MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 2657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020972	A	7	7	400692	400698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020972	AAGCG	2	10	400748	400757	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_020972	A	6	6	401421	401426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020972	TCT	2	6	401437	401442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_020972	TTC	2	6	401461	401466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_020972	GAA	2	6	401501	401506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020972	TCAT	2	8	401513	401520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_020972	AGA	2	6	401582	401587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020972	GTT	2	6	403588	403593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020972	CCT	2	6	403594	403599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_020972	CAAA	2	8	403649	403656	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_020972	A	6	6	403671	403676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020972	GAG	2	6	403711	403716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020972	A	6	6	403744	403749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020972	T	6	6	403786	403791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020972	T	6	6	403797	403802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020972	A	6	6	405966	405971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020972	A	9	9	405973	405981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020972	TTTTAA	2	12	405994	406005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020972	TAA	2	6	406049	406054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020972	A	6	6	406053	406058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020972	AAC	2	6	406067	406072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020972	TAA	2	6	406099	406104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020972	TAA	2	6	406134	406139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020972	TATCT	2	10	406277	406286	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1026	NC_020972	TTA	2	6	406301	406306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020972	T	6	6	406323	406328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020972	GGA	2	6	406347	406352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020972	CTT	2	6	406358	406363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_020972	CT	3	6	406371	406376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_020972	T	6	6	406395	406400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020972	TAG	2	6	406408	406413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020972	CT	3	6	407356	407361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_020972	TTA	2	6	408885	408890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020972	TAA	2	6	408907	408912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020972	AGA	2	6	408935	408940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020972	TTA	2	6	408974	408979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020972	TGA	2	6	408985	408990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020972	CCA	2	6	412936	412941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_020972	GCA	2	6	412990	412995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_020972	GTATA	2	10	412996	413005	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020972	AGCAA	2	10	413032	413041	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1043	NC_020972	ATTT	2	8	413067	413074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020972	AGAA	2	8	413077	413084	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020972	A	6	6	414840	414845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020972	CAA	2	6	414859	414864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_020972	ATTA	2	8	414866	414873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020972	AAC	2	6	414875	414880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_020972	AAAAT	2	10	414881	414890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020972	A	8	8	414903	414910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020972	A	6	6	414949	414954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_020972	T	8	8	420439	420446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020972	TGC	2	6	420450	420455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_020972	TTC	2	6	420456	420461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_020972	GAA	2	6	421275	421280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020972	A	7	7	421294	421300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020972	T	6	6	421303	421308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020972	TTA	2	6	421331	421336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020972	GTT	2	6	421340	421345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020972	CAA	2	6	422781	422786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_020972	A	6	6	422785	422790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020972	GAT	2	6	423187	423192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020972	A	7	7	423225	423231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020972	GTAA	2	8	423262	423269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020972	ACATCA	2	12	423299	423310	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_020972	GAAA	2	8	423311	423318	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_020972	CTG	2	6	423371	423376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_020972	AGG	2	6	423392	423397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020972	CGT	2	6	424872	424877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1071	NC_020972	CTCTT	2	10	424951	424960	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1072	NC_020972	A	6	6	424992	424997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020972	T	7	7	425000	425006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020972	CT	3	6	426092	426097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_020972	A	6	6	426102	426107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020972	T	6	6	426118	426123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020972	CT	3	6	427115	427120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_020972	AACT	2	8	427162	427169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_020972	GAT	2	6	427194	427199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_020972	A	8	8	427242	427249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020972	A	7	7	427446	427452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020972	AG	3	6	427461	427466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020972	TAAAA	2	10	427493	427502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020972	CAAA	2	8	427509	427516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_020972	A	7	7	427514	427520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_020972	GA	3	6	429156	429161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020972	CTT	2	6	429163	429168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_020972	ACTC	2	8	432200	432207	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_020972	A	8	8	432253	432260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020972	TCT	2	6	433124	433129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_020972	AC	3	6	433154	433159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_020972	AGAAA	2	10	433167	433176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020972	A	7	7	433195	433201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020972	CTCTT	2	10	433206	433215	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1095	NC_020972	GAAGA	2	10	433216	433225	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020972	ATG	2	6	433235	433240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020972	TAT	2	6	433459	433464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020972	A	6	6	433487	433492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_020972	AAATT	2	10	433495	433504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_020972	AATTT	2	10	433516	433525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020972	T	6	6	433571	433576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020972	TCC	2	6	437201	437206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_020972	AAC	2	6	437226	437231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_020972	AAAC	2	8	437232	437239	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_020972	GTA	2	6	437248	437253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020972	TCC	2	6	437274	437279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_020972	TCT	2	6	437349	437354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_020972	AAAT	2	8	437374	437381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020972	AGC	2	6	437402	437407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_020972	CT	3	6	437425	437430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_020972	TTC	2	6	437457	437462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_020972	AC	3	6	437463	437468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_020972	ACA	2	6	439556	439561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_020972	CA	3	6	439932	439937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_020972	TAAC	2	8	439940	439947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_020972	CAA	2	6	439948	439953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_020972	CCT	2	6	439978	439983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_020972	AAG	2	6	440005	440010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020972	TCT	2	6	440026	440031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_020972	T	6	6	440045	440050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020972	CT	3	6	441336	441341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_020972	CCA	2	6	441387	441392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_020972	GGT	2	6	441423	441428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020972	CTA	2	6	443633	443638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1127	NC_020972	TTA	2	6	444840	444845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020972	A	7	7	444886	444892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020972	CTTC	2	8	444959	444966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_020972	T	8	8	450596	450603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020972	A	6	6	450604	450609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020972	CT	3	6	450618	450623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_020972	TCTT	2	8	450624	450631	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_020972	TAAT	2	8	450637	450644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020972	CAT	2	6	450718	450723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_020972	CTA	2	6	450739	450744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_020972	ATT	2	6	452926	452931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_020972	T	6	6	452943	452948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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