MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 2649

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020941	A	6	6	982087	982092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_020941	TCC	2	6	982135	982140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_020941	GGAA	2	8	982160	982167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_020941	TA	3	6	982176	982181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_020941	ATT	2	6	982188	982193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020941	T	7	7	982235	982241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020941	A	7	7	982247	982253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020941	TCT	2	6	982288	982293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_020941	GAA	2	6	982298	982303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_020941	ATA	2	6	982331	982336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_020941	CTT	2	6	982434	982439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_020941	T	8	8	982459	982466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_020941	GAA	2	6	984666	984671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_020941	CTT	2	6	984741	984746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_020941	T	8	8	984806	984813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_020941	TTTA	2	8	984860	984867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_020941	TAAAA	2	10	984875	984884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_020941	AGA	2	6	984918	984923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_020941	ATA	2	6	984934	984939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_020941	CAG	2	6	990207	990212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_020941	GAAA	2	8	990219	990226	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_020941	CTT	2	6	990231	990236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_020941	T	6	6	990238	990243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_020941	ATA	2	6	990273	990278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_020941	AT	3	6	990289	990294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020941	AAT	2	6	990297	990302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_020941	GA	3	6	993100	993105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_020941	TTA	2	6	993112	993117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_020941	CT	3	6	993121	993126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2530	NC_020941	T	8	8	993126	993133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_020941	GT	3	6	993134	993139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_020941	CTAA	2	8	993155	993162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2533	NC_020941	TAAG	2	8	993170	993177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_020941	AGA	2	6	993288	993293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_020941	A	6	6	995699	995704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_020941	AAG	2	6	995762	995767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_020941	T	8	8	995768	995775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_020941	GTA	2	6	995815	995820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_020941	A	6	6	995845	995850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_020941	T	6	6	995879	995884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_020941	TGA	2	6	997350	997355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_020941	TAT	2	6	997363	997368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_020941	CCTT	2	8	997393	997400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2544	NC_020941	A	6	6	999010	999015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_020941	T	7	7	999016	999022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_020941	T	7	7	999025	999031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_020941	T	6	6	999033	999038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_020941	TC	3	6	999054	999059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2549	NC_020941	TAA	2	6	999062	999067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_020941	ATA	2	6	999070	999075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_020941	CTTT	2	8	999110	999117	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2552	NC_020941	GA	3	6	999135	999140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_020941	TCT	2	6	999155	999160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_020941	TTC	2	6	999191	999196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_020941	GGAA	2	8	999212	999219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020941	GGA	2	6	999225	999230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_020941	ATT	2	6	999240	999245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020941	A	6	6	999514	999519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_020941	AGA	2	6	1001628	1001633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_020941	TGG	2	6	1002888	1002893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_020941	AAG	2	6	1002905	1002910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_020941	TAA	2	6	1002992	1002997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020941	T	8	8	1003017	1003024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_020941	A	6	6	1004841	1004846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_020941	GAAG	2	8	1004856	1004863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_020941	AG	3	6	1004876	1004881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_020941	CGCC	2	8	1006295	1006302	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2568	NC_020941	CGGGG	2	10	1006318	1006327	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2569	NC_020941	CTG	2	6	1008066	1008071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_020941	AG	3	6	1008125	1008130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_020941	CT	3	6	1008139	1008144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2572	NC_020941	AGT	2	6	1008205	1008210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_020941	TCA	2	6	1008222	1008227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_020941	GAG	2	6	1008295	1008300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_020941	G	7	7	1008300	1008306	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_020941	CAA	2	6	1008340	1008345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_020941	AG	3	6	1008428	1008433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_020941	T	6	6	1008454	1008459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_020941	AAG	2	6	1008460	1008465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_020941	TATTT	2	10	1008477	1008486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_020941	GTG	2	6	1008504	1008509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_020941	T	6	6	1008522	1008527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_020941	GAT	2	6	1008579	1008584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_020941	CTT	2	6	1008619	1008624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_020941	CTGT	2	8	1008692	1008699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2586	NC_020941	TA	3	6	1008709	1008714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_020941	ATT	2	6	1008739	1008744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_020941	TAA	2	6	1010124	1010129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_020941	TTG	2	6	1012058	1012063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_020941	TAA	2	6	1012075	1012080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_020941	AGG	2	6	1018113	1018118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_020941	GCA	2	6	1018167	1018172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_020941	AT	3	6	1018193	1018198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_020941	AGG	2	6	1018203	1018208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_020941	CAT	2	6	1018219	1018224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_020941	GTA	2	6	1018245	1018250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_020941	GAA	2	6	1018258	1018263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_020941	T	8	8	1018303	1018310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_020941	AGA	2	6	1018362	1018367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_020941	AGA	2	6	1018377	1018382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_020941	GGT	2	6	1018451	1018456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_020941	TCT	2	6	1018546	1018551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_020941	GT	3	6	1018566	1018571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_020941	T	6	6	1018597	1018602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_020941	TTA	2	6	1019846	1019851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_020941	T	6	6	1019882	1019887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_020941	TAGAA	2	10	1019905	1019914	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_020941	TCC	2	6	1019926	1019931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2609	NC_020941	AGG	2	6	1019965	1019970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_020941	ATA	2	6	1019982	1019987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_020941	GAAA	2	8	1020029	1020036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_020941	GAT	2	6	1020037	1020042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_020941	TTAA	2	8	1025819	1025826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_020941	AAAG	2	8	1025833	1025840	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_020941	AT	3	6	1025842	1025847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_020941	T	6	6	1025864	1025869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_020941	ATT	2	6	1032029	1032034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_020941	AG	3	6	1032046	1032051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_020941	ATT	2	6	1032094	1032099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_020941	T	6	6	1032102	1032107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_020941	TAAT	2	8	1032119	1032126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_020941	TC	3	6	1032131	1032136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_020941	TG	3	6	1032143	1032148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_020941	TTTTC	2	10	1038279	1038288	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2625	NC_020941	GTT	2	6	1038339	1038344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_020941	GAT	2	6	1038355	1038360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_020941	A	6	6	1038382	1038387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_020941	CT	3	6	1038395	1038400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2629	NC_020941	AG	3	6	1038409	1038414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_020941	CAAA	2	8	1038434	1038441	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2631	NC_020941	T	8	8	1038451	1038458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_020941	A	6	6	1038462	1038467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_020941	AAG	2	6	1038546	1038551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_020941	TGG	2	6	1038580	1038585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_020941	ATTTTT	2	12	1038588	1038599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_020941	AAT	2	6	1038600	1038605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2637	NC_020941	A	6	6	1038606	1038611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_020941	TTA	2	6	1038644	1038649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_020941	TAC	2	6	1038712	1038717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2640	NC_020941	CA	3	6	1038812	1038817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2641	NC_020941	AGA	2	6	1038848	1038853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2642	NC_020941	TCA	2	6	1038856	1038861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2643	NC_020941	A	7	7	1039270	1039276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2644	NC_020941	AG	4	8	1039288	1039295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2645	NC_020941	AGA	2	6	1042005	1042010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2646	NC_020941	A	8	8	1042020	1042027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2647	NC_020941	TAA	2	6	1042029	1042034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2648	NC_020941	A	6	6	1042149	1042154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2649	NC_020941	AAT	2	6	1042158	1042163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.