MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/7249 complete genome

Total Repeats: 2639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020944	CCA	2	6	418231	418236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_020944	GCA	2	6	418285	418290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_020944	GTATA	2	10	418291	418300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020944	AGCAA	2	10	418327	418336	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_020944	ATTT	2	8	418362	418369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020944	AGAA	2	8	418372	418379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020944	A	7	7	420135	420141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020944	CAA	2	6	420154	420159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_020944	ATTA	2	8	420161	420168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020944	AAC	2	6	420170	420175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_020944	AAAAT	2	10	420176	420185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020944	A	7	7	420198	420204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020944	A	6	6	420243	420248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020944	T	8	8	425727	425734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020944	TGC	2	6	425738	425743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1017	NC_020944	GAA	2	6	426563	426568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020944	A	7	7	426582	426588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020944	T	6	6	426591	426596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020944	GTT	2	6	426628	426633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020944	AGG	2	6	428078	428083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020944	AGG	2	6	428680	428685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020944	CGT	2	6	430158	430163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_020944	TTCT	2	8	430216	430223	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_020944	CTCTT	2	10	430237	430246	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1027	NC_020944	T	7	7	430286	430292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1029	NC_020944	A	6	6	431388	431393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020944	T	6	6	431404	431409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020944	CT	3	6	432401	432406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1033	NC_020944	GAT	2	6	432480	432485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1035	NC_020944	AAG	2	6	432577	432582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020944	A	7	7	432733	432739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020944	AG	3	6	432748	432753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1040	NC_020944	A	7	7	432801	432807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1044	NC_020944	A	8	8	437540	437547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1047	NC_020944	AGAAA	2	10	438454	438463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020944	A	7	7	438482	438488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020944	CTCTT	2	10	438493	438502	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1050	NC_020944	GAAGA	2	10	438503	438512	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020944	ATG	2	6	438522	438527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_020944	TAT	2	6	438746	438751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020944	A	6	6	438774	438779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020944	AAATT	2	10	438782	438791	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020944	AATTT	2	10	438803	438812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1064	NC_020944	TTC	2	6	442744	442749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_020944	AC	3	6	442750	442755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_020944	ACA	2	6	444843	444848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_020944	CA	3	6	445219	445224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_020944	TAAC	2	8	445227	445234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_020944	CAA	2	6	445235	445240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1072	NC_020944	TCT	2	6	445313	445318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_020944	T	6	6	445332	445337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_020944	A	6	6	455890	455895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_020944	GAA	2	6	461884	461889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020944	A	6	6	461914	461919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020944	TAA	2	6	461935	461940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020944	T	6	6	462000	462005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020944	AG	3	6	462045	462050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020944	TTC	2	6	464436	464441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_020944	AAC	2	6	464449	464454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_020944	ACA	2	6	466835	466840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_020944	A	6	6	466926	466931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020944	AAG	2	6	466971	466976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020944	TAAAA	2	10	467014	467023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020944	A	8	8	467067	467074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020944	CAC	2	6	467076	467081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1116	NC_020944	AGG	2	6	467184	467189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020944	A	6	6	468561	468566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020944	TTCT	2	8	468567	468574	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_020944	TC	3	6	468583	468588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_020944	CAAA	2	8	468592	468599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_020944	A	6	6	468604	468609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020944	ATA	2	6	468613	468618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020944	AT	3	6	468652	468657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020944	GA	4	8	470026	470033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020944	TGA	2	6	470047	470052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020944	TA	3	6	470069	470074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020944	T	6	6	470138	470143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020944	TAT	2	6	470145	470150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020944	GA	3	6	470167	470172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020944	CTT	2	6	470184	470189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1132	NC_020944	TTC	2	6	471541	471546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_020944	TAC	2	6	471559	471564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_020944	GTT	2	6	471570	471575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020944	A	6	6	473419	473424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020944	TCT	2	6	476566	476571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_020944	TC	3	6	481900	481905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1138	NC_020944	T	8	8	481937	481944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_020944	ATC	2	6	481968	481973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1141	NC_020944	A	6	6	487439	487444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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