_021018	CAAAA	2	10	1220149	1220158	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
285	NC_021018	TATAT	2	10	1220580	1220589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_021018	CCTGC	2	10	1221436	1221445	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
287	NC_021018	ACAGA	2	10	1234354	1234363	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
288	NC_021018	ACCGC	2	10	1239507	1239516	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
289	NC_021018	TGAAG	2	10	1239556	1239565	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021018	ATACA	2	10	1242369	1242378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_021018	GCTGA	2	10	1249441	1249450	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
292	NC_021018	GCATG	2	10	1250370	1250379	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
293	NC_021018	TTAAT	2	10	1252860	1252869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021018	TGTCT	2	10	1253433	1253442	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
295	NC_021018	GCGCC	2	10	1255150	1255159	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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299	NC_021018	ATTAT	2	10	1263564	1263573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_021018	GATAT	2	10	1675226	1675235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
407	NC_021018	TCATA	2	10	1680007	1680016	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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423	NC_021018	ATATA	2	10	1766689	1766698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_021018	CTTTT	2	10	1919762	1919771	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
456	NC_021018	TTCCA	2	10	1920304	1920313	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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458	NC_021018	TATCT	2	10	1931359	1931368	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
459	NC_021018	AAAAT	2	10	1931493	1931502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_021018	CATTC	2	10	1941407	1941416	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
464	NC_021018	CATCT	2	10	1943538	1943547	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
465	NC_021018	CATAT	2	10	1944556	1944565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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470	NC_021018	GTGCT	2	10	1974749	1974758	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
471	NC_021018	CTGCA	2	10	1975699	1975708	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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487	NC_021018	TGACA	2	10	2041131	2041140	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
488	NC_021018	ATTCA	2	10	2042981	2042990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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490	NC_021018	ATTAA	2	10	2053991	2054000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_021018	TGGCT	2	10	2072852	2072861	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
494	NC_021018	ATGAT	2	10	2079817	2079826	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
495	NC_021018	AAAGG	2	10	2081178	2081187	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_021018	AAAAG	2	10	2122894	2122903	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

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