MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 2615

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020969	TAAG	2	8	993549	993556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_020969	AGA	2	6	993667	993672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_020969	A	6	6	996078	996083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_020969	AAG	2	6	996141	996146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_020969	T	8	8	996147	996154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020969	GTA	2	6	996194	996199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020969	A	6	6	996224	996229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020969	T	6	6	996258	996263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_020969	TGA	2	6	997729	997734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_020969	TAT	2	6	997742	997747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_020969	CCTT	2	8	997772	997779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_020969	A	6	6	999389	999394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_020969	T	7	7	999395	999401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_020969	T	7	7	999404	999410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_020969	T	6	6	999412	999417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_020969	TC	3	6	999433	999438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2517	NC_020969	TAA	2	6	999441	999446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_020969	ATA	2	6	999449	999454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_020969	CTTT	2	8	999489	999496	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2520	NC_020969	GA	3	6	999514	999519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_020969	TCT	2	6	999534	999539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_020969	TTC	2	6	999570	999575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_020969	GGAA	2	8	999591	999598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_020969	GGA	2	6	999604	999609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_020969	ATT	2	6	999619	999624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020969	A	6	6	999893	999898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_020969	AGA	2	6	1002007	1002012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_020969	TAA	2	6	1003370	1003375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_020969	A	6	6	1005219	1005224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_020969	GAAG	2	8	1005234	1005241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_020969	AG	3	6	1005254	1005259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_020969	CGCC	2	8	1006673	1006680	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2533	NC_020969	CGGGG	2	10	1006696	1006705	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2534	NC_020969	CTG	2	6	1008444	1008449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_020969	AG	3	6	1008503	1008508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_020969	CT	3	6	1008517	1008522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_020969	AGT	2	6	1008583	1008588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_020969	TCA	2	6	1008600	1008605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_020969	GAG	2	6	1008673	1008678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_020969	G	6	6	1008678	1008683	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_020969	CAA	2	6	1008717	1008722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_020969	AG	3	6	1008805	1008810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_020969	T	6	6	1008831	1008836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_020969	AAG	2	6	1008837	1008842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_020969	TATTT	2	10	1008854	1008863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_020969	GTG	2	6	1008881	1008886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_020969	T	6	6	1008899	1008904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_020969	GAT	2	6	1008956	1008961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_020969	CTT	2	6	1008996	1009001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_020969	CTGT	2	8	1009069	1009076	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2551	NC_020969	TA	3	6	1009086	1009091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_020969	ATT	2	6	1009116	1009121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_020969	TTG	2	6	1012435	1012440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020969	TAA	2	6	1012452	1012457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020969	AGG	2	6	1018490	1018495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020969	GCA	2	6	1018544	1018549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_020969	AT	3	6	1018570	1018575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020969	AGG	2	6	1018580	1018585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_020969	CAT	2	6	1018596	1018601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_020969	GTA	2	6	1018622	1018627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_020969	GAA	2	6	1018635	1018640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_020969	T	8	8	1018680	1018687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020969	AGA	2	6	1018739	1018744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_020969	AGA	2	6	1018754	1018759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_020969	GGT	2	6	1018828	1018833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_020969	TCT	2	6	1018923	1018928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_020969	GT	3	6	1018943	1018948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_020969	T	6	6	1018974	1018979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_020969	TTA	2	6	1020223	1020228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_020969	T	6	6	1020259	1020264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_020969	TAGAA	2	10	1020282	1020291	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_020969	TCC	2	6	1020303	1020308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2573	NC_020969	AGG	2	6	1020342	1020347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_020969	ATA	2	6	1020359	1020364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_020969	GAAA	2	8	1020406	1020413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_020969	GAT	2	6	1020414	1020419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_020969	TTAA	2	8	1026196	1026203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_020969	AAAG	2	8	1026210	1026217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_020969	AT	3	6	1026219	1026224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_020969	T	6	6	1026241	1026246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_020969	ATT	2	6	1032405	1032410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_020969	AG	3	6	1032422	1032427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_020969	ATT	2	6	1032471	1032476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_020969	T	6	6	1032479	1032484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_020969	TAAT	2	8	1032496	1032503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_020969	TC	3	6	1032508	1032513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2587	NC_020969	TG	3	6	1032520	1032525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_020969	TTCT	2	8	1032547	1032554	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2589	NC_020969	TTTTC	2	10	1038650	1038659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2590	NC_020969	GTT	2	6	1038710	1038715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_020969	GAT	2	6	1038726	1038731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_020969	A	6	6	1038753	1038758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_020969	CT	3	6	1038766	1038771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2594	NC_020969	AG	3	6	1038780	1038785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_020969	CAAA	2	8	1038805	1038812	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2596	NC_020969	T	8	8	1038822	1038829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_020969	A	6	6	1038833	1038838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_020969	AAG	2	6	1038917	1038922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_020969	TGG	2	6	1038951	1038956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_020969	TAC	2	6	1039083	1039088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_020969	CA	3	6	1039183	1039188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_020969	AGA	2	6	1039219	1039224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_020969	TCA	2	6	1039227	1039232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_020969	A	7	7	1039641	1039647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_020969	AG	4	8	1039659	1039666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_020969	AGA	2	6	1042376	1042381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_020969	A	8	8	1042391	1042398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_020969	TAA	2	6	1042400	1042405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_020969	A	6	6	1042520	1042525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_020969	AAT	2	6	1042529	1042534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_020969	TTATT	2	10	1042548	1042557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_020969	T	7	7	1042563	1042569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_020969	TAAAAT	2	12	1042582	1042593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_020969	TTTTA	2	10	1042598	1042607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_020969	GGTT	2	8	1042614	1042621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.