MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD5 complete genome

Total Repeats: 2654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020943	AAG	2	6	193174	193179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020943	T	6	6	193224	193229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020943	ATT	2	6	193237	193242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020943	T	6	6	193253	193258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020943	TATGAA	2	12	195229	195240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020943	AGA	2	6	195285	195290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020943	AAC	2	6	195292	195297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020943	ATA	2	6	195312	195317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020943	T	7	7	195337	195343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020943	TGA	2	6	195447	195452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020943	CTC	2	6	196221	196226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_020943	CTA	2	6	196543	196548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_020943	ATTT	2	8	196576	196583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020943	A	7	7	197062	197068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020943	AG	3	6	197084	197089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020943	AAT	2	6	197094	197099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020943	T	8	8	197114	197121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020943	T	6	6	197160	197165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020943	TAC	2	6	197204	197209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_020943	ATT	2	6	197213	197218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020943	A	8	8	200008	200015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020943	CTT	2	6	200047	200052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_020943	A	8	8	200057	200064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020943	TC	3	6	200075	200080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_020943	CTT	2	6	200084	200089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020943	ACGA	2	8	202694	202701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
527	NC_020943	CTAAG	2	10	202860	202869	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
528	NC_020943	T	6	6	202968	202973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020943	GAAA	2	8	202980	202987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020943	A	7	7	202985	202991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020943	T	6	6	203758	203763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020943	CAT	2	6	203787	203792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_020943	CT	3	6	203833	203838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_020943	AAT	2	6	203880	203885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020943	TAG	2	6	203916	203921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020943	AAT	2	6	203929	203934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020943	AAG	2	6	204027	204032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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541	NC_020943	CT	4	8	206940	206947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_020943	A	6	6	206949	206954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020943	CCTT	2	8	216114	216121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_020943	GAA	2	6	216136	216141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020943	TTG	2	6	216153	216158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020943	A	6	6	216165	216170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020943	CTC	2	6	216932	216937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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549	NC_020943	TAA	2	6	218188	218193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020943	AG	4	8	218213	218220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020943	A	6	6	218238	218243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020943	GAA	2	6	218248	218253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020943	TA	3	6	219767	219772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020943	GTC	2	6	219786	219791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_020943	CTAT	2	8	219841	219848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_020943	T	6	6	219857	219862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020943	ATT	2	6	219959	219964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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560	NC_020943	ATG	2	6	220059	220064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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562	NC_020943	TTTTAC	2	12	221243	221254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
563	NC_020943	A	7	7	221305	221311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020943	TAA	2	6	221359	221364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020943	ATTTC	2	10	221386	221395	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
566	NC_020943	CT	3	6	221407	221412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_020943	AATT	2	8	221419	221426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_020943	T	6	6	221823	221828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_020943	TAA	2	6	225482	225487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_020943	AGA	2	6	234641	234646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020943	GAG	2	6	234658	234663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_020943	CA	3	6	243589	243594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_020943	AAAT	2	8	243738	243745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020943	AAGA	2	8	243757	243764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020943	GT	3	6	243806	243811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_020943	T	6	6	248192	248197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020943	TACAA	2	10	248221	248230	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
604	NC_020943	ATA	2	6	248253	248258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_020943	ACT	2	6	250734	250739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_020943	TG	3	6	250784	250789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020943	AATA	2	8	250851	250858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020943	T	6	6	250873	250878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020943	T	7	7	250892	250898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020943	A	6	6	250900	250905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_020943	CTC	2	6	251497	251502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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619	NC_020943	AG	3	6	251586	251591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020943	A	8	8	251592	251599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020943	AAG	2	6	251610	251615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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623	NC_020943	GAAA	2	8	252471	252478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020943	T	7	7	252492	252498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020943	GCAG	2	8	252520	252527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
626	NC_020943	AGAA	2	8	252553	252560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020943	AG	3	6	252595	252600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020943	TAT	2	6	252618	252623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_020943	A	6	6	253781	253786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020943	TAA	2	6	253832	253837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020943	A	8	8	254352	254359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020943	TA	3	6	254401	254406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_020943	A	7	7	254460	254466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020943	A	7	7	254901	254907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020943	ATA	2	6	254914	254919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020943	AACCCT	2	12	254960	254971	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
641	NC_020943	AAAC	2	8	255034	255041	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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