MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SotonF3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 1184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020964	AAG	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020964	TGG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020964	CTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020964	TAA	2	6	2251	2256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020964	GCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020964	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020964	CTT	2	6	6960	6965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020964	TTA	2	6	7752	7757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020964	GAA	2	6	7801	7806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020964	ATG	2	6	7837	7842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020964	TTC	3	9	9775	9783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020964	ATC	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020964	GAA	2	6	9829	9834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020964	CCT	2	6	9930	9935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_020964	TAG	2	6	11793	11798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020964	CTT	2	6	11843	11848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020964	TCA	2	6	11880	11885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020964	AAT	2	6	13866	13871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020964	ACC	2	6	13877	13882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020964	ATT	2	6	13974	13979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020964	AAG	2	6	13991	13996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020964	TTA	2	6	14017	14022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020964	AAG	2	6	14051	14056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020964	AAC	2	6	14135	14140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020964	CTT	2	6	15558	15563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020964	GTT	2	6	18231	18236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020964	AGA	2	6	18977	18982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020964	AAT	3	9	19039	19047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020964	TCT	2	6	19067	19072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020964	CTT	3	9	20493	20501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020964	GAA	2	6	21018	21023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020964	GGA	2	6	21212	21217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020964	AGA	3	9	21252	21260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020964	TGG	2	6	21471	21476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020964	AAC	2	6	21510	21515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020964	AGC	2	6	21527	21532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020964	TGA	2	6	21728	21733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020964	TCC	2	6	21845	21850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_020964	AAT	2	6	22021	22026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020964	TTA	2	6	25174	25179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020964	ACT	2	6	27128	27133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020964	TAA	2	6	28481	28486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020964	AGA	2	6	28593	28598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020964	CTG	2	6	33722	33727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020964	CTT	2	6	37079	37084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020964	TAA	2	6	39417	39422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020964	AAG	2	6	39458	39463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020964	CTC	2	6	40736	40741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_020964	AAG	2	6	40821	40826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020964	GAT	2	6	43276	43281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020964	AAG	2	6	43282	43287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020964	GGA	2	6	43334	43339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020964	TAA	2	6	43432	43437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020964	AAG	2	6	44573	44578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020964	GGA	2	6	44617	44622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020964	ACT	2	6	44664	44669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020964	AAG	2	6	46515	46520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020964	GCA	2	6	46525	46530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020964	TAA	2	6	48588	48593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020964	TGT	2	6	48665	48670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020964	GTC	2	6	49343	49348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020964	AAG	2	6	49365	49370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020964	TAT	2	6	49394	49399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020964	AGA	2	6	50164	50169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020964	AAG	2	6	50226	50231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020964	TCT	2	6	50240	50245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020964	AAT	2	6	50316	50321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020964	TGT	2	6	50338	50343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020964	GCC	2	6	50385	50390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020964	ATT	2	6	50434	50439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020964	CAA	2	6	50453	50458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020964	TAA	2	6	52011	52016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020964	AGT	3	9	52079	52087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020964	GAT	2	6	52732	52737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020964	AAG	2	6	52810	52815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020964	AAT	2	6	52837	52842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020964	ATT	2	6	52849	52854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020964	CTT	2	6	57956	57961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020964	TCC	2	6	58016	58021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_020964	TAA	2	6	61371	61376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020964	AAG	2	6	61433	61438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020964	AGG	2	6	61441	61446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020964	ACA	2	6	69241	69246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020964	AAG	2	6	69689	69694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020964	TTC	2	6	69748	69753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020964	CTT	3	9	69757	69765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020964	AGA	2	6	72436	72441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020964	CGT	2	6	72484	72489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020964	AAG	2	6	75277	75282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020964	ACT	2	6	75292	75297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020964	AGT	2	6	75328	75333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020964	CTT	2	6	77297	77302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020964	GAG	3	9	79057	79065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020964	AGG	2	6	79088	79093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020964	ACC	2	6	79139	79144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_020964	TTA	2	6	79790	79795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020964	CAT	2	6	79991	79996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020964	TAG	2	6	80007	80012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020964	TTC	2	6	80041	80046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020964	GTT	2	6	80059	80064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020964	GTT	2	6	80101	80106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020964	ATT	2	6	80110	80115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020964	AGG	2	6	80240	80245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020964	TAG	2	6	80312	80317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020964	GTG	2	6	85658	85663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020964	GTA	2	6	85682	85687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020964	AGC	2	6	85754	85759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020964	ATT	2	6	88618	88623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020964	AAC	2	6	88709	88714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020964	ATT	2	6	91124	91129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020964	GAA	2	6	91143	91148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020964	AAG	3	9	91183	91191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020964	AGT	2	6	92537	92542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020964	GGA	2	6	92566	92571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020964	GTT	2	6	93483	93488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020964	TGA	2	6	93533	93538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020964	AGA	2	6	93551	93556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020964	GAG	2	6	93576	93581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020964	AGA	2	6	93602	93607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020964	CCA	2	6	93633	93638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_020964	AAG	2	6	93661	93666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020964	GAA	2	6	93697	93702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020964	TGA	2	6	93753	93758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020964	TAA	2	6	93783	93788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020964	AGC	2	6	93902	93907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020964	AGT	2	6	93934	93939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020964	GAA	2	6	94048	94053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020964	TGA	2	6	94059	94064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020964	TAA	2	6	94185	94190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020964	TAA	2	6	94607	94612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020964	TAA	2	6	94680	94685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020964	ATT	3	9	94898	94906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020964	TTA	2	6	98267	98272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020964	AAT	2	6	100142	100147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020964	GAA	2	6	100595	100600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020964	TTA	2	6	102703	102708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020964	TCT	2	6	103989	103994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020964	TAA	3	9	107415	107423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020964	CTT	2	6	107459	107464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020964	CTC	2	6	114527	114532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_020964	ATT	2	6	114623	114628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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