MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 331

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020971	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020971	GA	3	6	7596	7601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020971	AG	3	6	9951	9956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020971	TA	3	6	11849	11854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020971	TA	3	6	13940	13945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020971	TA	4	8	14164	14171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020971	AG	3	6	18116	18121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020971	GA	3	6	18129	18134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020971	CT	3	6	19051	19056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020971	AG	3	6	21117	21122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020971	GA	3	6	21275	21280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020971	AG	3	6	21792	21797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020971	CT	3	6	21861	21866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020971	GA	3	6	27113	27118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020971	CT	3	6	27120	27125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020971	TC	3	6	28488	28493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020971	AG	3	6	28571	28576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020971	GA	3	6	36985	36990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020971	AT	3	6	37087	37092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020971	CT	3	6	39354	39359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020971	CT	3	6	40725	40730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020971	CT	3	6	42917	42922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020971	GA	5	10	43192	43201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020971	AG	3	6	43316	43321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020971	TC	3	6	44408	44413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020971	TA	3	6	44561	44566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020971	AG	3	6	48644	48649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020971	GA	3	6	56316	56321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020971	GA	3	6	61104	61109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020971	AG	4	8	65123	65130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020971	TA	3	6	85552	85557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020971	TC	3	6	90773	90778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020971	GA	3	6	90905	90910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020971	CT	3	6	93255	93260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020971	TA	3	6	93421	93426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020971	AG	3	6	93464	93469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020971	AG	3	6	93561	93566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020971	GA	3	6	93783	93788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020971	TA	3	6	94399	94404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020971	TC	3	6	100275	100280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020971	AT	3	6	100326	100331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020971	GC	3	6	102432	102437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020971	TA	3	6	107002	107007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020971	TG	3	6	116256	116261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020971	AG	4	8	118843	118850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020971	GA	3	6	120665	120670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020971	GT	3	6	123894	123899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020971	CT	3	6	128431	128436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020971	TC	3	6	130753	130758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020971	AG	3	6	130830	130835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020971	AG	3	6	130855	130860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020971	GA	3	6	138582	138587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020971	AT	3	6	142814	142819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020971	GA	3	6	152052	152057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020971	AG	3	6	157620	157625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020971	TC	3	6	172085	172090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020971	AG	3	6	172217	172222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020971	CT	3	6	172235	172240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020971	TG	3	6	178726	178731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020971	GA	3	6	184162	184167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020971	AT	3	6	192621	192626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020971	AG	3	6	197398	197403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020971	TC	3	6	200390	200395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020971	CT	3	6	204148	204153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020971	GA	4	8	207209	207216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020971	CT	4	8	207257	207264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020971	AG	4	8	218493	218500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020971	CA	3	6	218552	218557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020971	TA	3	6	220047	220052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020971	CT	3	6	221687	221692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020971	TC	3	6	224688	224693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020971	AG	3	6	224719	224724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020971	TC	3	6	238919	238924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020971	AG	3	6	238945	238950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020971	CA	3	6	243869	243874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020971	GT	3	6	244086	244091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020971	GA	3	6	250954	250959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020971	TG	3	6	251064	251069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020971	AG	3	6	251866	251871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020971	AG	3	6	252875	252880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020971	TA	3	6	254681	254686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020971	TC	3	6	256988	256993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020971	AG	3	6	258466	258471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020971	TA	3	6	264826	264831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020971	CA	3	6	266633	266638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020971	TC	3	6	268533	268538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020971	CT	3	6	273947	273952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020971	TA	3	6	274086	274091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020971	AT	4	8	284646	284653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020971	CT	3	6	285498	285503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020971	TC	4	8	285589	285596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020971	TC	3	6	287280	287285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020971	TC	3	6	287337	287342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020971	CT	3	6	287810	287815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020971	AT	3	6	299824	299829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020971	CA	3	6	302153	302158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020971	AC	3	6	302194	302199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020971	GA	3	6	306884	306889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020971	AG	3	6	316104	316109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020971	CT	3	6	348071	348076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020971	CT	3	6	351143	351148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020971	TC	3	6	355369	355374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020971	CT	3	6	359285	359290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020971	AC	3	6	362618	362623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020971	GA	3	6	364530	364535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020971	TC	3	6	364608	364613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020971	TA	3	6	364810	364815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020971	CT	4	8	381927	381934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020971	CG	3	6	391766	391771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020971	TC	3	6	395363	395368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020971	CT	3	6	395853	395858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020971	GA	3	6	395983	395988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020971	GA	3	6	396114	396119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020971	CT	3	6	410218	410223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020971	CT	3	6	411205	411210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020971	CT	3	6	429933	429938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020971	CT	3	6	430956	430961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020971	AG	3	6	431303	431308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020971	GA	3	6	432998	433003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020971	AC	3	6	436997	437002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020971	CT	3	6	441276	441281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020971	AC	3	6	441314	441319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020971	CA	3	6	443783	443788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020971	CT	3	6	445183	445188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020971	CT	3	6	454465	454470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020971	CT	3	6	456918	456923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020971	AG	3	6	460606	460611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020971	TC	3	6	467144	467149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020971	AT	3	6	467213	467218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_020971	TA	3	6	468630	468635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020971	GA	3	6	468728	468733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020971	AC	3	6	486037	486042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020971	GA	4	8	486082	486089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020971	CA	3	6	486119	486124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020971	TC	3	6	486160	486165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020971	AC	3	6	490595	490600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020971	AG	3	6	490756	490761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020971	CT	3	6	490775	490780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020971	AG	3	6	491068	491073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020971	CT	3	6	494054	494059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020971	CT	3	6	494572	494577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020971	TG	3	6	494605	494610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020971	TA	3	6	494718	494723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_020971	CT	4	8	503342	503349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020971	CA	3	6	508448	508453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020971	CT	3	6	509386	509391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020971	TA	3	6	515193	515198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020971	AG	3	6	517091	517096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020971	GA	3	6	518103	518108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020971	AG	3	6	518139	518144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020971	AT	3	6	524371	524376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020971	AC	3	6	535480	535485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.