MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coprococcus catus GD/7 draft genome

Total Repeats: 18149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021009	GCA	2	6	616354	616359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_021009	TTA	2	6	616863	616868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021009	AAG	2	6	616974	616979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021009	ATT	2	6	617003	617008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_021009	AAT	2	6	617010	617015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021009	GAA	2	6	617197	617202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021009	T	6	6	617966	617971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021009	AT	3	6	618143	618148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021009	AGG	2	6	618156	618161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_021009	TGAA	2	8	619390	619397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021009	CG	4	8	619449	619456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_021009	TTGAA	2	10	619463	619472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021009	GGA	2	6	622286	622291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021009	GCA	2	6	622299	622304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_021009	GAA	2	6	622332	622337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_021009	AGC	2	6	622339	622344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_021009	TGTAAG	2	12	622430	622441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021009	GAT	2	6	622501	622506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021009	ATTT	2	8	624719	624726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021009	GA	3	6	624813	624818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021009	GCG	2	6	624822	624827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_021009	TCAG	2	8	624838	624845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_021009	ATC	2	6	624868	624873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_021009	GTT	2	6	624876	624881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021009	TGA	2	6	624926	624931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_021009	GCTGA	2	10	624966	624975	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3027	NC_021009	GA	3	6	624974	624979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_021009	AT	3	6	624980	624985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_021009	TGG	2	6	625048	625053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_021009	CGG	2	6	625054	625059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_021009	TGA	2	6	625069	625074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021009	CAT	2	6	625210	625215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_021009	TGA	2	6	625313	625318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_021009	GAA	2	6	625322	625327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021009	TG	3	6	625353	625358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021009	CGG	2	6	625405	625410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_021009	GAA	2	6	625482	625487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_021009	ATGTA	2	10	625531	625540	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021009	GACAG	2	10	625547	625556	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3040	NC_021009	ATC	2	6	625639	625644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_021009	CTG	2	6	625772	625777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_021009	GAT	2	6	625878	625883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021009	CTA	2	6	625924	625929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_021009	TTTA	2	8	626036	626043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021009	AAG	2	6	627768	627773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021009	TTG	2	6	627830	627835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021009	CAG	3	9	627877	627885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_021009	GGA	2	6	627957	627962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021009	ATC	2	6	628057	628062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_021009	GCA	2	6	628117	628122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_021009	TCCA	2	8	628128	628135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_021009	ATT	2	6	628168	628173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021009	TCAA	2	8	628174	628181	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_021009	TCA	2	6	628199	628204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_021009	TAT	2	6	628230	628235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021009	AGC	2	6	628260	628265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_021009	GTGCA	2	10	628294	628303	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3058	NC_021009	GAA	2	6	628341	628346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_021009	TAT	2	6	628359	628364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021009	GGC	2	6	628375	628380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_021009	GTGC	2	8	628390	628397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3062	NC_021009	TAT	2	6	628494	628499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021009	CAGAG	2	10	628538	628547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3064	NC_021009	TAT	2	6	628548	628553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021009	GGT	2	6	628578	628583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_021009	GAA	2	6	628624	628629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_021009	GGA	2	6	628833	628838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_021009	GAA	2	6	628846	628851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021009	CGT	2	6	628858	628863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_021009	CAA	2	6	629009	629014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_021009	CGG	2	6	629055	629060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_021009	CAG	2	6	629152	629157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_021009	CTG	2	6	629177	629182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_021009	CAC	2	6	629183	629188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_021009	AGG	2	6	629217	629222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_021009	AAT	2	6	629287	629292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_021009	ATTAA	2	10	629373	629382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021009	TGCT	2	8	629441	629448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_021009	CAG	2	6	629891	629896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_021009	GTT	2	6	631361	631366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_021009	AGC	2	6	632159	632164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_021009	TGCA	2	8	632486	632493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_021009	GCG	2	6	632525	632530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_021009	GCG	2	6	632540	632545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_021009	GCT	2	6	632622	632627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_021009	TGA	2	6	632645	632650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021009	CAG	2	6	632765	632770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_021009	CGG	2	6	632825	632830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_021009	TGA	2	6	632832	632837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021009	GGT	2	6	632841	632846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021009	GGT	2	6	632868	632873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021009	TCC	2	6	632874	632879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_021009	TTG	2	6	632909	632914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021009	TAT	2	6	632928	632933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021009	AGTG	2	8	632949	632956	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021009	GTT	2	6	633091	633096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021009	CGG	2	6	633099	633104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_021009	GAT	2	6	633108	633113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021009	AGC	2	6	633135	633140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_021009	TTC	2	6	633182	633187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_021009	GGA	2	6	633189	633194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021009	CTGC	2	8	633254	633261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_021009	CCGCA	2	10	633322	633331	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3104	NC_021009	ATA	2	6	633368	633373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021009	GAC	2	6	633378	633383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_021009	GGA	2	6	633414	633419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_021009	GGCA	2	8	633431	633438	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_021009	AGTG	2	8	633448	633455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021009	GCAG	2	8	633534	633541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_021009	CAG	2	6	633552	633557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_021009	AG	3	6	633556	633561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021009	CGA	2	6	633608	633613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_021009	TTA	2	6	633645	633650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021009	ACAT	2	8	633663	633670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_021009	GAA	2	6	633676	633681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021009	AGG	2	6	634449	634454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_021009	CAT	2	6	634474	634479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_021009	GCG	2	6	634633	634638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_021009	ATAC	2	8	634719	634726	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_021009	GA	3	6	634750	634755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021009	A	6	6	635576	635581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021009	AAC	2	6	636097	636102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_021009	TA	3	6	636146	636151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021009	TAA	2	6	636225	636230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021009	ATT	2	6	636244	636249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021009	TG	3	6	636310	636315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021009	GGA	2	6	636316	636321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021009	GAAA	2	8	636331	636338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_021009	GCC	2	6	636403	636408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_021009	CTG	2	6	636411	636416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_021009	TGT	2	6	636452	636457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021009	ATC	2	6	636478	636483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_021009	AGA	2	6	636518	636523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_021009	N	547	547	636553	637099	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3267	NC_021009	A	6	6	667138	667143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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