MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 2641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020965	ATT	2	6	193496	193501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020965	T	6	6	193512	193517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020965	TATGAA	2	12	195488	195499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020965	AGA	2	6	195544	195549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020965	AAC	2	6	195551	195556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_020965	ATA	2	6	195571	195576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020965	T	7	7	195596	195602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020965	TGA	2	6	195706	195711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020965	CTC	2	6	196480	196485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_020965	CTA	2	6	196802	196807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_020965	ATTT	2	8	196835	196842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020965	A	7	7	197321	197327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020965	AG	3	6	197343	197348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020965	AAT	2	6	197353	197358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020965	T	8	8	197373	197380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020965	T	6	6	197419	197424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020965	TAC	2	6	197463	197468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_020965	ATT	2	6	197472	197477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020965	A	8	8	200267	200274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020965	CTT	2	6	200306	200311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_020965	A	8	8	200316	200323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020965	TC	3	6	200334	200339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_020965	CTT	2	6	200343	200348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_020965	ACGA	2	8	202953	202960	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_020965	CTAAG	2	10	203119	203128	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
526	NC_020965	T	6	6	203227	203232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020965	GAAA	2	8	203239	203246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020965	A	7	7	203244	203250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020965	T	6	6	204017	204022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020965	CAT	2	6	204046	204051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020965	CT	3	6	204092	204097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_020965	AAT	2	6	204139	204144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020965	TAG	2	6	204175	204180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020965	AAT	2	6	204188	204193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020965	AAG	2	6	204286	204291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020965	CTT	2	6	204297	204302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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538	NC_020965	T	7	7	207181	207187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020965	CT	4	8	207199	207206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_020965	A	6	6	207208	207213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020965	CCTT	2	8	216372	216379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_020965	GAA	2	6	216394	216399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020965	TTG	2	6	216411	216416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020965	A	6	6	216423	216428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020965	CTC	2	6	217190	217195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_020965	A	7	7	218439	218445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020965	TAA	2	6	218446	218451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020965	AG	4	8	218471	218478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020965	A	6	6	218496	218501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020965	GAA	2	6	218506	218511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020965	TA	3	6	220025	220030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020965	GTC	2	6	220044	220049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_020965	CTAT	2	8	220099	220106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
554	NC_020965	T	6	6	220115	220120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020965	ATT	2	6	220217	220222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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557	NC_020965	TCC	2	6	220294	220299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_020965	ATG	2	6	220317	220322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020965	GCAA	2	8	220342	220349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_020965	TTTTAC	2	12	221501	221512	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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562	NC_020965	TAA	2	6	221617	221622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020965	ATTTC	2	10	221644	221653	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
564	NC_020965	CT	3	6	221665	221670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_020965	AATT	2	8	221677	221684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020965	CTTG	2	8	222026	222033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_020965	T	6	6	222081	222086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_020965	AG	3	6	224697	224702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_020965	T	8	8	228231	228238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020965	TGT	2	6	228300	228305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020965	TCCT	2	8	228381	228388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_020965	AGA	2	6	228433	228438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020965	ATT	2	6	228470	228475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_020965	AGA	2	6	234899	234904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020965	GAG	2	6	234916	234921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_020965	CAT	2	6	238992	238997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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591	NC_020965	AAAT	2	8	243996	244003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020965	AAGA	2	8	244015	244022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020965	GT	3	6	244064	244069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020965	T	6	6	244075	244080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020965	AAG	2	6	246606	246611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_020965	ATA	2	6	247472	247477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020965	TTA	2	6	247493	247498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020965	T	6	6	248450	248455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020965	TACAA	2	10	248479	248488	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
602	NC_020965	ATA	2	6	248511	248516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020965	GA	3	6	250932	250937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020965	ACT	2	6	250992	250997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_020965	TG	3	6	251042	251047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020965	AATA	2	8	251109	251116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020965	T	6	6	251131	251136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020965	T	7	7	251150	251156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020965	A	6	6	251158	251163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020965	ACA	2	6	251258	251263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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613	NC_020965	GCA	2	6	251315	251320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_020965	TTG	2	6	251335	251340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020965	CTC	2	6	251755	251760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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617	NC_020965	AG	3	6	251844	251849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020965	A	8	8	251850	251857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020965	AAG	2	6	251868	251873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020965	TCC	2	6	252708	252713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_020965	GAAA	2	8	252729	252736	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020965	T	7	7	252750	252756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020965	GCAG	2	8	252778	252785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
624	NC_020965	AGAA	2	8	252811	252818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020965	AG	3	6	252853	252858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020965	TAT	2	6	252876	252881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020965	ACA	2	6	252917	252922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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631	NC_020965	TAA	2	6	254090	254095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020965	A	8	8	254610	254617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020965	TA	3	6	254659	254664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020965	CCAA	2	8	254694	254701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_020965	A	7	7	254718	254724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020965	A	7	7	255159	255165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020965	ATA	2	6	255172	255177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020965	AACCCT	2	12	255218	255229	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_020965	AAAC	2	8	255292	255299	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
640	NC_020965	ATTTTT	2	12	256013	256024	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_020965	TAT	2	6	256845	256850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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