MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SotonF3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020964	TAC	2	6	188953	188958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_020964	CAT	2	6	188969	188974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_020964	AT	3	6	192905	192910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020964	TGT	2	6	192919	192924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020964	ATGC	2	8	193279	193286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_020964	GTT	2	6	193287	193292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020964	GCA	2	6	193340	193345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020964	CTTT	2	8	193420	193427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_020964	AAG	2	6	193467	193472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020964	T	6	6	193517	193522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020964	ATT	2	6	193530	193535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020964	T	6	6	193546	193551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020964	TATGAA	2	12	195522	195533	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020964	AGA	2	6	195578	195583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020964	AAC	2	6	195585	195590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_020964	ATA	2	6	195605	195610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020964	T	7	7	195630	195636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020964	TGA	2	6	195740	195745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020964	CTC	2	6	196512	196517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_020964	CTA	2	6	196834	196839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_020964	ATTT	2	8	196867	196874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020964	A	7	7	197353	197359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020964	AG	3	6	197375	197380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020964	AAT	2	6	197385	197390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020964	T	8	8	197405	197412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020964	T	6	6	197451	197456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020964	TAC	2	6	197495	197500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_020964	ATT	2	6	197504	197509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020964	A	8	8	200299	200306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020964	CTT	2	6	200338	200343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020964	A	8	8	200348	200355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020964	TC	3	6	200366	200371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_020964	CTT	2	6	200375	200380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_020964	ACGA	2	8	202985	202992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
535	NC_020964	CTAAG	2	10	203151	203160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
536	NC_020964	T	6	6	203259	203264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020964	GAAA	2	8	203271	203278	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020964	A	7	7	203276	203282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020964	T	6	6	204049	204054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020964	CAT	2	6	204078	204083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_020964	CT	3	6	204124	204129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_020964	AAT	2	6	204171	204176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020964	TAG	2	6	204207	204212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020964	AAT	2	6	204220	204225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020964	AAG	2	6	204318	204323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020964	CTT	2	6	204329	204334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_020964	GA	4	8	207183	207190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020964	T	7	7	207213	207219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020964	CT	4	8	207231	207238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_020964	A	6	6	207240	207245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020964	CCTT	2	8	216405	216412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_020964	TTG	2	6	216431	216436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020964	A	6	6	216443	216448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020964	CTC	2	6	217186	217191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_020964	T	8	8	217200	217207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020964	CTA	2	6	217239	217244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_020964	A	7	7	218435	218441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020964	TAA	2	6	218442	218447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020964	AG	4	8	218467	218474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020964	A	6	6	218492	218497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020964	CA	3	6	218526	218531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_020964	TA	3	6	220021	220026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020964	GTC	2	6	220040	220045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_020964	CTAT	2	8	220095	220102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
565	NC_020964	T	6	6	220111	220116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020964	ATT	2	6	220213	220218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020964	TCT	2	6	220239	220244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_020964	GTC	2	6	220267	220272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_020964	TCC	2	6	220291	220296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_020964	ATG	2	6	220314	220319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020964	GCAA	2	8	220339	220346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_020964	TTTTAC	2	12	221497	221508	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
573	NC_020964	A	8	8	221560	221567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020964	TAA	2	6	221615	221620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020964	ATTTC	2	10	221642	221651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
576	NC_020964	CT	3	6	221663	221668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_020964	AATT	2	8	221675	221682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020964	CTTG	2	8	222024	222031	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_020964	T	6	6	222079	222084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020964	TC	3	6	224664	224669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_020964	AG	3	6	224695	224700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020964	CAATA	2	10	224765	224774	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
583	NC_020964	TAA	2	6	225738	225743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020964	AAAC	2	8	225754	225761	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_020964	T	8	8	228229	228236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020964	AGA	2	6	228427	228432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020964	ATT	2	6	228464	228469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020964	AAC	2	6	234866	234871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_020964	AGA	2	6	234893	234898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020964	GAG	2	6	234910	234915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020964	GCT	2	6	234962	234967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_020964	ACC	2	6	234971	234976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_020964	A	6	6	235002	235007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020964	ACT	2	6	235066	235071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020964	TGT	2	6	238871	238876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020964	TC	3	6	238891	238896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_020964	AG	3	6	238917	238922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020964	CAT	2	6	238986	238991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_020964	T	8	8	238993	239000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020964	CA	3	6	243841	243846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_020964	AAAT	2	8	243990	243997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020964	AAGA	2	8	244009	244016	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020964	GT	3	6	244058	244063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020964	T	6	6	244069	244074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020964	AAG	2	6	246600	246605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020964	TTTC	2	8	246610	246617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
607	NC_020964	TAAA	2	8	247444	247451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020964	ATA	2	6	247466	247471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020964	TTA	2	6	247487	247492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020964	T	6	6	248443	248448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020964	TACAA	2	10	248472	248481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
612	NC_020964	ATA	2	6	248504	248509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020964	GA	3	6	250925	250930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020964	ACT	2	6	250985	250990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_020964	TG	3	6	251035	251040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020964	AATA	2	8	251102	251109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020964	T	6	6	251124	251129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020964	T	7	7	251143	251149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020964	A	6	6	251151	251156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020964	ACA	2	6	251251	251256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_020964	CTT	2	6	251258	251263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_020964	AAG	2	6	251289	251294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020964	GCA	2	6	251308	251313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_020964	TTG	2	6	251328	251333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020964	CTC	2	6	251748	251753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_020964	CAA	2	6	251792	251797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020964	AG	3	6	251837	251842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020964	A	8	8	251843	251850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020964	AG	3	6	251862	251867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020964	TCC	2	6	252700	252705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_020964	GAAA	2	8	252721	252728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020964	T	7	7	252742	252748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020964	GCAG	2	8	252770	252777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_020964	AGAA	2	8	252803	252810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020964	AG	3	6	252845	252850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020964	TAT	2	6	252868	252873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020964	ACA	2	6	252909	252914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_020964	A	6	6	252958	252963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020964	AAC	2	6	254017	254022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_020964	A	6	6	254031	254036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_020964	A	8	8	254602	254609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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