MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 2658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020973	GTG	2	6	975748	975753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2503	NC_020973	CTC	2	6	975850	975855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2505	NC_020973	TGT	2	6	975957	975962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020973	AAT	2	6	976095	976100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020973	T	7	7	976131	976137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2525	NC_020973	ATAAA	2	10	981521	981530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2606	NC_020973	GT	3	6	1015174	1015179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2617	NC_020973	TTA	2	6	1021043	1021048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2621	NC_020973	TTAGA	2	10	1021152	1021161	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_020973	TTAA	2	8	1022387	1022394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2630	NC_020973	TAAT	2	8	1028684	1028691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_020973	TC	3	6	1028696	1028701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2632	NC_020973	TG	3	6	1028708	1028713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_020973	TTTTC	2	10	1034811	1034820	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2634	NC_020973	GTT	2	6	1034871	1034876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_020973	GAT	2	6	1034887	1034892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2637	NC_020973	CT	3	6	1034927	1034932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.