MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 340

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020973	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020973	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020973	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020973	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020973	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020973	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020973	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020973	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020973	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020973	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020973	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020973	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020973	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020973	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020973	GA	3	6	27111	27116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020973	CT	3	6	27118	27123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020973	TC	3	6	28486	28491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020973	AG	3	6	28569	28574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020973	GA	3	6	36983	36988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020973	AT	3	6	37084	37089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020973	CT	3	6	39351	39356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020973	CT	3	6	40721	40726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020973	AG	3	6	42847	42852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020973	CT	3	6	42913	42918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020973	AG	3	6	43243	43248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020973	TC	3	6	44335	44340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020973	TA	3	6	44487	44492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020973	AG	3	6	48570	48575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020973	TG	3	6	51921	51926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020973	GA	3	6	56189	56194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020973	GA	3	6	61249	61254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020973	AG	4	8	65268	65275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020973	TA	3	6	69587	69592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020973	CT	3	6	72323	72328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020973	TA	3	6	85687	85692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020973	TC	3	6	90908	90913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020973	GA	3	6	91040	91045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020973	CT	3	6	93390	93395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020973	TA	3	6	93556	93561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020973	AG	3	6	93599	93604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020973	AG	3	6	93696	93701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020973	GA	3	6	93918	93923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020973	TA	3	6	94535	94540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020973	TC	3	6	100411	100416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020973	AT	3	6	100462	100467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020973	GC	3	6	102568	102573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020973	TA	3	6	107138	107143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020973	TG	3	6	116392	116397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020973	AG	4	8	118980	118987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020973	GA	3	6	120802	120807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020973	TA	3	6	123110	123115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020973	GT	3	6	124100	124105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020973	CT	3	6	128636	128641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020973	TC	3	6	130958	130963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020973	AG	3	6	131035	131040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020973	AG	3	6	131060	131065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020973	TG	3	6	137473	137478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020973	AG	3	6	138718	138723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020973	AT	3	6	143013	143018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020973	AG	3	6	157820	157825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020973	TC	3	6	172292	172297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020973	AG	3	6	172424	172429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020973	CT	3	6	172442	172447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020973	TG	3	6	178931	178936	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020973	TA	3	6	184075	184080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020973	GA	3	6	184188	184193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020973	GA	3	6	184291	184296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020973	GA	3	6	184931	184936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020973	GA	3	6	184963	184968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020973	AG	3	6	189016	189021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020973	AT	3	6	189518	189523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020973	AG	3	6	193295	193300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020973	TC	3	6	196287	196292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020973	CT	3	6	200045	200050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020973	GA	4	8	203104	203111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020973	CT	4	8	203152	203159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020973	TA	3	6	204733	204738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020973	AG	3	6	214424	214429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020973	TA	3	6	215978	215983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020973	CT	3	6	217621	217626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020973	TC	3	6	220622	220627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020973	AG	3	6	220653	220658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020973	TC	3	6	234852	234857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020973	AG	3	6	234878	234883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020973	AC	3	6	239801	239806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020973	GA	3	6	246887	246892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020973	TG	3	6	246997	247002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020973	AG	3	6	247797	247802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020973	GA	3	6	248676	248681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020973	AG	3	6	248801	248806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020973	TA	3	6	250622	250627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020973	AG	3	6	252913	252918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020973	TC	3	6	252939	252944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020973	TA	3	6	260780	260785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020973	AG	3	6	260860	260865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020973	CA	3	6	262587	262592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020973	TC	3	6	264486	264491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020973	CA	3	6	269835	269840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020973	TA	3	6	270037	270042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020973	AT	4	8	280597	280604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020973	CT	3	6	281449	281454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020973	TC	4	8	281540	281547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020973	TC	3	6	283231	283236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020973	TC	3	6	283288	283293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020973	CT	3	6	283761	283766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020973	AT	3	6	295775	295780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020973	CA	3	6	298104	298109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020973	GA	3	6	302835	302840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020973	AG	3	6	312053	312058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020973	CT	3	6	344013	344018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020973	CT	3	6	347084	347089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020973	TC	3	6	351310	351315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020973	CT	3	6	355226	355231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020973	AC	3	6	358559	358564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020973	GA	3	6	360469	360474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020973	TC	3	6	360547	360552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020973	TA	3	6	360748	360753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020973	GC	3	6	362277	362282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020973	TC	3	6	362580	362585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020973	CT	4	8	377882	377889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020973	CG	3	6	387721	387726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020973	CA	3	6	388771	388776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020973	TC	3	6	391318	391323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020973	CT	3	6	391808	391813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020973	GA	3	6	391938	391943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020973	GA	3	6	392062	392067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020973	CT	3	6	406170	406175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020973	CT	3	6	407155	407160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020973	CT	3	6	425890	425895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020973	CT	3	6	426913	426918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020973	AG	3	6	427259	427264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020973	GA	3	6	428954	428959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020973	AC	3	6	432952	432957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020973	CT	3	6	437223	437228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020973	AC	3	6	437261	437266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020973	CA	3	6	439730	439735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020973	CT	3	6	441134	441139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020973	CT	3	6	450416	450421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020973	AG	3	6	456557	456562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020973	TC	3	6	463095	463100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020973	AT	3	6	463164	463169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020973	GA	4	8	464538	464545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020973	TA	3	6	464581	464586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020973	TC	3	6	476406	476411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020973	AC	3	6	481947	481952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020973	GA	4	8	481992	481999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020973	CA	3	6	482029	482034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020973	TC	3	6	482070	482075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020973	AC	3	6	486505	486510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020973	AG	3	6	486667	486672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020973	CT	3	6	486686	486691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020973	AG	3	6	486979	486984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020973	CT	3	6	489967	489972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020973	CT	3	6	490485	490490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.