MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/7249 complete genome

Total Repeats: 1201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020944	AAG	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020944	TGG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020944	CTT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020944	TAA	2	6	2245	2250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020944	GCA	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020944	AGA	2	6	5676	5681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020944	CTT	2	6	6956	6961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020944	TTA	2	6	7748	7753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020944	GAA	2	6	7797	7802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020944	ATG	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020944	TTC	3	9	9771	9779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020944	ATC	2	6	9787	9792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020944	GAA	2	6	9825	9830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020944	CCT	2	6	9925	9930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_020944	TAG	2	6	11786	11791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020944	CTT	2	6	11836	11841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020944	TCA	2	6	11872	11877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020944	AAT	2	6	13858	13863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020944	ACC	2	6	13869	13874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020944	ATT	2	6	13966	13971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020944	AAG	2	6	13983	13988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020944	TTA	2	6	14009	14014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020944	AAG	2	6	14043	14048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020944	AAC	2	6	14127	14132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020944	CTT	2	6	15550	15555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020944	GTT	2	6	18223	18228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020944	GAA	2	6	18967	18972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020944	AAT	3	9	19031	19039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020944	TCT	2	6	19059	19064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020944	CTT	3	9	20485	20493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020944	GAA	2	6	21010	21015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020944	GGA	2	6	21204	21209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020944	AGA	3	9	21244	21252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020944	TGG	2	6	21463	21468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020944	AAC	2	6	21502	21507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020944	AGC	2	6	21519	21524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020944	AGG	2	6	21608	21613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020944	TGA	2	6	21720	21725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020944	TCC	2	6	21837	21842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020944	AAT	2	6	22013	22018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020944	TTA	2	6	25166	25171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020944	ACT	2	6	27120	27125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020944	TAA	2	6	28473	28478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020944	AGA	2	6	28585	28590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020944	CTG	2	6	33713	33718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020944	CTT	2	6	37070	37075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020944	TAA	2	6	39408	39413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020944	AAG	2	6	39449	39454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020944	CTC	2	6	40727	40732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_020944	AAG	2	6	40812	40817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020944	ATG	2	6	42968	42973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020944	GAG	2	6	42982	42987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020944	ACC	2	6	43126	43131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_020944	GAT	2	6	43267	43272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020944	AAG	2	6	43273	43278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020944	GGA	2	6	43325	43330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020944	TAA	2	6	43423	43428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020944	AAG	2	6	44564	44569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020944	GGA	2	6	44608	44613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020944	ACT	2	6	44655	44660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020944	AAG	2	6	46506	46511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020944	TAA	2	6	48578	48583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020944	GAA	2	6	48594	48599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020944	TGT	2	6	48653	48658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020944	GTC	2	6	49332	49337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020944	AAG	2	6	49354	49359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020944	TAT	2	6	49383	49388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020944	AGA	2	6	50152	50157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020944	AAG	2	6	50214	50219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020944	TCT	2	6	50228	50233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020944	ACT	2	6	50269	50274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020944	AAT	2	6	50304	50309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020944	TGT	2	6	50326	50331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020944	GCC	2	6	50373	50378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_020944	ATT	2	6	50422	50427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020944	CAA	2	6	50441	50446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020944	TAA	2	6	51998	52003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020944	AGT	3	9	52065	52073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020944	GAT	2	6	52610	52615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020944	AAG	2	6	52688	52693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020944	AAT	2	6	52715	52720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020944	ATT	2	6	52727	52732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020944	TCC	2	6	57957	57962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_020944	TAA	2	6	61311	61316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020944	AAG	2	6	61373	61378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020944	AGG	2	6	61381	61386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020944	TTC	2	6	68775	68780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020944	GGA	4	12	68807	68818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020944	CAG	2	6	68865	68870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020944	ACA	2	6	69181	69186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020944	TTC	2	6	69688	69693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020944	CTT	3	9	69697	69705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020944	AGA	2	6	72376	72381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020944	CGT	2	6	72424	72429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020944	AAG	2	6	75217	75222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020944	ACT	2	6	75232	75237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020944	AGT	2	6	75268	75273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020944	CTT	2	6	77237	77242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020944	GAG	3	9	78991	78999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020944	AGG	2	6	79022	79027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020944	ACC	2	6	79073	79078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020944	TTA	2	6	79725	79730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020944	CAT	2	6	79926	79931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020944	TAG	2	6	79942	79947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020944	TTC	2	6	79976	79981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020944	GTT	2	6	79994	79999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020944	GTT	2	6	80036	80041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020944	ATT	2	6	80045	80050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020944	AGG	2	6	80175	80180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020944	TAG	2	6	80247	80252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020944	GTG	2	6	85592	85597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020944	GTA	2	6	85616	85621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020944	AGC	2	6	85688	85693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020944	ATT	2	6	88552	88557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020944	AAC	2	6	88643	88648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020944	ATT	2	6	91058	91063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020944	GAA	2	6	91077	91082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020944	AAG	3	9	91117	91125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020944	AGT	2	6	92471	92476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020944	GGA	2	6	92500	92505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020944	GTT	2	6	93417	93422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020944	TGA	2	6	93467	93472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020944	AGA	2	6	93485	93490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020944	GAG	2	6	93510	93515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020944	AGA	2	6	93536	93541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020944	CCA	2	6	93567	93572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_020944	AAG	2	6	93595	93600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020944	GAA	2	6	93631	93636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020944	TGA	2	6	93687	93692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020944	TAA	2	6	93717	93722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020944	AGC	2	6	93836	93841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020944	AGT	2	6	93868	93873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020944	GAA	2	6	93982	93987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020944	TGA	2	6	93993	93998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020944	TAA	2	6	94119	94124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020944	TAA	2	6	94541	94546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020944	TAA	2	6	94614	94619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020944	ATT	3	9	94831	94839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020944	TTA	2	6	98200	98205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020944	GAA	2	6	100527	100532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020944	TTA	2	6	102635	102640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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