MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 2657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020972	A	6	6	184946	184951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020972	T	8	8	184957	184964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020972	ATA	2	6	185007	185012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020972	A	7	7	185012	185018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020972	TAT	2	6	185090	185095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020972	GA	3	6	185130	185135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020972	GA	3	6	185162	185167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020972	AGA	2	6	185172	185177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020972	GTT	2	6	186445	186450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020972	GTT	3	9	186845	186853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020972	T	6	6	186859	186864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020972	T	7	7	186867	186873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020972	T	6	6	186879	186884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020972	T	8	8	186929	186936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020972	A	6	6	186952	186957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020972	T	6	6	186974	186979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020972	ATC	2	6	188552	188557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_020972	CGATA	2	10	188580	188589	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
519	NC_020972	T	6	6	188593	188598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020972	TCC	2	6	188613	188618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_020972	ACA	3	9	188619	188627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_020972	AGT	2	6	188637	188642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020972	AAAC	2	8	188662	188669	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_020972	TGC	2	6	188728	188733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_020972	AGT	3	9	188796	188804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020972	AGT	2	6	188819	188824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020972	TTG	2	6	188827	188832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020972	TAT	2	6	188907	188912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020972	T	6	6	188926	188931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020972	GCA	2	6	188979	188984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020972	CTT	2	6	188994	188999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_020972	GGAC	2	8	189021	189028	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
533	NC_020972	AAG	2	6	189131	189136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020972	AG	3	6	189216	189221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020972	AT	3	6	189717	189722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020972	TGT	2	6	189731	189736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020972	GTT	2	6	190099	190104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020972	GCA	2	6	190152	190157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_020972	CTTT	2	8	190232	190239	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
540	NC_020972	AAG	2	6	190279	190284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020972	T	6	6	190329	190334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020972	ATT	2	6	190342	190347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020972	T	6	6	190358	190363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020972	TATGAA	3	18	192334	192351	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020972	AGA	2	6	192396	192401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020972	AAC	2	6	192403	192408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_020972	ATA	2	6	192423	192428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020972	T	6	6	192448	192453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020972	AGA	2	6	193385	193390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020972	A	7	7	193442	193448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020972	A	7	7	193472	193478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020972	AG	3	6	193494	193499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020972	AAT	2	6	193504	193509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020972	T	9	9	193524	193532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020972	T	6	6	193571	193576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020972	TAC	2	6	193615	193620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_020972	ATT	2	6	193624	193629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020972	A	8	8	196419	196426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020972	CTT	2	6	196458	196463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_020972	A	8	8	196468	196475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020972	TC	3	6	196486	196491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_020972	CTT	2	6	196495	196500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_020972	ACGA	2	8	199105	199112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_020972	CTAAG	2	10	199271	199280	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
565	NC_020972	T	6	6	199379	199384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020972	GAAA	2	8	199391	199398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020972	A	7	7	199396	199402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020972	T	6	6	200169	200174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020972	TAAA	2	8	200191	200198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020972	CT	3	6	200244	200249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_020972	AAT	2	6	200291	200296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020972	TAG	2	6	200327	200332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020972	AAT	2	6	200340	200345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020972	AAG	2	6	200438	200443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020972	CTT	2	6	200449	200454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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577	NC_020972	T	7	7	203333	203339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020972	CT	4	8	203351	203358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_020972	A	6	6	203360	203365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020972	TA	3	6	204932	204937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020972	CCTT	2	8	212525	212532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_020972	GAA	2	6	212547	212552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020972	TTG	2	6	212564	212569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020972	A	6	6	212576	212581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020972	CTC	2	6	213343	213348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_020972	T	7	7	213357	213363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020972	A	7	7	214591	214597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020972	TAA	2	6	214598	214603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020972	AG	3	6	214623	214628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020972	A	6	6	214648	214653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020972	GAA	2	6	214658	214663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020972	TA	3	6	216177	216182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020972	GTC	2	6	216196	216201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_020972	CTAT	2	8	216251	216258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_020972	T	7	7	216266	216272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020972	ATT	2	6	216369	216374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020972	TCT	2	6	216395	216400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_020972	GTC	2	6	216423	216428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_020972	TCC	2	6	216447	216452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_020972	ATG	2	6	216470	216475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020972	GCAA	2	8	216495	216502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_020972	TTTTAC	2	12	217654	217665	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
603	NC_020972	A	8	8	217717	217724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020972	TAA	2	6	217772	217777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020972	ATTTC	2	10	217799	217808	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
606	NC_020972	CT	3	6	217820	217825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_020972	AATT	2	8	217832	217839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020972	CTTG	2	8	218181	218188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_020972	T	6	6	218236	218241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020972	TC	3	6	220821	220826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_020972	AG	3	6	220852	220857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020972	CAATA	2	10	220922	220931	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
613	NC_020972	TAA	2	6	221895	221900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020972	AAAC	2	8	221911	221918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_020972	T	8	8	224386	224393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020972	TCCT	2	8	224535	224542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_020972	GTT	2	6	224578	224583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020972	AGA	2	6	224587	224592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020972	ATT	2	6	224624	224629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020972	AAC	2	6	231026	231031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_020972	AGA	2	6	231053	231058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020972	GAG	2	6	231070	231075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020972	GCT	2	6	231122	231127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_020972	ACC	2	6	231131	231136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_020972	A	6	6	231162	231167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020972	ACT	2	6	231226	231231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020972	TGT	2	6	235031	235036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020972	TC	3	6	235051	235056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_020972	AG	3	6	235077	235082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020972	CAT	2	6	235146	235151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_020972	T	8	8	235153	235160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020972	A	6	6	238249	238254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020972	AC	3	6	240000	240005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_020972	TCT	2	6	240086	240091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_020972	AAAT	2	8	240150	240157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020972	AAGA	2	8	240169	240176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020972	T	6	6	240229	240234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020972	AAG	2	6	242760	242765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020972	TTTC	2	8	242770	242777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
640	NC_020972	TAAA	2	8	243604	243611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_020972	TTA	2	6	243647	243652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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