MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 2658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020973	A	7	7	400492	400498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020973	AAGCG	2	10	400548	400557	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_020973	A	6	6	401221	401226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020973	TCT	2	6	401237	401242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_020973	TTC	2	6	401261	401266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_020973	GAA	2	6	401301	401306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020973	TCAT	2	8	401313	401320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_020973	AGA	2	6	401382	401387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020973	GTT	2	6	403388	403393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020973	CCT	2	6	403394	403399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_020973	CAAA	2	8	403449	403456	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_020973	A	6	6	403471	403476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020973	GAG	2	6	403511	403516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020973	A	6	6	403544	403549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020973	T	6	6	403586	403591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020973	T	6	6	403597	403602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020973	TAA	2	6	405848	405853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020973	A	6	6	405852	405857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020973	AAC	2	6	405866	405871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_020973	TAA	2	6	405898	405903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020973	TAA	2	6	405933	405938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020973	TATCT	2	10	406076	406085	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1023	NC_020973	TTA	2	6	406100	406105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020973	T	6	6	406122	406127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020973	GGA	2	6	406146	406151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020973	CTT	2	6	406157	406162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_020973	CT	3	6	406170	406175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_020973	T	6	6	406194	406199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020973	TAG	2	6	406207	406212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020973	CT	3	6	407155	407160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_020973	TTA	2	6	408684	408689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020973	TAA	2	6	408706	408711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020973	AGA	2	6	408734	408739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020973	TTA	2	6	408773	408778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020973	TGA	2	6	408784	408789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1037	NC_020973	GCA	2	6	412789	412794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_020973	GTATA	2	10	412795	412804	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020973	AGCAA	2	10	412831	412840	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1040	NC_020973	ATTT	2	8	412866	412873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_020973	AGAA	2	8	412876	412883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020973	A	6	6	414639	414644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020973	CAA	2	6	414658	414663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_020973	ATTA	2	8	414665	414672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020973	AAC	2	6	414674	414679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_020973	AAAAT	2	10	414680	414689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020973	A	7	7	414702	414708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020973	A	6	6	414747	414752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020973	T	8	8	420237	420244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020973	TGC	2	6	420248	420253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_020973	TTC	2	6	420254	420259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_020973	GAA	2	6	421073	421078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020973	A	7	7	421092	421098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020973	T	6	6	421101	421106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020973	TTA	2	6	421129	421134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020973	GTT	2	6	421138	421143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020973	CAA	2	6	422579	422584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_020973	A	6	6	422583	422588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020973	GAT	2	6	422985	422990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020973	A	7	7	423023	423029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020973	GTAA	2	8	423060	423067	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020973	ACATCA	2	12	423097	423108	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_020973	GAAA	2	8	423109	423116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020973	CTG	2	6	423169	423174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_020973	AGG	2	6	423190	423195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020973	CGT	2	6	424670	424675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_020973	TTCT	2	8	424728	424735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_020973	CTCTT	2	10	424749	424758	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1069	NC_020973	A	6	6	424790	424795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020973	T	7	7	424798	424804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020973	CT	3	6	425890	425895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_020973	A	6	6	425900	425905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020973	T	6	6	425916	425921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020973	CT	3	6	426913	426918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_020973	AACT	2	8	426960	426967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_020973	GAT	2	6	426992	426997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_020973	A	7	7	427244	427250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020973	AG	3	6	427259	427264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_020973	A	7	7	427312	427318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020973	GA	3	6	428954	428959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020973	CTT	2	6	428961	428966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_020973	ACTC	2	8	431998	432005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_020973	A	8	8	432051	432058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_020973	AC	3	6	432952	432957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_020973	AGAAA	2	10	432965	432974	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020973	A	7	7	432993	432999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020973	CTCTT	2	10	433004	433013	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1092	NC_020973	GAAGA	2	10	433014	433023	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020973	ATG	2	6	433033	433038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020973	TAT	2	6	433257	433262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_020973	A	6	6	433285	433290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020973	AAATT	2	10	433293	433302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020973	AATTT	2	10	433314	433323	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020973	T	6	6	433369	433374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_020973	AAAC	2	8	437030	437037	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_020973	GTA	2	6	437046	437051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020973	TCC	2	6	437072	437077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_020973	TCT	2	6	437147	437152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_020973	AAAT	2	8	437172	437179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020973	AGC	2	6	437200	437205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_020973	CT	3	6	437223	437228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_020973	TTC	2	6	437255	437260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_020973	AC	3	6	437261	437266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_020973	ACA	2	6	439354	439359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_020973	CA	3	6	439730	439735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_020973	TAAC	2	8	439738	439745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_020973	CAA	2	6	439746	439751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_020973	CCT	2	6	439776	439781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_020973	AAG	2	6	439803	439808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020973	TCT	2	6	439824	439829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_020973	T	6	6	439843	439848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020973	CT	3	6	441134	441139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_020973	CCA	2	6	441185	441190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_020973	GGT	2	6	441221	441226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020973	CTA	2	6	443431	443436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1123	NC_020973	AAAC	2	8	444615	444622	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_020973	TTA	2	6	444638	444643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020973	A	7	7	444684	444690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020973	CTTC	2	8	444757	444764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_020973	T	8	8	450394	450401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020973	A	6	6	450402	450407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020973	CT	3	6	450416	450421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_020973	TCTT	2	8	450422	450429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_020973	TAAT	2	8	450435	450442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020973	CAT	2	6	450516	450521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_020973	CTA	2	6	450537	450542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_020973	ATT	2	6	452724	452729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020973	T	6	6	452741	452746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020973	CTT	2	6	452801	452806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_020973	T	6	6	452858	452863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_020973	GGA	2	6	452918	452923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1273	NC_020973	CAT	2	6	508020	508025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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