MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 2649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020941	A	6	6	607148	607153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020941	AT	3	6	607882	607887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020941	TTC	2	6	607899	607904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_020941	T	6	6	607935	607940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020941	A	10	10	607988	607997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020941	T	7	7	611107	611113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020941	ACC	2	6	611128	611133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_020941	ACT	2	6	611159	611164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_020941	TC	3	6	611182	611187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_020941	TAT	2	6	611188	611193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020941	AC	3	6	611206	611211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_020941	ATCC	2	8	611226	611233	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_020941	CGC	2	6	611240	611245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_020941	CT	3	6	611263	611268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_020941	TCT	2	6	611288	611293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_020941	GAC	2	6	611325	611330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_020941	TAC	2	6	611333	611338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_020941	ATG	2	6	611350	611355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020941	A	6	6	611385	611390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020941	AC	3	6	611458	611463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_020941	CTC	2	6	616599	616604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_020941	A	6	6	616696	616701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020941	CT	3	6	616710	616715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_020941	AG	3	6	616752	616757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020941	A	6	6	616765	616770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020941	GGAA	2	8	616780	616787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020941	A	7	7	616792	616798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1532	NC_020941	TCTTTT	2	12	617778	617789	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1534	NC_020941	ATG	2	6	617792	617797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020941	TTA	2	6	617806	617811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1540	NC_020941	T	7	7	621704	621710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020941	T	6	6	621715	621720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020941	GTT	2	6	621734	621739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020941	T	6	6	621750	621755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1549	NC_020941	A	6	6	624780	624785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020941	AGA	2	6	624793	624798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020941	GATT	2	8	624867	624874	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020941	TTC	2	6	628501	628506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_020941	T	6	6	628526	628531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020941	CCT	2	6	628532	628537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_020941	T	6	6	629151	629156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020941	CT	3	6	629236	629241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1565	NC_020941	A	6	6	633734	633739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020941	CCTG	2	8	633825	633832	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1568	NC_020941	CTCC	2	8	636660	636667	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1569	NC_020941	A	6	6	636668	636673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1573	NC_020941	ATTAA	2	10	637193	637202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020941	A	6	6	637247	637252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1582	NC_020941	A	7	7	645886	645892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1584	NC_020941	GA	3	6	648774	648779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_020941	TCGTC	2	10	650091	650100	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1603	NC_020941	A	7	7	654068	654074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020941	A	7	7	654102	654108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020941	A	6	6	654118	654123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020941	CTC	2	6	654162	654167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1608	NC_020941	ATT	2	6	656251	656256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020941	CA	3	6	656263	656268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_020941	A	6	6	656341	656346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020941	CAGG	2	8	656365	656372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1621	NC_020941	GGA	2	6	662114	662119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020941	A	6	6	663461	663466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020941	C	6	6	663499	663504	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1626	NC_020941	T	6	6	665572	665577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1635	NC_020941	A	6	6	670425	670430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_020941	CT	3	6	670431	670436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1637	NC_020941	ATT	2	6	671154	671159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_020941	AAAT	2	8	671187	671194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_020941	CCT	2	6	671211	671216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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