MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 2615

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020969	AAG	2	6	188388	188393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020969	TTG	2	6	188410	188415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020969	CAT	2	6	188420	188425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_020969	T	7	7	188459	188465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020969	TAA	2	6	188538	188543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020969	TTG	2	6	188566	188571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020969	CTC	2	6	188641	188646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_020969	CAC	2	6	188687	188692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_020969	TAC	2	6	188768	188773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_020969	CAT	2	6	188784	188789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_020969	AT	3	6	192720	192725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020969	TGT	2	6	192734	192739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020969	ATGC	2	8	193094	193101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_020969	GTT	2	6	193102	193107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020969	GCA	2	6	193155	193160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_020969	CTTT	2	8	193235	193242	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_020969	AAG	2	6	193282	193287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020969	T	6	6	193332	193337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020969	ATT	2	6	193345	193350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020969	T	6	6	193361	193366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020969	TATGAA	2	12	195337	195348	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020969	AGA	2	6	195393	195398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020969	AAC	2	6	195400	195405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_020969	ATA	2	6	195420	195425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020969	T	7	7	195445	195451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020969	TGA	2	6	195555	195560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020969	CTC	2	6	196635	196640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_020969	GGA	2	6	196691	196696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020969	A	7	7	197475	197481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020969	AG	3	6	197497	197502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020969	AAT	2	6	197507	197512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020969	T	9	9	197527	197535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020969	T	6	6	197574	197579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020969	TAC	2	6	197618	197623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_020969	ATT	2	6	197627	197632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020969	A	8	8	200422	200429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020969	CTT	2	6	200461	200466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_020969	A	8	8	200471	200478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020969	TC	3	6	200489	200494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_020969	CTT	2	6	200498	200503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_020969	ACGA	2	8	203108	203115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_020969	CTAAG	2	10	203274	203283	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
543	NC_020969	T	6	6	203381	203386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020969	GAAA	2	8	203393	203400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020969	A	7	7	203398	203404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020969	CT	3	6	204247	204252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_020969	AAT	2	6	204294	204299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020969	TAG	2	6	204330	204335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020969	AAT	2	6	204343	204348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020969	AAG	2	6	204441	204446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020969	CTT	2	6	204452	204457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_020969	GA	4	8	207308	207315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020969	T	7	7	207338	207344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020969	CT	4	8	207356	207363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_020969	A	6	6	207365	207370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020969	CCTT	2	8	216530	216537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_020969	TTG	2	6	216556	216561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020969	A	6	6	216568	216573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020969	CTC	2	6	217311	217316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_020969	T	8	8	217325	217332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020969	CTA	2	6	217364	217369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_020969	A	7	7	218560	218566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020969	TAA	2	6	218567	218572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020969	AG	4	8	218592	218599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020969	A	6	6	218617	218622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020969	CA	3	6	218651	218656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_020969	TA	3	6	220146	220151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020969	GTC	2	6	220165	220170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_020969	CTAT	2	8	220220	220227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
570	NC_020969	T	6	6	220236	220241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020969	ATT	2	6	220338	220343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020969	TCT	2	6	220364	220369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_020969	GTC	2	6	220392	220397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_020969	TCC	2	6	220416	220421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_020969	ATG	2	6	220439	220444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020969	GCAA	2	8	220464	220471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_020969	A	8	8	221685	221692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020969	TAA	2	6	221740	221745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020969	ATTTC	2	10	221767	221776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
580	NC_020969	CT	3	6	221788	221793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_020969	AATT	2	8	221800	221807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020969	CTTG	2	8	222149	222156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_020969	T	6	6	222204	222209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020969	TC	3	6	224789	224794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_020969	AG	3	6	224820	224825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020969	CAATA	2	10	224890	224899	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
587	NC_020969	TAA	2	6	225863	225868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020969	AAAC	2	8	225879	225886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_020969	T	8	8	228354	228361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020969	AGA	2	6	228552	228557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020969	ATT	2	6	228589	228594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020969	AAC	2	6	234991	234996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_020969	AGA	2	6	235018	235023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020969	GAG	2	6	235035	235040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020969	GCT	2	6	235087	235092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_020969	ACC	2	6	235096	235101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_020969	A	6	6	235127	235132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020969	ACT	2	6	235191	235196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_020969	AG	3	6	239042	239047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020969	CAT	2	6	239111	239116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_020969	T	8	8	239118	239125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020969	CA	3	6	243966	243971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_020969	AAAT	2	8	244115	244122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020969	AAGA	2	8	244134	244141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020969	GT	3	6	244183	244188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020969	T	6	6	244194	244199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020969	AAG	2	6	246725	246730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020969	TTTC	2	8	246735	246742	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
611	NC_020969	TAAA	2	8	247569	247576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020969	ATA	2	6	247591	247596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020969	TTA	2	6	247612	247617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020969	T	6	6	248568	248573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020969	TACAA	2	10	248597	248606	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
616	NC_020969	ATA	2	6	248629	248634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020969	GA	3	6	251050	251055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020969	ACT	2	6	251110	251115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_020969	TG	3	6	251160	251165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020969	AATA	2	8	251227	251234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020969	T	6	6	251249	251254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020969	T	7	7	251268	251274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020969	A	6	6	251276	251281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020969	ACA	2	6	251376	251381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020969	CTT	2	6	251383	251388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_020969	AAG	2	6	251414	251419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020969	GCA	2	6	251433	251438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020969	TTG	2	6	251453	251458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020969	CTC	2	6	251873	251878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_020969	CAA	2	6	251917	251922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_020969	AG	3	6	251962	251967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020969	A	8	8	251968	251975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020969	AG	3	6	251987	251992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020969	TCC	2	6	252825	252830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_020969	GAAA	2	8	252846	252853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020969	T	7	7	252867	252873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020969	GCAG	2	8	252895	252902	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
638	NC_020969	AGAA	2	8	252928	252935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020969	AG	3	6	252970	252975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020969	TAT	2	6	252993	252998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_020969	A	6	6	253083	253088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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