MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/363 complete genome

Total Repeats: 2604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020966	TGT	2	6	194376	194381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020966	ATGC	2	8	194736	194743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_020966	GTT	2	6	194744	194749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020966	GCA	2	6	194797	194802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_020966	CTTT	2	8	194877	194884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_020966	AAG	2	6	194924	194929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020966	T	6	6	194974	194979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020966	ATT	2	6	194987	194992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020966	T	6	6	195003	195008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020966	TATGAA	2	12	196978	196989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020966	AGA	2	6	197034	197039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020966	AAC	2	6	197041	197046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_020966	ATA	2	6	197061	197066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020966	T	7	7	197086	197092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020966	TGA	2	6	197196	197201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020966	CTC	2	6	197969	197974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_020966	CTA	2	6	198291	198296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_020966	ATTT	2	8	198324	198331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020966	A	7	7	198810	198816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020966	AG	3	6	198832	198837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020966	AAT	2	6	198842	198847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020966	T	8	8	198862	198869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020966	T	6	6	198908	198913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020966	TAC	2	6	198952	198957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_020966	ATT	2	6	198961	198966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020966	A	8	8	201756	201763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020966	CTT	2	6	201795	201800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_020966	A	7	7	201805	201811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020966	TC	3	6	201822	201827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_020966	CTT	2	6	201831	201836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020966	ACGA	2	8	204441	204448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
532	NC_020966	CTAAG	2	10	204607	204616	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
533	NC_020966	AGA	2	6	204695	204700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020966	T	6	6	204715	204720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020966	A	7	7	204732	204738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020966	T	6	6	205505	205510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020966	CAT	2	6	205534	205539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_020966	CT	3	6	205580	205585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_020966	AAT	2	6	205627	205632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020966	TAG	2	6	205663	205668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020966	AAT	2	6	205676	205681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020966	AAG	2	6	205774	205779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020966	CTT	2	6	205785	205790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_020966	GA	4	8	208639	208646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020966	T	7	7	208669	208675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020966	CT	4	8	208687	208694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_020966	A	6	6	208696	208701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020966	CCTT	2	8	217861	217868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_020966	GAA	2	6	217883	217888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020966	TTG	2	6	217900	217905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020966	A	6	6	217912	217917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020966	TAC	2	6	218589	218594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_020966	CTT	2	6	218652	218657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_020966	CTC	2	6	218677	218682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_020966	T	7	7	218691	218697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020966	CTA	2	6	218729	218734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_020966	A	7	7	219925	219931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020966	TAA	2	6	219932	219937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020966	AG	4	8	219957	219964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020966	A	6	6	219982	219987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020966	GAA	2	6	219992	219997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020966	TA	3	6	221511	221516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020966	GTC	2	6	221530	221535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_020966	CTAT	2	8	221585	221592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
565	NC_020966	T	6	6	221601	221606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020966	ATT	2	6	221703	221708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020966	TCT	2	6	221728	221733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_020966	TCC	2	6	221780	221785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_020966	ATG	2	6	221803	221808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020966	GCAA	2	8	221828	221835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
571	NC_020966	TTTTAC	2	12	222987	222998	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
572	NC_020966	A	7	7	223050	223056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020966	TAA	2	6	223104	223109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020966	ATTTC	2	10	223131	223140	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
575	NC_020966	CT	3	6	223152	223157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_020966	AATT	2	8	223164	223171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020966	CTTG	2	8	223513	223520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_020966	T	6	6	223568	223573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020966	TC	3	6	226153	226158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_020966	AG	3	6	226184	226189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020966	CAATA	2	10	226254	226263	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
582	NC_020966	TAA	2	6	227227	227232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020966	AAAC	2	8	227243	227250	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_020966	T	8	8	229718	229725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020966	TCCT	2	8	229868	229875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_020966	AGA	2	6	229920	229925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020966	ATT	2	6	229957	229962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020966	AAC	2	6	236359	236364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_020966	AGA	2	6	236386	236391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020966	GAG	2	6	236403	236408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020966	GCT	2	6	236455	236460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_020966	ACC	2	6	236464	236469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_020966	A	6	6	236495	236500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020966	ACT	2	6	236559	236564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020966	TGT	2	6	240364	240369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020966	TC	3	6	240384	240389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_020966	AG	3	6	240410	240415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020966	CAT	2	6	240479	240484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_020966	T	8	8	240486	240493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020966	A	6	6	243581	243586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020966	TCT	2	6	245421	245426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_020966	AAAT	2	8	245485	245492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020966	AAGA	2	8	245504	245511	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020966	GT	3	6	245553	245558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020966	T	6	6	245564	245569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020966	TTTC	2	8	248105	248112	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
607	NC_020966	TAAA	2	8	248939	248946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020966	ATA	2	6	248961	248966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020966	TTA	2	6	248982	248987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020966	AGG	2	6	249043	249048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020966	T	6	6	249939	249944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020966	TACAA	2	10	249968	249977	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
613	NC_020966	ATA	2	6	250000	250005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020966	GA	3	6	252421	252426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020966	GCG	2	6	252461	252466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_020966	ACT	2	6	252481	252486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_020966	TG	3	6	252531	252536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020966	AATA	2	8	252598	252605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020966	T	6	6	252620	252625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020966	T	7	7	252639	252645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020966	A	6	6	252647	252652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020966	ACA	2	6	252747	252752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020966	CTT	2	6	252754	252759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_020966	AAG	2	6	252785	252790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020966	GCA	2	6	252804	252809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_020966	TTG	2	6	252824	252829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020966	CTC	2	6	253244	253249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_020966	CAA	2	6	253288	253293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_020966	AG	3	6	253333	253338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020966	A	8	8	253339	253346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020966	AAG	2	6	253357	253362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020966	TCC	2	6	254197	254202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_020966	T	7	7	254239	254245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020966	TAT	2	6	254365	254370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020966	ACA	2	6	254406	254411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_020966	A	6	6	254455	254460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020966	AAC	2	6	255514	255519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_020966	A	6	6	255528	255533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020966	TAA	2	6	255579	255584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020966	A	8	8	256093	256100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_020966	CCAA	2	8	256177	256184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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