MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/CV204 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020976	A	7	7	594757	594763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020976	TAT	2	6	597935	597940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020976	T	12	12	597943	597954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020976	AGCA	2	8	597955	597962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_020976	A	6	6	597972	597977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020976	TAC	2	6	597979	597984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_020976	GA	3	6	599671	599676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020976	TAG	2	6	600274	600279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020976	AGA	2	6	600289	600294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020976	GGA	2	6	600312	600317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020976	T	6	6	602255	602260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020976	TTC	2	6	602283	602288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_020976	CCT	2	6	602302	602307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_020976	CTAC	2	8	602344	602351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_020976	TAGGGG	2	12	602413	602424	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020976	TA	3	6	602583	602588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020976	CCA	2	6	602637	602642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_020976	TTA	2	6	602670	602675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020976	TC	3	6	602685	602690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_020976	TCT	2	6	602777	602782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_020976	CTT	2	6	602793	602798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_020976	CAA	2	6	602801	602806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_020976	TTGC	2	8	602888	602895	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_020976	CCT	2	6	602918	602923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_020976	CT	3	6	603276	603281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_020976	A	6	6	603778	603783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020976	AT	3	6	604512	604517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020976	TTC	2	6	604529	604534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_020976	T	6	6	604565	604570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020976	A	9	9	604618	604626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020976	T	7	7	607736	607742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020976	ACT	2	6	607788	607793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_020976	TC	3	6	607811	607816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_020976	TAT	2	6	607817	607822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020976	AC	3	6	607835	607840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_020976	ATCC	2	8	607855	607862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_020976	CGC	2	6	607869	607874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_020976	CT	3	6	607892	607897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_020976	TCT	2	6	607917	607922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_020976	AAG	2	6	607944	607949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020976	GAC	2	6	607954	607959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_020976	TAC	2	6	607962	607967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_020976	ATG	2	6	607979	607984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020976	A	6	6	608014	608019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020976	AC	3	6	608087	608092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_020976	A	6	6	613325	613330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020976	CT	3	6	613339	613344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_020976	AG	3	6	613381	613386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020976	A	6	6	613394	613399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020976	GGAA	2	8	613409	613416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020976	A	7	7	613421	613427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020976	TATT	2	8	614321	614328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020976	TAA	2	6	614330	614335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020976	AAAT	2	8	614353	614360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020976	T	7	7	614360	614366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020976	TCTTTT	2	12	614407	614418	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1557	NC_020976	T	6	6	614415	614420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020976	ATG	2	6	614421	614426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020976	TTA	2	6	614435	614440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020976	CTT	2	6	615432	615437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_020976	T	6	6	616937	616942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020976	CAG	2	6	616980	616985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_020976	CT	3	6	618305	618310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_020976	T	7	7	618333	618339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020976	T	6	6	618344	618349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020976	GTT	2	6	618362	618367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020976	T	6	6	618378	618383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1573	NC_020976	A	6	6	621408	621413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020976	AGA	2	6	621421	621426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020976	GATT	2	8	621495	621502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_020976	T	6	6	625780	625785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_020976	ATC	2	6	625919	625924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1585	NC_020976	GTGA	2	8	628380	628387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_020976	A	8	8	630262	630269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020976	T	6	6	630293	630298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020976	A	6	6	630360	630365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020976	CCTG	2	8	630451	630458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1594	NC_020976	CTCC	2	8	633287	633294	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1595	NC_020976	A	6	6	633295	633300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1603	NC_020976	A	6	6	642423	642428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020976	A	8	8	642455	642462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020976	T	7	7	642495	642501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020976	A	7	7	642505	642511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020976	A	7	7	642513	642519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020976	GA	3	6	645389	645394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020976	GA	3	6	645401	645406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1614	NC_020976	TTA	2	6	645542	645547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_020976	TAG	2	6	645587	645592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020976	TTATT	2	10	645600	645609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_020976	TCGTC	2	10	646703	646712	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1619	NC_020976	AG	3	6	646728	646733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_020976	T	6	6	648210	648215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020976	GT	3	6	648226	648231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020976	CTTT	2	8	649557	649564	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_020976	AAC	2	6	650650	650655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1626	NC_020976	A	7	7	650714	650720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020976	A	6	6	650730	650735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020976	CTC	2	6	650774	650779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1630	NC_020976	ATT	2	6	652863	652868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_020976	CA	3	6	652875	652880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_020976	A	6	6	652953	652958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_020976	CAGG	2	8	652977	652984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1638	NC_020976	GAT	2	6	655385	655390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_020976	T	6	6	655513	655518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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