MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coprococcus catus GD/7 draft genome

Total Repeats: 18149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021009	GATTT	2	10	714119	714128	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_021009	TGA	2	6	714239	714244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021009	AAC	2	6	714259	714264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_021009	TGA	2	6	714393	714398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021009	TAAT	2	8	714410	714417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_021009	GTG	2	6	714478	714483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021009	ATG	2	6	714487	714492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021009	AGAGAA	2	12	714493	714504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021009	ATGT	2	8	714615	714622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021009	ATG	2	6	714661	714666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_021009	ATGGA	2	10	714715	714724	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_021009	CAG	2	6	714824	714829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_021009	GGA	2	6	714839	714844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021009	TAA	2	6	714848	714853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021009	TGAT	2	8	714856	714863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_021009	GGT	2	6	714888	714893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_021009	ATA	2	6	714922	714927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021009	GGA	2	6	714953	714958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021009	ATT	2	6	714967	714972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021009	GAT	2	6	715020	715025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021009	GAA	2	6	715038	715043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021009	AT	3	6	715070	715075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021009	TGA	2	6	715103	715108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021009	GTTT	2	8	715144	715151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021009	GA	3	6	715242	715247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021009	GAA	2	6	715299	715304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021009	TTG	2	6	715338	715343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021009	GGC	2	6	715367	715372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_021009	AT	3	6	715391	715396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021009	GCT	2	6	715402	715407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_021009	A	7	7	715412	715418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_021009	ATGT	2	8	715461	715468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021009	GTT	2	6	716129	716134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_021009	A	6	6	716154	716159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_021009	GGCT	2	8	716187	716194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_021009	AGA	2	6	716230	716235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_021009	GAG	2	6	716296	716301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021009	TGG	2	6	717584	717589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021009	TGA	2	6	717828	717833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021009	AAAT	2	8	717859	717866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021009	T	7	7	717870	717876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021009	GTA	2	6	717989	717994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_021009	TAT	2	6	718735	718740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021009	A	7	7	718745	718751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021009	GTC	2	6	718758	718763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_021009	N	366	366	718776	719141	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021009	T	7	7	719145	719151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021009	A	6	6	719156	719161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021009	AACA	2	8	719222	719229	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_021009	CAG	2	6	719312	719317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_021009	AGC	2	6	719353	719358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_021009	GTCAG	2	10	719414	719423	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3553	NC_021009	AGC	2	6	719430	719435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_021009	AGA	2	6	719584	719589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021009	GTT	2	6	719625	719630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021009	TGAT	2	8	719665	719672	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021009	A	6	6	719687	719692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021009	A	6	6	719708	719713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021009	ATG	2	6	719731	719736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021009	GAAA	2	8	719894	719901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021009	TA	4	8	719922	719929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021009	GAA	2	6	719951	719956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021009	T	6	6	719988	719993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021009	AGA	2	6	720116	720121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021009	GCT	2	6	720138	720143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_021009	GGTC	2	8	720185	720192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3567	NC_021009	AG	3	6	720204	720209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021009	AGG	2	6	720354	720359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021009	TGAA	2	8	721673	721680	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021009	CAG	2	6	721681	721686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_021009	AT	3	6	721782	721787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_021009	GAT	2	6	721788	721793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021009	AGACAG	2	12	721828	721839	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3574	NC_021009	AGG	2	6	721858	721863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021009	A	6	6	721872	721877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_021009	N	454	454	721899	722352	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_021009	GCA	2	6	722469	722474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_021009	GTCC	2	8	722486	722493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_021009	GGC	2	6	722629	722634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_021009	ATC	2	6	722666	722671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_021009	GAT	2	6	722809	722814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021009	ATA	2	6	724115	724120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021009	A	7	7	724120	724126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021009	AAAT	2	8	724145	724152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_021009	T	7	7	724282	724288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021009	A	6	6	724307	724312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021009	T	6	6	724318	724323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_021009	CTA	2	6	724333	724338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_021009	CTA	2	6	724344	724349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_021009	GA	3	6	724400	724405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021009	AGA	2	6	724491	724496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_021009	TAA	2	6	724511	724516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_021009	T	8	8	724525	724532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021009	ATA	3	9	724544	724552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021009	TAA	3	9	724578	724586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021009	AAT	3	9	724609	724617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021009	AT	3	6	725997	726002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021009	AGC	2	6	726017	726022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_021009	AAC	2	6	726520	726525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_021009	GAAA	2	8	726531	726538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021009	CATG	2	8	726776	726783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_021009	GTAT	2	8	726784	726791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021009	TTTA	2	8	726817	726824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021009	AT	3	6	728359	728364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021009	ATT	2	6	728401	728406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021009	CAG	2	6	728413	728418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_021009	TCC	2	6	729801	729806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_021009	TAT	2	6	729826	729831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021009	T	6	6	729841	729846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021009	TAT	2	6	729890	729895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021009	CAGA	2	8	732531	732538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_021009	AAGAAA	2	12	732539	732550	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021009	T	7	7	732598	732604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021009	CCT	2	6	732906	732911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_021009	CCT	2	6	733105	733110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_021009	ATT	2	6	733173	733178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021009	AT	3	6	734241	734246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021009	CA	3	6	734290	734295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_021009	AT	3	6	734319	734324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021009	TGG	2	6	734335	734340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021009	AAAAAT	2	12	734938	734949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021009	A	6	6	734959	734964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021009	AGCA	2	8	735010	735017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_021009	ATA	2	6	735056	735061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021009	AGG	2	6	735085	735090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021009	TTC	2	6	736122	736127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_021009	GAA	2	6	736148	736153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021009	CAGACA	2	12	736166	736177	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_021009	CGC	2	6	736223	736228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_021009	CAATG	2	10	736255	736264	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3631	NC_021009	TGA	2	6	736361	736366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_021009	GAA	2	6	736418	736423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_021009	ATTC	2	8	736437	736444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3634	NC_021009	TG	3	6	737841	737846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_021009	AAAT	2	8	737861	737868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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