MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020969	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020969	GA	3	6	7598	7603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020969	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020969	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020969	TA	3	6	13929	13934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020969	TA	4	8	14153	14160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020969	AG	3	6	18105	18110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020969	GA	3	6	18118	18123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020969	CT	3	6	19040	19045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020969	AG	3	6	21106	21111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020969	GA	3	6	21264	21269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020969	AG	3	6	21781	21786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020969	CT	3	6	21850	21855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020969	GA	3	6	27102	27107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020969	CT	3	6	27109	27114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020969	TC	3	6	28477	28482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020969	AG	3	6	28560	28565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020969	GA	3	6	36974	36979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020969	AT	3	6	37076	37081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020969	CT	3	6	39343	39348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020969	CT	3	6	40713	40718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020969	CT	3	6	42905	42910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020969	GA	5	10	43180	43189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020969	AG	3	6	43304	43309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020969	TC	3	6	44396	44401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020969	TA	3	6	44549	44554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020969	AG	3	6	48632	48637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020969	TG	4	8	51979	51986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020969	GA	3	6	56081	56086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020969	GA	3	6	61226	61231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020969	AG	4	8	65245	65252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020969	CT	3	6	72312	72317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020969	TA	3	6	85674	85679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020969	TC	3	6	90895	90900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020969	GA	3	6	91027	91032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020969	CT	3	6	93377	93382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020969	TA	3	6	93543	93548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020969	AG	3	6	93586	93591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020969	AG	3	6	93683	93688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020969	GA	3	6	93905	93910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020969	TA	3	6	94521	94526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020969	TC	3	6	100397	100402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020969	AT	3	6	100448	100453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020969	GC	3	6	102554	102559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020969	TA	3	6	107124	107129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020969	TG	3	6	116366	116371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020969	AG	4	8	118952	118959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020969	GA	3	6	120774	120779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020969	TA	3	6	123009	123014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020969	GT	3	6	123998	124003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020969	CT	3	6	128535	128540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020969	TC	3	6	130857	130862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020969	AG	3	6	130934	130939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020969	AG	3	6	130959	130964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020969	AG	3	6	138621	138626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020969	GA	3	6	138684	138689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020969	AT	3	6	142916	142921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020969	AG	3	6	157721	157726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020969	TC	3	6	172184	172189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020969	AG	3	6	172316	172321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020969	CT	3	6	172334	172339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020969	TG	3	6	178825	178830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020969	GA	3	6	184261	184266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020969	AT	3	6	192720	192725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020969	AG	3	6	197497	197502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020969	TC	3	6	200489	200494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020969	CT	3	6	204247	204252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020969	GA	4	8	207308	207315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020969	CT	4	8	207356	207363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020969	AG	4	8	218592	218599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020969	CA	3	6	218651	218656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020969	TA	3	6	220146	220151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020969	CT	3	6	221788	221793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020969	TC	3	6	224789	224794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020969	AG	3	6	224820	224825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020969	TC	3	6	239016	239021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020969	AG	3	6	239042	239047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020969	CA	3	6	243966	243971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020969	GT	3	6	244183	244188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020969	GA	3	6	251050	251055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020969	TG	3	6	251160	251165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020969	AG	3	6	251962	251967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020969	AG	3	6	251987	251992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020969	AG	3	6	252970	252975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020969	TA	3	6	254776	254781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020969	TC	3	6	257092	257097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020969	AG	3	6	258570	258575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020969	TA	3	6	264930	264935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020969	CA	3	6	266737	266742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020969	TC	3	6	268637	268642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020969	CT	3	6	274051	274056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020969	TA	3	6	274190	274195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020969	AT	4	8	284750	284757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020969	CT	3	6	285602	285607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020969	TC	4	8	285693	285700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020969	TC	3	6	287384	287389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020969	TC	3	6	287441	287446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020969	CT	3	6	287914	287919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020969	AT	3	6	299928	299933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020969	CA	3	6	302257	302262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020969	AC	3	6	302298	302303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020969	GA	3	6	306988	306993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020969	AG	3	6	316208	316213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020969	CT	3	6	348175	348180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020969	CT	3	6	351247	351252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020969	TC	3	6	355473	355478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020969	CT	3	6	359389	359394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020969	AC	3	6	362722	362727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020969	GA	3	6	364634	364639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020969	TC	3	6	364712	364717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020969	TA	3	6	364914	364919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020969	CT	4	8	382030	382037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020969	CG	3	6	391869	391874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020969	TC	3	6	395466	395471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020969	CT	3	6	395956	395961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020969	GA	3	6	396086	396091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020969	GA	3	6	396217	396222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020969	CT	3	6	410322	410327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020969	CT	3	6	411309	411314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020969	CT	3	6	430037	430042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020969	CT	3	6	431060	431065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020969	AG	3	6	431407	431412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020969	GA	3	6	433102	433107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020969	AC	3	6	437101	437106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020969	CT	3	6	441380	441385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020969	AC	3	6	441418	441423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020969	CA	3	6	443887	443892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020969	CT	3	6	445287	445292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020969	CT	3	6	454569	454574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020969	CT	3	6	457022	457027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020969	AG	3	6	460710	460715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020969	TC	3	6	467248	467253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020969	AT	3	6	467317	467322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020969	GA	4	8	468691	468698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020969	TA	3	6	468734	468739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020969	GA	3	6	468832	468837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020969	AC	3	6	486141	486146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020969	GA	4	8	486186	486193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020969	CA	3	6	486223	486228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020969	TC	3	6	486264	486269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020969	AC	3	6	490699	490704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020969	AG	3	6	490860	490865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020969	CT	3	6	490879	490884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020969	AG	3	6	491172	491177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020969	CT	3	6	494158	494163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020969	CT	3	6	494676	494681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020969	TG	3	6	494709	494714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020969	TA	3	6	494822	494827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020969	CT	4	8	500479	500486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020969	CT	4	8	503446	503453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020969	CA	3	6	508552	508557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020969	CT	3	6	509490	509495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020969	TA	3	6	515296	515301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020969	AG	3	6	517194	517199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.