MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/LST high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020975	ACT	2	6	975771	975776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2505	NC_020975	TAA	2	6	975976	975981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020975	TGT	2	6	975992	975997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020975	AAT	2	6	976130	976135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2517	NC_020975	T	6	6	976613	976618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2637	NC_020975	AAG	2	6	1035135	1035140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_020975	TGT	2	6	1035144	1035149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_020975	TAA	3	9	1035188	1035196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2640	NC_020975	A	6	6	1035195	1035200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2641	NC_020975	TTA	2	6	1035233	1035238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2643	NC_020975	AGA	2	6	1038626	1038631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2644	NC_020975	A	8	8	1038641	1038648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2645	NC_020975	TAA	2	6	1038650	1038655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2646	NC_020975	A	6	6	1038770	1038775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2647	NC_020975	AAT	2	6	1038779	1038784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2648	NC_020975	TATT	2	8	1038801	1038808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2652	NC_020975	TTTTA	2	10	1038849	1038858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_020975	GGTT	2	8	1038865	1038872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.