MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/LST high quality draft genome sequence

Total Repeats: 337

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020975	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020975	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020975	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020975	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020975	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020975	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020975	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020975	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020975	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020975	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020975	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020975	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020975	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020975	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020975	GA	3	6	27112	27117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020975	CT	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020975	TC	3	6	28487	28492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020975	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020975	GA	3	6	36984	36989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020975	AT	3	6	37085	37090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020975	CT	3	6	39352	39357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020975	CT	3	6	40722	40727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020975	AG	3	6	42848	42853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020975	CT	3	6	42914	42919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020975	AG	3	6	43244	43249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020975	TC	3	6	44336	44341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020975	TA	3	6	44488	44493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020975	AG	3	6	48570	48575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020975	TG	4	8	51919	51926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020975	GA	3	6	56189	56194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020975	GA	3	6	61393	61398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020975	AG	4	8	65412	65419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020975	TA	3	6	69731	69736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020975	CT	3	6	72467	72472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020975	TA	3	6	85831	85836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020975	TC	3	6	91052	91057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020975	GA	3	6	91184	91189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020975	CT	3	6	93534	93539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020975	TA	3	6	93700	93705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020975	AG	3	6	93743	93748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020975	AG	3	6	93840	93845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020975	GA	3	6	94062	94067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020975	TA	3	6	94679	94684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020975	TC	3	6	100556	100561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020975	AT	3	6	100607	100612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020975	GC	3	6	102713	102718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020975	TA	3	6	107283	107288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020975	TG	3	6	116537	116542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020975	AG	4	8	119125	119132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020975	GA	3	6	120947	120952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020975	TA	3	6	123255	123260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020975	GT	3	6	124245	124250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020975	CT	3	6	128781	128786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020975	TC	3	6	131103	131108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020975	AG	3	6	131180	131185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020975	AG	3	6	131205	131210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020975	TG	3	6	137618	137623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020975	AG	3	6	138863	138868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020975	AT	3	6	143158	143163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020975	GA	3	6	152398	152403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020975	AG	3	6	157965	157970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020975	TC	3	6	172437	172442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020975	AG	3	6	172569	172574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020975	CT	3	6	172587	172592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020975	TG	3	6	179076	179081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020975	TA	3	6	184271	184276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020975	GA	3	6	184384	184389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020975	GA	3	6	184487	184492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020975	GA	3	6	185128	185133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020975	GA	3	6	185160	185165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020975	AG	3	6	189214	189219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020975	AT	3	6	189716	189721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020975	AG	3	6	193494	193499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020975	TC	3	6	196486	196491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020975	CT	3	6	200244	200249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020975	GA	4	8	203303	203310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020975	CT	4	8	203351	203358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020975	TA	3	6	204932	204937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020975	AG	3	6	214623	214628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020975	TA	3	6	216177	216182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020975	CT	3	6	217820	217825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020975	TC	3	6	220821	220826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020975	AG	3	6	220852	220857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020975	TC	3	6	235051	235056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020975	AG	3	6	235077	235082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020975	AC	3	6	240000	240005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020975	GA	3	6	247086	247091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020975	TG	3	6	247196	247201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020975	AG	3	6	247996	248001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020975	GA	3	6	248875	248880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020975	AG	3	6	249000	249005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020975	TA	3	6	250821	250826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020975	AG	3	6	253112	253117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020975	TC	3	6	253138	253143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020975	TA	3	6	260979	260984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020975	AG	3	6	261059	261064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020975	CA	3	6	262786	262791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020975	TC	3	6	264685	264690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020975	CA	3	6	270034	270039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020975	TA	3	6	270236	270241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020975	AT	4	8	280796	280803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020975	CT	3	6	281648	281653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020975	TC	4	8	281739	281746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020975	TC	3	6	283430	283435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020975	TC	3	6	283487	283492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020975	CT	3	6	283960	283965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020975	AT	3	6	295974	295979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020975	CA	3	6	298303	298308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020975	GA	3	6	303034	303039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020975	AG	3	6	312252	312257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020975	CT	3	6	344210	344215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020975	CT	3	6	347281	347286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020975	TC	3	6	351507	351512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020975	CT	3	6	355423	355428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020975	AC	3	6	358756	358761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020975	GA	3	6	360665	360670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020975	TC	3	6	360743	360748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020975	TA	3	6	360944	360949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020975	GC	3	6	362473	362478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020975	TC	3	6	362776	362781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020975	CT	4	8	378079	378086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020975	CG	3	6	387918	387923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020975	CA	3	6	388968	388973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020975	TC	3	6	391515	391520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020975	CT	3	6	392005	392010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020975	GA	3	6	392135	392140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020975	GA	3	6	392259	392264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020975	CT	3	6	406367	406372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020975	CT	3	6	407352	407357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020975	CT	3	6	426087	426092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020975	CT	3	6	427110	427115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020975	AG	3	6	427456	427461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020975	GA	3	6	429151	429156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020975	AC	3	6	433149	433154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020975	CT	3	6	437420	437425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020975	AC	3	6	437458	437463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020975	CA	3	6	439927	439932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020975	CT	3	6	441331	441336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020975	CT	3	6	450613	450618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020975	AG	3	6	456754	456759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020975	TC	3	6	463292	463297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020975	AT	3	6	463361	463366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020975	GA	4	8	464735	464742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020975	TA	3	6	464778	464783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020975	TC	3	6	476603	476608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020975	AC	3	6	482145	482150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020975	GA	4	8	482190	482197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020975	CA	3	6	482227	482232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020975	TC	3	6	482268	482273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020975	AC	3	6	486703	486708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020975	AG	3	6	486865	486870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020975	CT	3	6	486884	486889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020975	AG	3	6	487177	487182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020975	CT	3	6	490164	490169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.