MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 2658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020973	A	7	7	594724	594730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020973	TAT	2	6	597902	597907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020973	T	12	12	597910	597921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020973	AGCA	2	8	597922	597929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_020973	A	6	6	597939	597944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020973	TAC	2	6	597946	597951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_020973	GA	3	6	599638	599643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020973	TAG	2	6	600241	600246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020973	AGA	2	6	600256	600261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020973	GGA	2	6	600279	600284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020973	T	6	6	602222	602227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020973	TTC	2	6	602250	602255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_020973	CCT	2	6	602269	602274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_020973	CTAC	2	8	602311	602318	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_020973	TAGGGG	2	12	602380	602391	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020973	TA	3	6	602550	602555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020973	CCA	2	6	602604	602609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_020973	TTA	2	6	602637	602642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020973	TC	3	6	602652	602657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_020973	TCT	2	6	602744	602749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_020973	CTT	2	6	602760	602765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_020973	CAA	2	6	602768	602773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_020973	TTGC	2	8	602855	602862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_020973	CCT	2	6	602885	602890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_020973	CT	3	6	603243	603248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_020973	A	6	6	603745	603750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020973	AT	3	6	604479	604484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020973	TTC	2	6	604496	604501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_020973	T	6	6	604532	604537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020973	A	9	9	604585	604593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020973	T	7	7	607703	607709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020973	ACT	2	6	607755	607760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_020973	TC	3	6	607778	607783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_020973	TAT	2	6	607784	607789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020973	AC	3	6	607802	607807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_020973	ATCC	2	8	607822	607829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_020973	CGC	2	6	607836	607841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_020973	CT	3	6	607859	607864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_020973	TCT	2	6	607884	607889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_020973	AAG	2	6	607911	607916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020973	GAC	2	6	607921	607926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_020973	TAC	2	6	607929	607934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_020973	ATG	2	6	607946	607951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020973	A	6	6	607981	607986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020973	AC	3	6	608054	608059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_020973	A	6	6	613292	613297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020973	CT	3	6	613306	613311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_020973	AG	3	6	613348	613353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020973	A	6	6	613361	613366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020973	GGAA	2	8	613376	613383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020973	A	7	7	613388	613394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020973	TATT	2	8	614288	614295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020973	TAA	2	6	614297	614302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020973	AAAT	2	8	614320	614327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020973	T	7	7	614327	614333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020973	TCTTTT	2	12	614374	614385	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1557	NC_020973	T	6	6	614382	614387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020973	ATG	2	6	614388	614393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020973	TTA	2	6	614402	614407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020973	CTT	2	6	615399	615404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_020973	T	6	6	616904	616909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020973	CAG	2	6	616947	616952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1564	NC_020973	T	7	7	618300	618306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020973	T	6	6	618311	618316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020973	GTT	2	6	618329	618334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020973	T	6	6	618345	618350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1569	NC_020973	TCT	2	6	619971	619976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_020973	GAT	2	6	620022	620027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020973	T	6	6	620055	620060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1573	NC_020973	A	6	6	621375	621380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020973	AGA	2	6	621388	621393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020973	GATT	2	8	621462	621469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_020973	T	6	6	625747	625752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020973	CT	3	6	625832	625837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1588	NC_020973	AT	3	6	630221	630226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020973	A	8	8	630229	630236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020973	T	6	6	630260	630265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020973	A	6	6	630327	630332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020973	CCTG	2	8	630418	630425	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_020973	A	9	9	633242	633250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_020973	CTCC	2	8	633254	633261	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1595	NC_020973	A	6	6	633262	633267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1603	NC_020973	A	6	6	642390	642395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020973	A	8	8	642422	642429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020973	T	7	7	642462	642468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020973	A	7	7	642472	642478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020973	A	7	7	642480	642486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020973	GA	3	6	645356	645361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020973	GA	3	6	645368	645373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_020973	TAG	2	6	645554	645559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020973	TTATT	2	10	645567	645576	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020973	T	7	7	645575	645581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020973	TCGTC	2	10	646670	646679	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1619	NC_020973	AG	3	6	646695	646700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_020973	T	6	6	648177	648182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020973	GT	3	6	648193	648198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020973	CTTT	2	8	649524	649531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_020973	AAC	2	6	650617	650622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1625	NC_020973	A	7	7	650647	650653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020973	A	7	7	650681	650687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020973	A	6	6	650697	650702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020973	CTC	2	6	650741	650746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1631	NC_020973	CA	3	6	652842	652847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_020973	A	6	6	652920	652925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_020973	ATC	2	6	655338	655343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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