MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 2658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020973	AGG	2	6	184393	184398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020973	A	6	6	184747	184752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020973	T	8	8	184758	184765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020973	ATA	2	6	184808	184813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020973	A	7	7	184813	184819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020973	TAT	2	6	184891	184896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020973	GA	3	6	184931	184936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020973	GA	3	6	184963	184968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020973	AGA	2	6	184973	184978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020973	GTT	2	6	186246	186251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020973	GTT	3	9	186646	186654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020973	T	6	6	186660	186665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020973	T	7	7	186668	186674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020973	T	6	6	186680	186685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020973	T	7	7	186730	186736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020973	A	6	6	186752	186757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020973	T	6	6	186774	186779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020973	ATC	2	6	188352	188357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_020973	CGATA	2	10	188380	188389	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_020973	T	6	6	188393	188398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020973	TCC	2	6	188413	188418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_020973	ACA	3	9	188419	188427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_020973	AGT	2	6	188437	188442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020973	AAAC	2	8	188462	188469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_020973	TGC	2	6	188528	188533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020973	AGT	3	9	188596	188604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020973	AGT	2	6	188619	188624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020973	TTG	2	6	188627	188632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020973	TAT	2	6	188707	188712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020973	T	6	6	188726	188731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020973	GCA	2	6	188779	188784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_020973	CTT	2	6	188794	188799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_020973	GGAC	2	8	188821	188828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
534	NC_020973	AAG	2	6	188931	188936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020973	AG	3	6	189016	189021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020973	AT	3	6	189518	189523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020973	TGT	2	6	189532	189537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020973	GTT	2	6	189900	189905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020973	GCA	2	6	189953	189958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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541	NC_020973	AAG	2	6	190080	190085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020973	T	6	6	190130	190135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020973	ATT	2	6	190143	190148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020973	T	6	6	190159	190164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020973	TATGAA	3	18	192135	192152	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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547	NC_020973	AAC	2	6	192204	192209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_020973	ATA	2	6	192224	192229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020973	T	6	6	192249	192254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020973	AGA	2	6	193186	193191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020973	A	7	7	193243	193249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020973	A	7	7	193273	193279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020973	AG	3	6	193295	193300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020973	AAT	2	6	193305	193310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020973	T	9	9	193325	193333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020973	T	6	6	193372	193377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020973	TAC	2	6	193416	193421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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559	NC_020973	A	8	8	196220	196227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020973	CTT	2	6	196259	196264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_020973	A	8	8	196269	196276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020973	TC	3	6	196287	196292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_020973	CTT	2	6	196296	196301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_020973	ACGA	2	8	198906	198913	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_020973	CTAAG	2	10	199072	199081	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
566	NC_020973	T	6	6	199180	199185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020973	GAAA	2	8	199192	199199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020973	A	7	7	199197	199203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020973	T	6	6	199970	199975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_020973	TAG	2	6	200128	200133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020973	AAT	2	6	200141	200146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020973	AAG	2	6	200239	200244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_020973	CT	4	8	203152	203159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_020973	A	6	6	203161	203166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020973	TA	3	6	204733	204738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020973	CCTT	2	8	212326	212333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_020973	GAA	2	6	212348	212353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020973	TTG	2	6	212365	212370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020973	A	6	6	212377	212382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020973	CTC	2	6	213144	213149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_020973	T	7	7	213158	213164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020973	A	7	7	214392	214398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020973	TAA	2	6	214399	214404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_020973	A	6	6	214449	214454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020973	GAA	2	6	214459	214464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020973	TA	3	6	215978	215983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020973	GTC	2	6	215997	216002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020973	CTAT	2	8	216052	216059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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597	NC_020973	ATT	2	6	216170	216175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_020973	GTC	2	6	216224	216229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_020973	TCC	2	6	216248	216253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_020973	ATG	2	6	216271	216276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020973	GCAA	2	8	216296	216303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_020973	TTTTAC	2	12	217455	217466	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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605	NC_020973	TAA	2	6	217573	217578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020973	ATTTC	2	10	217600	217609	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
607	NC_020973	CT	3	6	217621	217626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_020973	AATT	2	8	217633	217640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020973	CTTG	2	8	217982	217989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_020973	T	6	6	218037	218042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020973	TC	3	6	220622	220627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_020973	AG	3	6	220653	220658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020973	CAATA	2	10	220723	220732	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
614	NC_020973	TAA	2	6	221696	221701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020973	AAAC	2	8	221712	221719	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_020973	T	8	8	224187	224194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020973	TCCT	2	8	224336	224343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_020973	GTT	2	6	224379	224384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020973	AGA	2	6	224388	224393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020973	ATT	2	6	224425	224430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020973	AAC	2	6	230827	230832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_020973	AGA	2	6	230854	230859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020973	GAG	2	6	230871	230876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020973	GCT	2	6	230923	230928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020973	ACC	2	6	230932	230937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_020973	A	6	6	230963	230968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020973	ACT	2	6	231027	231032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020973	TGT	2	6	234832	234837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020973	TC	3	6	234852	234857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_020973	AG	3	6	234878	234883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020973	CAT	2	6	234947	234952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_020973	T	8	8	234954	234961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020973	A	6	6	238050	238055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020973	AC	3	6	239801	239806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_020973	TCT	2	6	239887	239892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_020973	AAAT	2	8	239951	239958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020973	AAGA	2	8	239970	239977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020973	T	6	6	240030	240035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020973	AAG	2	6	242561	242566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020973	TTTC	2	8	242571	242578	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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642	NC_020973	ATA	2	6	243427	243432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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