MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 337

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020972	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020972	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020972	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020972	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020972	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020972	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020972	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020972	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020972	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020972	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020972	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020972	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020972	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020972	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020972	GA	3	6	27111	27116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020972	CT	3	6	27118	27123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020972	TC	3	6	28486	28491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020972	AG	3	6	28569	28574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020972	GA	3	6	36983	36988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020972	AT	3	6	37084	37089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020972	CT	3	6	39351	39356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020972	CT	3	6	40721	40726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020972	AG	3	6	42847	42852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020972	CT	3	6	42913	42918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020972	AG	3	6	43243	43248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020972	TC	3	6	44335	44340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020972	TA	3	6	44487	44492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020972	AG	3	6	48570	48575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020972	TG	3	6	51921	51926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020972	GA	3	6	56189	56194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020972	GA	3	6	61396	61401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020972	AG	4	8	65415	65422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020972	TA	3	6	69734	69739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020972	CT	3	6	72470	72475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020972	TA	3	6	85834	85839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020972	TC	3	6	91055	91060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020972	GA	3	6	91187	91192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020972	CT	3	6	93537	93542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020972	TA	3	6	93703	93708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020972	AG	3	6	93746	93751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020972	AG	3	6	93843	93848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020972	GA	3	6	94065	94070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020972	TA	3	6	94682	94687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020972	TC	3	6	100558	100563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020972	AT	3	6	100609	100614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020972	GC	3	6	102715	102720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020972	TA	3	6	107285	107290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020972	TG	3	6	116539	116544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020972	AG	4	8	119127	119134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020972	GA	3	6	120949	120954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020972	TA	3	6	123257	123262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020972	GT	3	6	124247	124252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020972	CT	3	6	128783	128788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020972	TC	3	6	131105	131110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020972	AG	3	6	131182	131187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020972	AG	3	6	131207	131212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020972	TG	3	6	137621	137626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020972	AG	3	6	138866	138871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020972	AT	3	6	143161	143166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020972	AG	3	6	157968	157973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020972	TC	3	6	172440	172445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020972	AG	3	6	172572	172577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020972	CT	3	6	172590	172595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020972	TG	3	6	179079	179084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020972	TA	3	6	184274	184279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020972	GA	3	6	184387	184392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020972	GA	3	6	184490	184495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020972	GA	3	6	185130	185135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020972	GA	3	6	185162	185167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020972	AG	3	6	189216	189221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020972	AT	3	6	189717	189722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020972	AG	3	6	193494	193499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020972	TC	3	6	196486	196491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020972	CT	3	6	200244	200249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020972	GA	4	8	203303	203310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020972	CT	4	8	203351	203358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020972	TA	3	6	204932	204937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020972	AG	3	6	214623	214628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020972	TA	3	6	216177	216182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020972	CT	3	6	217820	217825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020972	TC	3	6	220821	220826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020972	AG	3	6	220852	220857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020972	TC	3	6	235051	235056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020972	AG	3	6	235077	235082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020972	AC	3	6	240000	240005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020972	GA	3	6	247086	247091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020972	TG	3	6	247196	247201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020972	AG	3	6	247996	248001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020972	GA	3	6	248875	248880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020972	AG	3	6	249000	249005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020972	TA	3	6	250821	250826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020972	AG	3	6	253112	253117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020972	TC	3	6	253138	253143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020972	TA	3	6	260979	260984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020972	AG	3	6	261059	261064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020972	CA	3	6	262786	262791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020972	TC	3	6	264685	264690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020972	CA	3	6	270034	270039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020972	TA	3	6	270236	270241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020972	AT	4	8	280796	280803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020972	CT	3	6	281648	281653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020972	TC	4	8	281739	281746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020972	TC	3	6	283430	283435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020972	TC	3	6	283487	283492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020972	CT	3	6	283960	283965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020972	AT	3	6	295974	295979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020972	CA	3	6	298303	298308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020972	GA	3	6	303034	303039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020972	AG	3	6	312252	312257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020972	CT	3	6	344212	344217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020972	CT	3	6	347283	347288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020972	TC	3	6	351509	351514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020972	CT	3	6	355425	355430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020972	AC	3	6	358758	358763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020972	GA	3	6	360668	360673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020972	TC	3	6	360746	360751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020972	TA	3	6	360947	360952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020972	GC	3	6	362476	362481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020972	TC	3	6	362779	362784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020972	CT	4	8	378082	378089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020972	CG	3	6	387921	387926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020972	CA	3	6	388971	388976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020972	TC	3	6	391518	391523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020972	CT	3	6	392008	392013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020972	GA	3	6	392138	392143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020972	GA	3	6	392262	392267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020972	CT	3	6	406371	406376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020972	CT	3	6	407356	407361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020972	CT	3	6	426092	426097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020972	CT	3	6	427115	427120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020972	AG	3	6	427461	427466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020972	GA	3	6	429156	429161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020972	AC	3	6	433154	433159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020972	CT	3	6	437425	437430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020972	AC	3	6	437463	437468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020972	CA	3	6	439932	439937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020972	CT	3	6	441336	441341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020972	CT	3	6	450618	450623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020972	AG	3	6	456759	456764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020972	TC	3	6	463297	463302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020972	AT	3	6	463366	463371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020972	GA	4	8	464740	464747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020972	TA	3	6	464783	464788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020972	TC	3	6	476608	476613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020972	AC	3	6	482149	482154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020972	GA	4	8	482194	482201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020972	CA	3	6	482231	482236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020972	TC	3	6	482272	482277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020972	AC	3	6	486707	486712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020972	AG	3	6	486869	486874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020972	CT	3	6	486888	486893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020972	AG	3	6	487181	487186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020972	CT	3	6	490168	490173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020972	CT	3	6	490686	490691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.